glosar biologie moleculara

14
Site: USMF "Nicolae Testemitanu" Moodle Portal Curs: Biologie moleculară (BM) Glosar: Glosar A ADN Acid DezoxiriboNucleic. Reprezintă un acid nucleic cu funcția de a păstra, realiza și transmite informația ge vii, cu excepția unor virusuri. De obicei este alcătuit din două catene antiparalele complementare. În celulel iar în cele eucariote - în nucleu, mitocondrii, plastide (la plante) Aminoacil-ARNt-sintetaza Adaptor pentru aminoacizi la ARNt corespunzător. Anticodon O secvență de 3 nucleotide ce determină tipul aminoacidului, transportat ulterior de ARNt, avînd proprietatea codonului din ARNm. Apoptoză Numită și ,,moarte celulară programată'', apoptoza reprezintă procesul de înlăturare a celulelor, a căror fu de celule tinere. Aquaporina Proteină transmembranară, componentă a membranei celulare ce reguleaza fluxu ARN ARN-ul (acidul ribonucleic) este un complex macromolecular ce rezultă din copolimerizarea ribonucleotidelor, monocatenare. El este sintetizat printr-un proces, numittranscripție, și îndeplinește un șir de Suport temporar al informației genetice (ARNm). Matriță pentru sinteza proteinelor (ARNm) Catalizator enzimatic (unele ARNr și ARNsn). Ghid pentru enzime (unele ARNsn, ARNsc, ARNi). Transportator al aminoacizilor (ARNt). Decodificator al codului genetic (ARNt). Parte componentă a ribozomilor (ARNr) ARN-polimeraza II Enzimă localizată în nucleoplasmă care catalizează sinteza precursorilor ARNm și a majorităț

description

termeni din biologia moleculara

Transcript of glosar biologie moleculara

Site:USMF "Nicolae Testemitanu" Moodle PortalCurs:Biologie molecular (BM)Glosar:GlosarAADNAcid DezoxiriboNucleic. Reprezint un acid nucleic cu funcia de a pstra, realiza i transmite informaia genetic. Este prezent n toate organismele vii, cu excepia unor virusuri. De obicei este alctuit din dou catene antiparalele complementare. n celulele procariote se localizeaz n citoplasm, iar n cele eucariote - n nucleu, mitocondrii, plastide (la plante).

Aminoacil-ARNt-sintetazaAdaptor pentru aminoacizi la ARNt corespunztor.

AnticodonO secven de 3nucleotidece determin tipul aminoacidului, transportat ulterior de ARNt, avnd proprietatea de a se mperechea cu cele 3nucleotideale codonului dinARNm.

ApoptozNumit i ,,moarte celular programat'', apoptoza reprezint procesul de nlturare a celulelor, a cror funcie este epuizat, i nlocuirea acestora de celule tinere.

AquaporinaProteintransmembranar, component a membranei celulare ce reguleaza fluxul de apa.

ARNARN-ul (acidul ribonucleic) este un complex macromolecular ce rezult din copolimerizarea ribonucleotidelor, care determin formarea unor lanuri lungi, monocatenare. El este sintetizat printr-un proces, numittranscripie,i ndeplinete un ir de funcii celulare importante : Suport temporar al informaiei genetice (ARNm). Matri pentru sinteza proteinelor (ARNm) Catalizator enzimatic (unele ARNr i ARNsn). Ghid pentru enzime (unele ARNsn, ARNsc, ARNi). Transportator al aminoacizilor (ARNt). Decodificator al codului genetic (ARNt). Parte component a ribozomilor (ARNr)

ARN-polimeraza IIEnzim localizat n nucleoplasm care catalizeaz sinteza precursorilorARNmi a majoritii de ARNsn i microARN.

ARN-precursorForm deARNtranscris de pe catena deADNprin intermediulARN-polimerazei, care conine n moleculintroniiexoni.ARN-precursor reprezintARNmnc nematurizat.

ARNmMolecul deARNcare servete n calitate de matri n procesul detranslaie(biosintez a proteinelor). La procariote se produce printranscripiei poate fi policistronic (conine informaii despre mai multeproteine), la eucariote se produce ca rezultat alprocessing-ului pro-ARNm i este monocistronic (conine informaia despre un singur polipeptid).

ATP-sintetazaEnzim care sintetizeaz ATP din ADP i fosfat anorganic. Pentru sinteza ATP , primete energie de la protonii ce trec prin gradientul electrochimic cum ar fi spaiul intermembranar n matricea mitocondriei.

Bbanda3proteindin membrana eritrocitului,care structureaz canalul anionic de schimb ntre bicarbonat i clorur

BiopolimerPolimer ce se gsete n natur n starea sa natural i face parte din organismele vii (proteine, acizi nucleici, glucide, lipide).

Boxa CAATSecventa consens a promotorului (la eucariote) care controleaza legarea proteinelor de initiere a transcriptiei si eficienta acestui proces.Se afla in pozitia -75.

Boxa GCSecventa consens a promotorului(la eucariote) care intervine in directionarea procesului de transcriptie.Se afla in pozitia -90.

Boxa PribnowSecventa specifica a promotorului la procariote responsabila de initierea denaturarii locale aADN-ului.

Boxa TATASecventa specifica a promotorului (la eucariote) care directioneaza enzimaARN-polimeraza IIspre situsul de initiere al transcriptiei.

CCardiolipinaFosfolipid care se gsete n membrana intern a mitocondriilor, fcnd-o deosebit de impermiabil pentru ioni. Ea este implicat n procesul de fosforilare oxidativ i n transferul de electroni.

CiclineProteine-gardieni ai ciclului celular care controleaz distrugerea complexului stadiului precedent, stimularea evenimentelor perioadei corespunztoare i activarea complexului fazei urmtoare.

Ciclul celularSuccesiunea evenimentelor genetice, biochimice i morfologice desfurate n celul de la ,,naterea'' ei pn la urmtoarea diviziune, specializare sau moarte.

CistronTermen folosit fregvent pentru unitile transcripionale ce conin genele structurale. Astfel, unitile transcripionale la eucariote sunt monocistronice, iar la procariote pot fi monocistronice sau policistronice (in acest caz formeaz operonul)

CitochinezProcesul de diviziune n care se separ masa citoplasmatic n 2 jumti i organitele citoplasmatice n cele 2 celule fiice.

ClatrinaProteinintracelular care reprezint componenta principal a veziculelor endocitare i a celor de secreie, facilitnd procesul de endocitoz i exocitoz.

Cod geneticSistem prin care succesiunea nucleotidelor din molecula deADNdetermin ordinea aminoacizilor nprotein.

CodonUnitate a codului genetic care reprezint un triplet denucleotidedinADNsauARNce codific un aminoacid. Din cei 64 codoni existeni, 61 codific pentru anumii aminoacizi iar 3 snt codoni de STOP informaional.

Codon AUGCodonul universal de iniiere .

Codon STOPCodoncare nu codific pentru ARNt. Exist 3 codoni STOP : UAA, UAG, UGA.

ColesterolLipid, component a membranei celulare ce asigura elasticitatea si rezistenta mecanica a celulei.

Conjugare bacterianaTransferul materialului genetic de la o bacterie donatoare la una receptoare printr-un proces de imperechere, ce se realizeaza prin contact direct prin intermediul pililor.

Control negativMecanism de inactivare a genelor cu ajutorul uneiproteinerepresor.ARN-polimeraza nu este capabil s interacioneze cupromotoruln cazul dac acesta interacioneaz cu represorul. Represorul poate fi nlturat cu ajutorul inductorului. Controlul negativ poate fi prin inducie sau represie.

Control pozitivMecanism de activare a genelor cu ajutorul uneiproteineactivator.Transcripiaeste posibil n cazil dac activatorul este unit lapromotor. Controlul pozitiv poate fi prin inducie sau represie.

CromatidUna din cele dou jumti longitudionale ale cromozomului, unite prin intermediul centromerului.

Crossing-overSchimbul reciproc de fragmente ntre cromozomii omologi.

DDesminaProteinfibrilar a filamentelor intermediare, caracteristic fibrelor musculare i localizat n sarcomere aproape de linia Z.

DistrofinaProteinacitoplasmatic, specifica a fibrelor musculare, care asigur conexiunea celulelor la matricea extracelular prin membrana plasmatic.

EEndonucleazaNucleazacare hidrolizeaza legaturile fosfodiesterice din mijlocul lantului polinucleotidic.

EnhancerO mic secven deADNcare se poate lega cu factori detranscripie, mrind nivelul detranscripiea genei sau a unui grup de gene.

ExonSecven codificatoare a genei. Exonul se transcrie, este prezent nARNprecursor, nARNmesager i se regsete n secvena de aminoacizi a proteinei.

ExonucleazaEste o nucleaz care hidrolizeaz legturile fosfodiesterice dintre nucleotidele, ncepnd de la unul dintre capetele lanului polinucleotidic.

Expresie genicaProcesul prin care informatia genetica aADN-ului este transcrisa peARNsi apoi translata inproteine.

FFactor de transcripieProteincare interacioneaz cuADN-ul, prin activarea, inhibarea (total sau parial) sau controlul procesului detranscripie.

Factor de transcripie generalProteince recunoate secvenele consens ale promotorului, punctul de iniiere al transcripiei (+1) i interacioneaz cuARN-polimeraza II.

Factor de transcripie specialProteinimplicat n activarea unor gene care se exprim n anumite esuturi, la anumite etape de dezvoltare sau n anumite condiii; ea recunoate secvene specifice ale promotorilor genelor respective.

Familie de geneGrup de gene care auexoniasemntori , codificproteinecu secven i proprieti similare i deriv de la ogenancestral.

Faz de lecturOrdinea codonilor n molecula deARNm. n fiecare moleculARNmexist 3 faze de lectur.

FecundaieProcesul de contopire a dou celule sexuale diferite cu cte 23 cromozomi, n rezultatul cruia se formeaz zigotul cu 46 cromozomi.

Folding-ul proteineiProces fizic prin care o polipeptid se pliaz n structura sa caracteristic tridimensional. Procesul respectiv este numit i ,,plierea proteinei''.

Fragment OkazakiFragment care se sintetizeaz n direcia 5-3 de pe catena ntrziat. Lungimea fragmentelor Okazaki este de 1000-2000 denucleotidela procariote i de 100-200 denucleotidela eucariote.

GGametCelul sexual ce conine un set haploid de cromozomi i particip n procesul de fecundaie.

GametogenezProcesul de formare a celulelor sexuale.

GenReprezint o unitate purttoare a ereditii n organismele vii, fiind un fragment din molecula de ADN, ea conine informaia genetic despre sinteza uneiproteinesau a unei molecule deARN.

Gen structuralTip degen, funcia creia const n codificareaARN-ului mesager, tradus n lanuri polipeptidice specifice.

Gene de clasa IGene ce codifica ARNr 5,8S,18S,28S si sunt transcrise deARN-polimeraza I.

Gene de clasa IIGene ce codifica sinteza lanturilor polipeptidice si sunt transcrise deARN-polimeraza II.

Gene de clasa IIIGene ce codifica ARNr 5S si ARNt si sunt transcrise deARN-polimeraza III.

HH+-ATP-azaProteinacare asigura transportul activ al ionilor de hidrogen. Se mai numete pomp protonic, pomp de hidrogen, ATP-az dependent de H+

HelicazaEnzima care denatureazADN-ulprin ruperea legturilor de hidrogen ntre bazele azotate, facnd posibile multe procese vitale ca: replicarea,transcripia, reparaia.

HeterofagieDezintegrarea enzimatic a substanelor captate prin endocitoz ( bacterii, virui, celule alterate sau fragmentele lor ).

HidrolazEnzim ce catalizeaz hidroliza unei legturi chimice.

HistonProteinbazic ce conine peste 22% aminoacizi bazici i stabilizeaz dublul helix alADN-ului, inducnd o structur teriar.

HomeostazieProprietatea unui sistem de a menine un echilibru static al condiiilor iniiale.

IInterfazEtap a ciclului celular n care celula desfoar o susinut activitate biosintetic, asigurnd condiiile necesare realizrii diviziunii celulare. Ea include 3 perioade: G1(presintetic), S (sintetic)i G2(postsintetic) .

IntronReprezint o secven necodificatoare a genei. Intronul se transcrie, este prezent nARNprecursor dar nu este prezent nARNmesager. Intronii sunt nlturai dinARNprecursor prin procesul numitspicing.

IonoforMolecul mic, hidrofob, sintetizat de microorganisme, ce se utilizeaz cu scopul de a crete permeabilitatea membranelor pentru ioni.

KKinazeEnzime din grupul transferazelor, care asigura asigur transferul gruprilor fosfat de la un donor macroergic (de ex., ATP) la o alt molecul, numit substrat, printr-un proces numit fosforilare.

KinetocorComplex alctuit dinADNiproteinede care se vor ataa filamentele fusului de diviziune.

LLigandReprezint un atom, ion, sau o parte a moleculei capabil s se uneasc cu un receptor.

LipozomVezicule sferice formate de anumite structuri cum ar fi: dublul strat de lipide sau glicolipide, care au tendina de a se nchide.

LTRSecvene repetitive lungi, localizate la capetele retrotranspozonilor care asigur inserarea fragmentelor.

MMezozomiInvaginri sau structuri membranare veziculare sau veziculo-membranare a bacteriilor Gram-pozitive. Se consider c sunt implicai n sinteza ATP.

MiceleStructuri globulare formate de ctre moleculele lipidice n cazul emulsiilor. Aceste molecule avnd un cap hidrofili o coad hidrofob se aranjeaz tot timpul cu regiunea hidrofil ndreptat spre ap, iar cozile hidrofobe se ndeprteaz de ea, formnd astfel micele.

MitozEtap a ciclului celular n care se realizeaz procesul de distribuire egal a materialului genetic de la celula ,,mam'' la 2 celule ,,fiice''.

NNucleazaEnzime care hidrolizeaza legaturile fosfodiesterice din lantul polinucleotidic. Pot fi:n funcie de tipul moleculei hidrolizate: ADN-az ARN-azan funcie de locul scindrii legturilor: endonucleaze(scindeaz legturile n interiorul moleculei) exonucleaze (scindeaz legturile ncepnd de la unul dintre capete)

NucleoidCompartiment al celulei procariote ce reprezint materialul genetic principal.ADN-ulnucleoidului are o form circular nchis.

NucleolinaFosfoproteina implicata in biogeneza ribozomilor, localizata in regiunea fibrilara a nucleolului.

NucleoporinaProtein, component principal a complexului porului nuclear.

NucleotidCompus format n urma adugrii acidului fosforic la unnucleozid. Nucleotidul este monomerul acizilor nucleici ce conine o pentoz ( riboza-laARNi dezoxiriboza-laADN), o baz azotat i una sau mai multe grupri fosfat iar denumirea lui provine de la baza azotat i numrul de resturi de acid fosforic. Unirea lor prin legturi fosfodiesterice determin formarea structurii primare a acizilor nucleici.

NucleozidCompus format n urma combinrii unei baze azotate purinic ( A, G ) sau pirimidinic (C, T- caracteristic pentruADN, U - caracteristic pentruARN) cu riboza sau cu dezoxiriboza.

NucleozomStructur ce se formeaz n urma rsuciriiADN-ului n jurul unui miez alctuit dinproteinebazice, numite histone. Nucleozomul reprezint structura teriar aADN-ului.

OOperonReprezint o unitate funcional a genomului la procariote, care conine un grup degene structuraleaflate sub controlul unui singurpromotor/ terminator. Zona promotorului conine o secven, numit operator, care intercaioneaz cu proteinele reglatoare. Astfel toate genele unui operon se activeaz / dezactiveaz simultan.

PPalindromPalindromii reprezint succesiuni denucleotideinversate, care au proprietatea de a se uni complementar pe aceiai caten, formnd agrafe'' sau bucle n moleculele monocatenare deARNsauADNi structuri n form de cruce n moleculele bicatenare deADN.

PeptidoglicanNumit i ,,murein'', peptidoglicanul este un compus alctuit dintr-o parte glucidic i o parte peptidic. El formeaz peretele celular al bacteriilor Gram pozitive i Gram negative, asigurnd att forma celulei ct i o protecie mecanic i fizic.

PermeazProteinspecific, asemntoare fermenilor, ce asigur transportul substanelor n cadrul difuziunii facilitate. O permeaz este capabil s transporte un singur tip de molecule sau o anumit familie de molecule.

PeroxidazaEnzima care catalizeaza catalizeaz reaciile chimice de tipul:ROOR' + donor de electroni (2 e-) + 2H+ ROH + R'OH

PorinaProteince se conine pe membrana extern a mitocondriilor i asigur transportul unor molecule mici, inclusiv a unorproteinecu greutatea molecular mic.

PrimerSecven de 11-12 ribonucleotide sintetizate de primaz (enzim cu activitateARN-polimerazic care iniiaz replicareaADNn acest mod).

PrioniiReprezint nite secvene de peste 250 aminoacizi, dar spre deosebire de proteinele celulare obinuite, care se sintetizeaz pe bazaARNm, pentru prioni nu este caracteristic existena unorARNmcorespunztori, ei fiind rezultatul scindrii incomplete a proteinelor celulare.

ProcesareSetul de transformri ale moleculei, n rezultatul crora molecula obine configuraia funcional.

Processing-ul ARNProces numit i maturizareaARN,processing-ul reprezint ansamblu reaciilor de transformare aARNprecursor, ce se desfoar n nucleu.Processing-ul pro-ARNminclude CAP-area,splicing-ul, i poliadenilarea.

PromotorSecven obligatorie denucleotidealeADN-ului, care indic nceputul procesului de transcriere a genei sau a setului de gene. La procariote este recunoscut deARN-polimeraz direct, iar la eucariote interacioneaz cuproteinespecifice numite factori detranscripie, la care se ataeazARN-polimeraza corespunztoare.

ProteinaMacromolecul alctuit din mai muli aminoacizi unii prin legturi peptidice. Asigur funcionarea celulelor

RRecombinare geneticFenomenul producerii unor combinaii genetice noi prin rearanjarea materialului genetic cuprins ntre dou uniti genetice diferite.

ReparaieProces molecular de restabilire a leziunilor din moleculele deADNcare asigur stabilitatea materialului genetic.

ReplicareProces molecular care asigur dublarea informaiei genetice prin copierea exact a moleculelor deADN.

RepliconSegment deADNcapabil de replicare independent.

ReplisomComplex proteic care recunoate punctul de origine a replicrii i o iniiaz.

RevertazaCunoscut i sub denumirea de,,ADN-polimerazARN-dependent,, revertaza este o enzim ce catalizeaz sintezaADN-ului de pe matriaARN-ului n procesul numittranscripieinvers.

RiboforinaProteinprezent doar n membrana reticolului endoplasmatic rugos care asigur asocierea ribozomilor.

SSecventa liderSecventa scurta de citeva zeci denucleotidecare se afla la capatul 5' al primuluiexonavind rolul de initiere a translatiei si este urmata de codonul universal de initiere a translatiei-ATG.

SilencerCunoscut i sub denumirea de ,,atenuator,, este o secven deADNsituat n amonte depromotorcare reduce i blocheaztranscripiaunor gene.

SimportTransportarea a dou sau mai multe substane, prin intermediul unei singureproteinetransportatoare n aceiai direcie.

Situs ACentru catalitic al ribozomilor responsabil de unirea complexului aminoacil-ARNt.

Situs PCentru catalitic al ribozomilor responsabil de unirea peptidil-ARNt.

SpacieriSecvente neinformationale aleADN-ului cu rol de separare a genelor.

SpectrinaProteina citoscheletului care acoper partea interioar a membranei plasmatice la multe tipuri de celule. Ea are form pentagonal sau hexagonal, formeaz o reea structural i joac un rol important n asigurarea stabilitii celulelor.

SplicesomComplex enzimatic implicat n procesul de maturizare aARNm, el asigur nlturarea intronilor dinARNmprecursor i la unirea exonilor.

SplicingEtap aprocessing-ului, proces de nlturare a intronilor dinARNprecursor i de unire a exonilor, care are loc n nucleu, cu participarea unui complex enzimatic numitsplicesom. n cazul pro-ARNm, urma acestui proces se formeaz unARNmcare fiind transferat n citoplasm va servi drept matri pentru sinteza proteinei.

Splicing alternativTip desplicingcare const n selecia exonilor i eliminarea difereniat a intronilor. n rezultatul acestui proces se pot obine mai multe variante deARNmde pe unARNmprecursor.

TTelomerazaEnzima care asigura extensia telomerilor i intervine n finalizarea relicaieiADN-ului la eucariote.

Transcript primarMolecul deARNcare dup sintez nu a suferit nc nici o modificare cum ar fi metilarea, nlturarea unor secvene necodificatoare etc. Se mai numete i pro-ARNsauARNprecursor.

TranscripieProces molecular de copiere a informaiei genetice codificate nADNsub forma unei secvene complementare denucleotide, ntr-o molecul deARNm.

Transformare geneticaIntroducerea moleculelor deADNstrain in celula-gazda.

TranslaieProces molecular de decodificare a secvenei polinucleotidice dinARNmprin sinteza lanurilor polipeptidice de aminoacizi.

TranspozonElement genetic mobil care migrnd de sine stttor ocup o poziie nou n genom.

TubulinaProteincare asigur formarea microtubulilor. n microtubuli i n citoplasma celulei ea se gsete sub forma unui dimer, alctuit din dou structuri (alfa tubulin i beta-tubulin).

VVirusVirusul reprezint o form acelular de via care este format, din punct de vedere structural, dintr-o capsul proteic, numitcapsid,n interiorul creia se conine o molecul deADNsauARNmonocatenar sau bicatenar.