Exceptii de la universalitatea codului genetic-Mitocondrii Gene mitocondriale La animale si microorganisme codonul UGA codifica triptofan Experiment: ARNm mitocondrial impreuna cu celelalte componente ale complexului citozolic de sinteza proteica(aminoacizi, enzime, ARNt, ribozomi) acesta nu va fi translat in proteine, deoarece codonul UGA codifica triptofan si nu oprirea sintezei lantului polipeptidic. Sinteza proteica se opreste acolo unde ar fi trebuit sa fie inserat aa. trp. La majoritatea mitocondriilor animale codonul AUA codifica metionina si nu izoleucina; Toate vertebratele au mitocondrii ce folosesc codonii AGA(arginina) si AGG(arginina) drept codoni terminatori ai lantului polipeptidic; Mitocondriile de drojdie folosesc toti codonii care incep cu CU pentru desemnarea treoninei in locul leucinei(CUU, CUC, CUA, CUG).

Exceptii de la universalitatea codului genetic-Aminoacizii nestandardizati Aminoacizi nestandardizati Marea majoritate a proteinelor este asamblata din cei 20 de aminoacizi, chiar daca unii pot fi alterati prin fosforilare uneori; Cu toate acestea, au fost identificate doua cazuri in care un aminoacid care nu face parte dintre cei douazeci este inserat printr-un ARNt in lantul polipeptidic: Selenocisteina(aa 21) Acest aminoacid este codificat prin UGA. UGA este utilizat si ca terminator al lantului, dar complexul ribozomal este capabil sa discearna cand trebuie folosit ca selenocisteina, respectiv secventa terminator. Aceasta utilizare diferita a codonului a fost semnalata la Archea, eubacteria. La om s-au evidentiat 25 de proteine diferite continand seleniu. Pirolizina(aa 22) Lacateva specii de Archea si de bacterii acest aminoacid este codificat prin UAG, dar poate actiona ca un codon stop si opreste si sinteza lantului proteic.