48737412-C11-Replicarea-ADN
-
Upload
oana-andreea -
Category
Documents
-
view
84 -
download
0
Transcript of 48737412-C11-Replicarea-ADN
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 1/17
ReplicareaReplicarea ADNADN ReprezintReprezintă ă p procesulrocesul dede copierecopiere fidelfidelăă aa succesiuniisuccesiunii de nucleotidede nucleotide dindin
moleculelemoleculele de ADN,de ADN, decideci aa informainformaţţieiiei geneticegenetice,, îînn scopulscopul transmiteriitransmiterii
acesteiaacesteia dede--aa lungullungul generageneraţţiilor iilor celularecelulare..
ProcesulProcesul sese desf desf ăăşoar ă înşoar ă în faza Sfaza S a ciclului celulara ciclului celular..
Este oEste o reacreacţţieie dede polimerizare polimerizare, are loc cu o, are loc cu o ratratăă de 500 nucleotide/de 500 nucleotide/secundsecundăă
lala bacterii bacterii şşii de 50 nucleotide/de 50 nucleotide/secundsecundăă lala celulelecelulele dede mamiferemamifere.. DurataDurata fazei S fazei S este de aproximativ 8 ore rezultatul fiind 2 cromozomieste de aproximativ 8 ore rezultatul fiind 2 cromozomi
perfect identici cu cel de origine, uniţi prin intermediul centr perfect identici cu cel de origine, uniţi prin intermediul centr omerului pâomerului pânnă ă în metafaza mitozei.în metafaza mitozei.
Duplicarea cromozomilor implicDuplicarea cromozomilor implică ă atât r atât r eplicarea moleculei lungi de ADN aeplicarea moleculei lungi de ADN a
fiecfiecăăruia, câtruia, cât şşi asamblarea la ADNi asamblarea la ADN--ul nou format a noi proteineul nou format a noi proteinecromozomiale, ceea ce duce la formarea cromatinei.cromozomiale, ceea ce duce la formarea cromatinei. VitezaViteza şşii acurateacurateţţeaea suntsunt asigurateasigurate de o "de o "mamaşşininăă replicativreplicativăă"" complexcomplexăă,,
reprezentatreprezentatăă de un complexde un complex multienzimaticmultienzimatic..
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 2/17
FidelitateaFidelitatea replicareplicaţţieiiei ADNADN Secvenţa de nucleotide a ADN-ului (sau a unei secvenţe de ADN) este
duplicată prin împerecherea complementar ă de baze (A cu T şi G cu C),într-o secvenţă nucleotidică complementar ă.
Procesul presupune recunoaşterea fiecărui nucleotid şi implică în modobligatoriu separarea tranzitorie a celor două lanţuri complementare aledublului helix de ADN, astfel ca grupările acceptoare şi donoare alefiecărei legături de hidrogen ale bazelor azotate să apar ă expuse pentruîmperechere.
Procesul este catalizat de o enzimă de polimerizare a nucleotidelor denumită ADN-polimeraza.
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 3/17
ADNADN--polimerazapolimeraza catalizeazcatalizeazăă adiadiţţiaia ""treapttreaptăă cucu treapttreaptăă" a" adezoxiribonucleotidelordezoxiribonucleotidelor, la, la capcapăătultul 3'3'--OH alOH al unuiunui lanlanţţ polinucleotidicpolinucleotidicpreexistentpreexistent ((lanlanţţulul primer primer ) care se) care se aflaflăă î î mperecheatmperecheat lala lanlanţţulul matrimatriţţăă..
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 4/17
ÎÎnn timpultimpul replicareplicaţţieiiei,, fiecarefiecare catencatenăă vecheveche dede
ADNADN serveserveşştete caca matrimatriţţăă pentrupentru sintezasinteza uneiunei
catenecatene noinoi..AstfelAstfel,, secvensecvenţţaa ADN de oADN de o lungimelungime enormenormăă
esteeste replicatreplicatăă ""semiconservativsemiconservativ" de" de ccăătretre
ADNADN--polimerazpolimerazăă..
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 5/17
"Furca"Furca replicativreplicativăă"" Denumită astfel deoarece regiunea aflată în replicare ce se mişcă de-a
lungul helixului de ADN parental are o formă de Y.
La nivelul furcii replicative, helixul ambelor molecule noi de ADN estesintetizat de un complex enzimatic extrem de sofisticat care conţine şiADN-polimeraza.
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 6/17
IniIniţţiereaierea replicreplicăăriirii Shortcut to replication.lnk
Furca replicativă este iniţiată la nivelul unor secvenţe speciale de ADNnumite origini origini dede replicarereplicare;
Viteza de deplasare a furcii replicative este de 50 nucleotide/secundă;
Pe cromozomii eucarioţi există mai multe origini de replicare care se mişcă
simultan;
Furcile replicative funcţ
ionează
grupat fiind activate simultan câte 20-80 deorigini ce constituie unit unit ăă ţ i replicative ţ i replicative;
În interiorul unei unităţi replicative, fiecare origine de replicare esteseparată de cealaltă printr-un spaţiu de 30.000-300.000 de nucleotide;
La fiecare origine de replicare se formează câte două furci de replicare carese mişcă în direcţii opuse, până ce se întâlnesc cu furca de replicare a originiide replicare învecinate care vine din direcţie opusă;
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 7/17
ReplicareaReplicarea pepe lanlanţţulul ""tardivtardiv"" ADN-polimeraza are nevoie pe lanţul tardiv, din timp în timp, pe măsur ă ce
furca se desface, de câte un capăt 3'-OH nou; Sinteza se face în salturi, la fiecare salt fiind necesar un nou primer ARN
sintetizat de o ARN-primază;
Primerii ARN sunt secvenţe lungi de 10 ribonucleotide sintetizate la
intervale regulate pe lanţul tardiv; În momentul în care ADN-polimeraza întâlneşte capătul 5' al primerului
ARN din fragmentul anterior intervine o RN-ază ce rupe fragmentele deARN primer iar spaţiile r ămase goale sunt ocupate de nucleotidele
corespunzătoare; Ultima etapă este realizată de o ADN-ligază ce sudează capetele
fragmentelor Okazaki;
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 8/17
ProteineleProteinele de lade la nivelulnivelul furciifurcii replicativereplicative Proteinele helix-destabilizatoare, numite şi proteine SSB ("single-strand
DNA-binding proteins"), se leagă la catenele de ADN desf ăcute din helix,
f ăr ă a acoperi bazele. Ele stabilizează forma desf ăşurată a monocatenelor.
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 9/17
CorectareaCorectarea erorilorerorilor dede
replicarereplicare Fidelitatea copierii ADN în cursul replicării –
înaltă(max. 1 eroare/10 );
Formele tautomerice se pot împerechea greşit; Ex:forma tautomerică a C se împerechează cu A în loc deG, ceea ce poate cauza o mutaţie;
ADN-polimeraza începe sinteza unui polinucleotid dela capătul 3'-OH al unui primer primer ce este împerecheat cuo secvenţă complementar ă de pe lanţul matriţă ;
Un nucleotid adăugat greşit (neîmperecheat) nu poatereprezenta capăt de continuare a sintezei fiind “tăiat”de o subunitate a ADN-polimerazei ce are astfel oactivitate 3'3'→5'5' exonucleazicexonucleazicăă ;
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 10/17
ProteineleProteinele de lade la nivelulnivelul furciifurcii replicativereplicative
ADN ADN --helicazahelicaza, hidrolizează ATP
pentru a se mişca rapid de-a lungulunei monocatene de ADN;
ADN ADN --topoizomerazeletopoizomerazele funcţionează
ca "nucleaze reversibile“ ce determinăiniţial ruperea dublei catene de ADN"în amonte" de furca replicativă,slă bind tensiunea care s-a creat înmoleculă şi apoi legarea la loc acapetelor libere;
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 11/17
Genele şi mecanismele de reparare a erorilor de replicare
Etapele de la apariţia unei leziuni în secvenţa ADN: recunoaştere, evaluare (CP), răspuns (R, A);
Căile mecanismelor celulare de reparare ADN: excizia bazelor (BER), excizia nucleotidelor (NER),excizarea mononucleotidică a bazelor împerecheate greşit (MMR);
R ăspunsurile la apariţia unei leziuni în secvenţa ADN.
A. Post-recunoaştere şi evaluare are loc sinteza translezională a ADN.
B. Repararea implică excizia bazelor şi sinteza în condiţiileprezenţei ADN-ului dublucatenar. Bazele împerecheate greşit
- rezultate în urma erorilor din timpul replicării ADN, suntexcizate ca mononucleotide. O baz ă degradat ă este excizată fieindividual (reparare prin excizia bazelor) sau în cadrul uneisecvenţe oligonucleotidice (reparare prin excizie
oligonucleotidică).
C. Celula dispune de o reţea complexă de semnalizare ceblochează ciclul celular, având în permanenţă la dispoziţieopţiunea morţii celulare programate. Imagine preluată dinarticolul cu titlul: Defying death after DNA damage (Rich etal., 2000a) .
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 12/17
Genele şi mecanismele de reparare a erorilor de replicare
Proteinele implicateProteinele implicate î î n mecanismul MMR de reparare a erorilor n mecanismul MMR de reparare a erorilor (partea I) (partea I) ..
ProteineProteine FuncFuncţţiiii
MSH2MSH2--MSH6 (MSH6 (MutSMutSαα)) ReparareaRepararea erorilor erorilor dede î î mperecheremperechere:: eroareeroare singular singular ăă de tipde tip bazbazăă--bazbazăă şşii IDL de 1IDL de 1--22bazebaze
MSH2MSH2--MSH3 (MSH3 (MutSMutS β β )) ReparareaRepararea unor unor IDLIDL singularesingulare şşii unor unor IDLIDL--uriuri ≥≥22 bazebaze.. Ac Acţţiuneiune par par ţţialial suprapussuprapusăă
heterodimeruluiheterodimerului Msh2Msh2--Msh6Msh6
MLH1MLH1--PMS2PMS2
((MutLMutLαα))
Mediator alMediator al evenimentelor evenimentelor : de la: de la ataataşşareaarea lala locusullocusul î î mperecheriimperecherii gregreşşiteite aa
omologilor omologilor
MutSMutS
pâpâ
nnăă
lala
sintezasinteza
dede
repararereparare
a ADN.a ADN.
Are Are funcfuncţţiiii şşii î î nn recombinarearecombinarea î î nn meiozmeiozăă;;
MLH1MLH1--MLH3MLH3
((MutLMutLγγ))
Repar Repar ăă:: erorileerorile singularesingulare de tipde tip bazbazăă--bazbazăă şşii IDL de 1IDL de 1--22 bazebaze fiindfiind unun sistemsistem dede
rezervrezervăă pentrupentru MutLMutLαα..
PrincipalaPrincipala funcfuncţţieie esteeste legatlegatăă dede recombinarearecombinarea î î nn meiozmeiozăă..
MSH4MSH4--MSH5MSH5 ReparareaRepararea rupturilor rupturilor ADN ADN--uluiului dubludublu--catenar catenar î î nn meiozmeiozăă şşii mitozmitozăă
EXO1EXO1 ExciziaExcizia ADN ADN dubludublu--catenar catenar
ANKRD17ANKRD17 SupraexprimareaSupraexprimarea ANKRD17 ANKRD17 promoveazpromoveazăă intrareaintrarea î î nn fazafaza S;S;
DepleDepleţţiaia sasa prinprin siRNAsiRNA::
-- blocheazblocheazăă progresiaprogresia cicluluiciclului celular celular ;;
-- conduce la supraconduce la supra--expresiaexpresia p53p53 şşii p21;p21;
-- diminueazdiminueazăă nivelulnivelul dede î î ncncăărcarercare alal proteinelor proteinelor Cdc6Cdc6 şşii PCNAPCNA pepe moleculamolecula ADN ADNsugerândsugerând implicareaimplicarea sasa directdirectăă î î nn mecanismulmecanismul replicreplicăăriirii..
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 13/17
Genele şi mecanismele de reparare a erorilor de replicare
Proteinele implicateProteinele implicate î î n mecanismul MMR de reparare a erorilor n mecanismul MMR de reparare a erorilor (partea II) (partea II) ..
ProteineProteine FuncFuncţţiiii
MLH1MLH1--MLH2MLH2
(hPMS1) ((hPMS1) (MutLMutL β β ))
LaLa omom nunu sese cunoacunoaşştete funcfuncţţiaia heterodimeruluiheterodimerului..
ComplexulComplexul RFCRFC Î Î ncarcncarcăă PCNA;PCNA;
ModuleazModuleazăă polaritateapolaritatea excizieiexciziei
PCNAPCNA InteracInteracţţioneazioneazăă cucu omologiiomologii MutSMutS andand MutLMutL;;
RecrutezRecrutezăă proteineleproteinele MMR la MM;MMR la MM; Augumenteaz Augumenteazăă specificitateaspecificitatea dede legarelegare la MM a Msh2la MM a Msh2--Msh6;Msh6;
ParticipParticipăă lala excizieexcizie şşii probabilprobabil lala semnalizaresemnalizare;;
ParticipParticipăă lala sintezasinteza dede repararereparare a ADN.a ADN.
3_ 3_ exoexo aa PolPol δδ ExciziaExcizia ADN mono ADN mono--catenar catenar
3_ 3_ exoexo aa PolPol εε Mutator Mutator sinergicsinergic cu Exo1 mutantcu Exo1 mutant
ADN ADN polpol δδ SintezaSinteza dede repararereparare exactexactăă a ADNa ADN
RPARPA ParticipParticipăă lala excizieexcizie şşii lala sintezasinteza ADN ADN
ADN ADN ligazligazăă SigileazSigileazăă moleculamolecula ADN ADN prinprin formareaformarea postpost--sinteticsinteticăă aa leglegăăturilor turilor fosfofosfo--
diestericediesterice
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 14/17
Genele şi mecanismele de reparare a erorilor de replicare
Principalii heterodimeri implicaţi în mecanismul MMR. A. Compoziţia
heterodimerilor MutSα şi MutSβ. B. Compoziţia heterodimerilorMutLα şi MutSγ.
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 15/17
CAP.2. GENETICA SOMATICĂ A PROCESELOR MALIGNE COLORECTALE
2.7 Genele şi mecanismele de reparare a erorilor de replicare
Sistemul MMR uman reconstruit - etapele procesului de reparare.MutSα (sau MutSβ) legată la locusul unde s-a produs eroarea de tip MM(triunghiul roşu) recrutează MutLα. Acest complex suferă o schimbare
conformaţională indusă de ATP, rezultatul fiind deplasarea de la locusulMM.
(a) Complexul ce se deplasează în direcţia 5' întâlneşte RFC legat la capătul 5'al catenei întrerupte. Ulterior desprinde RFC de pe ADN şi încarcă EXO1.Exonucleaza activată începe degradarea catenei în direcţia 5'→3', monocatenarămasă fiind stabilizată de RPA. După înlăturarea MM, EXO1 nu mai estestimulată de MutSα şi este inhibată intens de MutLα. ADN polimeraza δ este
încărcată la capătul 5' al discontinuităţii iniţiale unde se află PCNA. Acestcomplex participă la sinteza de reparare, fisura rămasă între fragmente fiindreparată de ADN ligază.
(b) Complexul ce se deplasează în direcţia 3' întâlneşte molecula PCNA legată la capătul 3' al catenei întrerupte. Recrutarea EXO1 conduce la degradareacatenei dintre discontinuitatea originală şi MM, posibil prin câteva încărcări
repetate ale EXO1. RFC este legat la capătul 5' al discontinuităţii perveninddegradarea catenei (la distanţă de MM). După înlăturarea MM activitateaEXO1 este inhibată prin legarea sa de RPA şi MutLα, secvenţa lipsă fiindsintetizată de ADN polimeraza δ şi sigilată de ADN ligaza care finalizează procesul de reparare. Imagine preluată din: The multifaceted mismatch-repair
system. Jiricny J. Nat Rev Mol Cell Biol. 2006 May;7(5):335-46.
5/15/2018 48737412-C11-Replicarea-ADN - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/48737412-c11-replicarea-adn 16/17
Asamblarea histonelor pe parcursulAsamblarea histonelor pe parcursulprocesuluiprocesului dede replicarereplicare
La eucariote ADN-ul este replicat în starea sa structurată sub formă decromatină, deci complexat cu proteinele histonice.
Majoritatea organismelor posedă copii multiple ale fiecărei genehistonice(histonele fiind sintetizate aproape exclusiv în faza S a
ciclului celular);
Ipoteză: în momentul când furca replicativă ajunge la nivelulnucleozomului, se presupune că acesta se desface în doi "semi-nucleozomi" permiţând astfel ADN-polimerazei să copieze lanţuldesf ăcut;