2 Org Mat Genetic

download 2 Org Mat Genetic

of 44

Transcript of 2 Org Mat Genetic

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    1/44

    ORGANIZAREA

    MATERIALULUI GENETIC

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    2/44

    Din punct de vedere funcional se disting treiniveluri de organizare a materialului genetic:

    -genic

    -cromozomial

    -genomic

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    3/44

    STRUCTURA GENOMULUI UMAN

    GUGU = un genom nuclear(complex, 99,5 !D"# $

    un genom mitocondrial(simplu %i mic, &,5#'

    U'') *!+*

    5'&&& gene

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    4/44

    *n genomul uman exist mai multe tipuri de !D", diferite prin repetiia secvenelornucleotidice:

    . !D" nerepetitiv,(/ este alctuit din secvene unice per genomla nivelulcromozomilor se gaseste in 0enzile eucromatice, la nivel genic se gaseste in exoni

    . !D" moderat repetitiv(& # este alctuit din secvene scurte repetatede zeci i sutede miide ori %i dispersate1n genom' 2e gaseste in:

    3 elemente retrotranspoza0ile din clasa LINE-elemente lungi de spaiere3 elementele SINE- elemente mici de spatiere3 gene care codifica !4"r si !4"t

    . !D"nalt repetitiv(& din genom# este alctuit din secvene foarte scurterepetate ntandem(#, de milioanede ori6 ele nu sunt transcrise.2e clasifica in:

    3 !D" satelit din regiuni 7eterocromatice, pericentromerice si la nivelul telomerelor3 !D" minisatelit cuprinde secvente polimorfe si sunt localizate la nivelul telomerelor3 !D" microsatelit este reprezentat de numarul repetarilor intr-un anumit locus si cel

    mai 0ine caracterizat este cromozomul 8'

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    5/44

    Caracteri!tici Genom n"clear Genom mitocondrial

    rime && 0 /,/ 0

    "umr de molecule de !D"diferite

    (la celulele ;;# sau < (lacelulele ;8#

    molecul circular de !D"

    !socierea cu proteine ai multe clase de 7istone %i

    proteine ne7istonice

    "easociat cu proteine

    >rocentul de !D" codant & 9?

    "umr de gene 5'&&& gene ?gene: gene structurale, gene !4"t si gene !4"r

    *ntroni >rezeni 1n cele mai multe gene !0seni

    @reditate endeliana pentru genele de peautosomi %i cromosomul ;6paternal pentru secvenele depe 8

    @xclusiv matern

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    6/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    7/44

    . *n cromozomiieucariotelor, !D"-ul reprezinta -/ , !4" -ul

    - iarproteinele7istonice si non7istonice /A -?'

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    8/44

    B*2C"@@

    H1 - bogata inH1 - bogata in

    lizinalizina

    H2A - bogata inH2A - bogata in

    leucinaleucina

    H2B - bogata inH2B - bogata inserinaserina

    H3 - bogata inH3 - bogata in

    arginina si cisteinaarginina si cisteina

    H4 - bogata inH4 - bogata in

    argininaarginina

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    9/44

    . Bistonei#$% (numit %i B5#care lipse%te 1n celulele care sedivid %i apare 1n celuleledifereniate

    . Bistona #&AZ,cu rol important1n reglarea transcripiei'

    . E@">-! este o protein1nrudit cu B care are rolmaFor 1n activitatecentromerilor'

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    10/44

    "" B*2C"@@

    . BG 7ig7 mo0ilitHgroupI

    . 2!4s ( scaffoldassociated regions#'

    'NA

    #MG()o* domain

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    11/44

    E4!C*"!

    . +rezinta dierite grade de conden!are !i !e prezinta!") do"a tip"ri moro"nctionale di!tincte -e"cromatina !i .eterocromatina / cla!iicare ac"ta

    de E0#eitz in $1&230

    #eterocromatina

    . e!te de do"a el"ri - con!tit"tiva !i ac"ltativa

    / cla!iicare ac"ta de S04ro5n in $16730

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    12/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    13/44

    Caracteri!tici EUCROMATINA #ETEROCROMATINA

    Eondensare )in dispersat >uternic condensat

    Eompoziie c7imic >redomin p'0' E - G6!D" nerepetitiv6proteine ne7istonice

    >redomin p'0' ! - C6!D" repetitiv6 proteine7istonice

    Eolorare 2la0 *ntens

    !ctivitate genetic !ctiv *nactiv

    4eplicare 1n faza 2 >recoce Cardiv

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    14/44

    . #eterocromatin8 con!tit"tiv8

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    15/44

    #eterocromatin8

    ac"ltativ8

    ( ex cel mai tipic 1lconstituie cromatinasexual

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    16/44

    Heterocromatina

    Eucromatina

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    17/44

    "UE@JU

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    18/44

    . N"cleozom"l contine cantitati apro*imativ egale deAN' !i .i!tone0 Ma!a molec"lara a n"cleo!om"l"ie!te de cca &9& %%% de daltoni, iind alcat"ita a!tel -

    #$ : &;%%%

    #&A < & : &2%%%

    #&4 < & : &2%%%

    #= < & : =%%%%

    #; < & : &&%%%

    'eci in total .i!tonele reprezinta $=&%%% de daltoni !iAN' dierenta de $=%%%% de daltoni / cca &%% p)30

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    19/44

    . >rin microscopieelectronic s-auidentificat nucleozomiide aprox' nm 1n

    diametru %i / nm 1n1nlime, legati 1ntre eiprin fire su0iri de aciddezoxiri0onucleic'

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    20/44

    @tape 1n structurarea fi0rei nucleosomice:

    A' !lcatuirea miezului7istonic (cate molecule din B!,

    BK, B, B

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    21/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    22/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    23/44

    . 40 secventa de!D" (de

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    24/44

    . C0 Bistona B leaga doi nucleozomi vecini

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    25/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    26/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    27/44

    2@"*DU

    . pasul de /nucleozomi

    . diametrul de&nm

    . compactarede 5 ori

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    28/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    29/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    30/44

    filament de nucleozomi

    10 nm

    filament de solenoid

    30 nm

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    31/44

    KUE@ !C@4!@

    . &-&&L0

    . diametrul de &&nm

    . 0uclele sunt ata%ate la

    un Msc7eletM sau matriceproteic regiunile deata%are la matriceM( 2!4# sunt 0ogate 1n !-C

    . proteinele non 7istonice

    Sc$ si Sc&( NOscaffoldI#

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    32/44

    . - 7ipercondensare

    . - fi0ra 0ucleiforma serasucestesuplimentar(grad

    compactare . - & proteine non

    7istonice. ( nr rasuciri la cr ar fi

    de 9- rotatii

    . ( cromatidaunuicromosom cu diametrulde ?&&nm

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    33/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    34/44

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    35/44

    Structuracromozomilor

    metafazici

    2 cromatideuniteprintr-un

    centromer

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    36/44

    . -

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    37/44

    Metode de obtinere acromozomilor

    Tehnici citogenetice clasice

    Si t d C i ti

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    38/44

    Sisteme de Cariotipare

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    39/44

    Cariotipul

    Cariotip3 aranFarea sistematizata a cromozomilor unei celule

    *2E" (*nternational 2Hstem for Buman EHtogenetics "omenclature# asta0ilit o serie de a0revieri

    )ormula de 0aza are itemi separati de virgula:

    primulprecizeaza nr de cromozomi (

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    40/44

    Cariotip-bandare GTG

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    41/44

    Te.nici de citogenetica molec"lara

    Bi0ridizarea 1n situ cu fluorescen ()*2B# este ometod de citodiagnostic molecular 1n care, are loc7i0ridizarea, pe 0az de complementaritate, 1ntre osecven specific din !D"-ul cromozomului analizat

    (!D" int# %i o sond de !D"'Cipuri de sonde:- centromerice- telomerice

    - specifice unui intreg cromozomCestele )*2B se pot efectua pe- nuclei interfazici din celule ale lic7idului amniotic- celule ale vilozitilor coriale- limfocite, celule din mduva osoas, tumori solide

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    42/44

    B*K4*D*J!4@ )U4@2E@"C! *" 2*CU ()*2B#

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    43/44

    !spect normal al nucleului interfazic(sexmasculin#!spect normal al nucleului interfazic(sex

    feminin#

  • 7/24/2019 2 Org Mat Genetic

    44/44

    )*2B 1n sindromul DoQn )*2B la sindromul @dQards