Cap-03
description
Transcript of Cap-03
Principiile Virologiei
Serban MOROSAN DVM, PhD
Taxonomia virala
• Este o disciplina relativ noua • La inceputul anului 1900 : virusurile erau clasificate
ca fiind agenti filtrabili (filtre de portelan ce retin bacteriile)
• 1930: dezvotarea tehnicilor a permis descrierea
proprietatilor a numeroase virusuri (purificarea si descrierea morfologiei)
• In anul 1960 s-a format ICTV (International
Committe on the Taxonomy of Viruses) • In general clasificarea are la baza doua sisteme:
– Un sistem ce se bazeaza pe o singura caracteristica sau pe o serie de caracteristici unice (« monothetic system »)
– Un sistem ce se bazeaza pe partajarea unui numar de caracteristici comune (« polythetic system »)
Proprietatile virusurilor in taxonomie
• Metoda utilizata in taxonomia virala este cea de a doua (« polythetic system »): orice virus este descris utilizand « colectia » proprietatilor individuale
• Descriptia virusurilor se realizeaza pe baza:
– Morfologiei virionului : marimea, simetria capsidei, forma, prezenta sau absenta anvelopei
– Proprietatile fizice ale virionului: structura genomului, sensibilitatea la actiunea substantelor fizice sau chimice; proprietatile antigenice
– Proprietatile biologice: strategiile de replicare, tipul de gazda, modul de transmitere si patogenicitatea
• ICTV a adoptat o schema ce utilizeaza o ierarhizare taxonomica: ordin, familie, subfamilie, gen si specie.
• Specia este definita ca fiind un virus ce se
multiplica si care ocupa o anumita nisa ecologica particulara
• Pentru fiecare gen s-a identificat o specie tip • Specia tip nu este neaparat cea mai
reprezentativa dar defineste sau identifica cel mai bine genul
• Genul: este un grup de specii ce prezinta anumite caracteristici comune
• Subfamilia: est un grup de genuri ce prezinta
anumite caracteristici comune • Familia: grup de subfamilii ce prezinta anumite
caracteristici comune • Ordinul: grup de familii ce prezinta anumite
caracteristici comune
• Familia este cel mai mult utilizata in
taxonomia virala • Majoritatea familiilor sunt caracterizate in
functie de : – morfologia virionului, – structura genomului si – strategia de replicare a acidului nucleic
viral
Reguli de taxonomie
• ICTV a adoptat o nomenclatura utilizand reguli pentru descrierea virusurilor
• Genul, subfamilia, familia si ordinul se scriu intr-un
singur cuvant terminandu-se cu sufixul: -virus; -virinae; -viridae si –virales
• Exemplu: ordinul Mononegavirales, familia
Paramyxoviridae, subfamilia Paramyxovirinae, genul Morbillivirus, specia: virusul rujeolei
Ordinea prezentarii virusurilor
• Ordinea prezentarii virusurilor este: – Natura genomului viral – Mono sau dublucatenar – Polaritatea genomului – Reverstranscriptia
• O alta categorie a fost creata pentru agentii subvirali cum ar fi viroizii, satelitii si prionii
Clasificarea virala : o « opera » neterminata
• Peste 5000 de virusuri – 30000 de suse si subtipuri
• 5 ordine • 84 de familii • 12 sub-familii • 324 genuri • Peste 2000 de specii
Virusuri ADN monocatenare (ss DNA)
• Circoviridae : • Anellovirus • Parvoviridae : parvoviroza canina
– parvovirinae
Virus ADN bicatenar (dsDNA)
• Asfarviridae: pesta porcina africana • Poxviridae : variola • Iridoviridae • Adenoviridae : hepatita infectioasa
canina • Herpesviridae : rinotraheita infectioasa
bovina • Polyomaviridae • Papillomaviridae
Virus ARN de polaritate negativa(ssRNA -)
• Orthomyxoviridae : virusul influentza • Rhabdoviridae : virusul turbarii • Delta virus • Paramyxoviridae : maladia Carré • Bornaviridae • Arenaviridae • Bunyaviridae • Filoviridae
Virus ARN bicatenar (ds RNA)
• Birnaviridae • Reoviridae : febra catarala ovina
Virus ARN monocatenar de polaritate pozitiva ssRNA +
• Caliciviridae : caliciviroza felina • Picornaviridae : febra aftoasa • Astroviridae : astroviroza (enterite) • Flaviviridae : BVD : boala mucoaselor • Coronaviridae : peritonita infectioasa felina • Arteriviridae : arterita infectioasa ecvina • Togaviridae : encefalitele ecvine americane
Virus cu transcriptie inversa
• Retroviridae (ssRNA /RT) : leucoza felina • Hepadnaviridae (dsDNA/RT): hepatita B ,
hepadnavirus (rate , marmote)
Agenti sub-virali
• Virusurile satelit • Prionii (agenti transmisibili neconventionali)
Virusuri satelit : deltavirus
• Exemplu – Virusul hepatitei delta
• Proprietati – Virus defectiv – Necesita functiile unui alt virus (virus helper) – Virus ARN monocatenar circular – O parte din genom ce seamana unui viroid
Agenti transmisibili neconventionali
• Exemplu: – Encefalopatia spongiforma bovina (ESB) – Scrapia – Creutzfeldt-Jakob la om
• Proprietati : – PrP infectioasa – Doua forme : PrPc si PrPsc
– Rezistenta exceptionala la agenti chimici si fizici.
Cultivarea si detectia virusurilor
1. Detectia initiala si izolarea virusurilor 2. Cultivarea virusurilor 3. Recunoasterea cresterii virusurilor in
cultura celulara : detectia cantitativa a virusurilor
Metodele de studiu al virusurilor
• Metode de studiu al acidului nucleic viral – Analiza de restrictie – Southern blot – PCR – Microarray – Secventializare
• Metode de studiu al proteinelor – Marcaj radioactiv – Imunoprecipitare – Electroforeza – Western blot
Diagnosticul infectiilor virale
Semnele clinice ê
Diagnostic diferential ê
Confirmarea etiologiei prin: - Punerea in evidenta a agentului patogen (direct) - Punerea in evidenta a raspunsului imun (indirect)
Diagnosticul infectiilor virale
A. Metode de diagnostic direct (punerea in evidenta a Ag)
A1. Nespecifice : (Determinarea originii virale, fara identificarea agentului etiologic) Efect citopatogen Test de hemadsorbtie
Diagnosticul infectiilor virale
A. Metode de diagnostic direct (punerea in evidenta a Ag)
A2. Specifice : (punerea in evidenta directa a unui constituent al virusului) Detectia genomului Detectia proteinelor
Diagnosticul infectiilor virale
B. Metode de diagnostic indirect (punerea in evidenta a raspunsului imun , Ac) ELISA direct Imunofluorescenta Seroneutralizare Inhibitia hemaglutinarii
Detectia initiala si izolarea virusurilor
• Prezenta unui virus este evidentiata de efectele asupra organismului sau asupra culturilor celulare
• Efectele asupra organismului: leziuni, disfunctii ale sistemului imun, ale organelor (hepatite sau miocardite) sau moartea
• Efectele asupra culturilor celulare: modificari morfologice ale celulelor infectate (efectele citopatice)
Detectia initiala si izolarea virusurilor
• Virusurile pot fi izolate de la animalele infectate: din excretii, secretii, sange sau tesuturi
• Virusurile pot fi izolate plecand de la animalele infectate
experimental sau de la culturile celulare infectate • Cainii, pisicile, soarecii, sobolanii si pasarile au fost utilizate
drept animale de laborator pentru infectiile experimentale
Detectia initiala si izolarea virusurilor
• Virusurile cultivate intr-o alta gazda sau pe culturi celulare se pot adapta prin achizitia unor modificari genetice (mutatii de exemplu)
• Aceste modificari pot fi insotite de o pierdere a virulentei
si a patogenicitatii. • Aceasta adaptare si atenuare pot fi extrem de utile
pentru intelegerea multiplicarii virusului dar si pentru constructia de vaccinuri atenuate
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - animalele de laborator si ouale embrionate
• Inainte de descoperirea culturilor celulare, virusurile se cultivau numai in gazdele naturale sau in animale de laborator
• In anul 1932 au fost introduse ouale embrionate in studiul
virusurilor • Dezvoltarea oualelor de gaina la 14 zile dupa fertilizare
contin o serie de tesuturi diferentiate, propice multiplicarii multor virusuri: – Orthovirusuri, paramyxovirusuri, rhabdovirusuri,
togavirusuri, herpesvirusuri si poxvirusuri
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - animalele de laborator si ouale embrionate
• In timp, ouale embrionate au fost inlocuite de culturile celulare
• Astazi, ouale embrionate sunt inca utilizate pentru obtinerea de titruri inalte pentru unele virusuri sau pentru dezvoltarea de vaccinuri
• De exemplu, formarea leziunilor inflamatorii de la nivelul membranei corioalantoide ramane metoda de baza in detectia unei variante a poxvirusului.
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda – tipuri celulare
• Celule aderente : – Doua tipuri de morfologie : epiteliale (poligonale) si
fibroblastice (alungite) • Celule neaderente (exemplu : liniile celulare
imortalizate) – Plutesc in mediul de cultura – Sferice – Destinate productiei celulare in masa
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - culturile de organe si celulare
• Mentinerea celulelor animale in vitro: – Cultura organelor – Cultura primara de explant de organe – Culturile celuare
• Cultura organelor: arhitectura tridimensionala a tesutului este mentinuta
• Cultura primara de explant de organe: piese mici de tesut
sunt cultivate • Culturile celulare: tesutul este disociat in celule individuale
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda – culturile si tipurile celulare (cultura, susa, linie)
• Culturile celulare sunt cele mai utilizate in cultivarea virusurilor
• Culturile celulare sunt de trei tipuri:
– Culturile celulare primare – Susele de celule – Liniile celulare
• Virusurile se comporta diferit in functie de tipul de culturi celulare (cu avantajele si dezavantajele tehnice)
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda – culturi celulare primare, suse celulare, linii
celulare
• Les diferitele tipuri celulare – Culturi de celule primare : celule puse in cultura plecad
de la organe; cresc in monostrat confluent – Suse celulare : polulatie celulara euploida (nr normal de
cromozomi) ce nu se cultiva la infinit (o subcultura) – Linii celulare: populatie celulara aneuploida (nr anormal
de cromozomi) ce poate fi cultivata la infinit : liniile celulare se pot transforma (spontan) in linii celulare imortalizate
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - culturile celulare primare
• Culturile celulare primare pot fi obtinute plecand de la:
– Embrioni sau tesuturi selectate de la embrioni – Animale nou-nascute – Animale adulte
• Cele mai utilzate culturi celulare: primate, om, rozatoare (soareci , sobolani, hamsteri), pasari
Suporturile culturilor celulare
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - culturile celulare primare
• Culturile celulare sunt obtinute prin disocierea tesutului si eliberarea celulelor (proteaze si colagenaze)
• Celulele vertebratelor cresc si se divid numai daca se
ataseaza la o suprafata solida (exceptie, celulele sitemului hematopoetic)
• Celulele sunt plasate in placi ce favorizeaza atasarea
(placi colagenate de exemplu) • Mediul de cultura : lichid, bogat in acizi aminati, minerale,
tampon pH, sursa de energie, factori de crestere, factori de atasare
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - culturile celulare primare
• In aceste conditii, celulele se ataseaza la placa, se divid si migreaza pana ce acopera suprafata placii
• Odata ce celulele acopera placa (intr-un singur strat) acestea sunt viabile dar nu se mai dezvolta
• Dupa inlaturea unei portiuni din acest strat celulele se dezvolta pana la refacerea lui
• Odata ce devin confluente, celulele nu se mai dezvolta: inhibitia de contact
• Culturile celulare pot contine mai multe tipuri celulare
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - subculturile celulare
• Celulele dintr-o cultura primara pot fi subcultivate pentru a obtine un numar mai mare de celule
• Celulele sunt mai intai detasate cu tripsina è suspensie de
celule • Suspensia este diluata si o parte este recultivata = cultura
secundara • Fiecare subcultura reprezinta un pasaj
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - subculturile celulare
• Fiecare pasaj este format dintr-un numar de generatii celulare (in functie de dilutia pasajului)
• Majoritatea celulelor vertebratelor multiplica (se dubleaza)
cu o rata constanta: odata la 24 h • Daca utilizam un pasaj diluat de opt ori, celulele se
dubleaza odata la 3 zile
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - susele celulare
• Cultura se numeste susa celulara incepand de la a doua cultura si pana la imbatranire
• Alterarea susei celulare poate avea loc: transformare (linie
celulara imortalizata)
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - susele celulare
• Celulele vertebratelor nu pot fi pasate la infinit (20-100 de generatii): in functie de varsta si specie
• Dupa 20-100 generatii, celulele nu se mai multiplica:
fenomenul de criza sau imbatranire
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - liniile celulare
• In timpul cultivarii unei linii celulare, acestea pot suferii modificari (transformare) si nu mai trec prin stadiile de criza sau imbatranire : pot fi pasate la infinit
• Caracteristica principala a transformarii este faptul ca celulele sunt imortalizate
• Celulele imortalizate se numesc linii celulare sau linii celulare continue
• Imortalizarea poate aparea spontan in timpul unui pasaj, induse chimic, prin infectia virala sau transfectia cu oncogene
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - liniile celulare
• Imortalizarea apare frecvent la culturile celulare la rozatoare, celule renale de maimuta si rar la cele de om sau gaina
• Importalizarea este insotita de modificari genetice (celule aneuploide : cu un numar anormal de cromozomi)
• Liniile celulare sunt in general compuse din fibroblaste sau celule epiteliale
• Liniile celulare rezulta prin selectia unor variante celulare
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda – transformarea
• Celulele transformate se diferentiaza de celulele normale prin proprietati ce pot fi grupate in trei modificari esentiale: – Imortalizarea – Controlul cresterii aberante – Celule maligne
Imortalizarea : posibilitatea de a fi cultivata la infinit
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda – transformarea
• Controlul cresterii aberante (proprietati): – Pierderea inhibitiei de contact – Independenta de contact – Tumoreginicitatea
• Pierderea inhibitiei de contact: celulele vor creste unele peste altete (si nu in monostrat)
• Independenta de contact: celulele nu mai au nevoie sa se ataseze pentru a se multiplica (se pot multiplica intr-un lichid in suspensie)
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda – transformarea
• Tumorgenicitatea : abilitatea celulelor de a forma o tumora in experimentare animala si de a se raspandi in vivo
• Caracteristicile celulelor transformate sunt extrem de
importante pentru studiul virusurilor tumorale
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - avantajele si dezavantajele diferitelor tipuri de culturi celulare
Avantage : • Liniile celulare sunt relativ usor de mentinut • Celulele aderente sunt usor de manipulat (pasage
multiple) • Celulele in suspensie sunt usor de diluat si produc un
numar mare de celule • Schimbarea mediului de cultura se realizeaza usor
Cultivarea virusurilor in diferite organisme gazda - avantajele si dezavantajele diferitelor tipuri de culturi celulare
Dezavantage : • Nu toate virusurile se multiplica pe culturi celulare
In acest caz se utilizeaza gazda naturala, animalele de laborator sau culturile de tesuturi
Recunoasterea virusurilor
• Alegerea metodei de cultivare a virusurilor depinde de mai multi factori: – Scopul experimentului: cultivarea virusului sau ale unor
variante – Limitele de cultivare a virusului in vitro: se poate cultiva
pe linii celulare, pe oua embrionate sau in suspensii celulare
– Tehnici alterantive: daca este posibil • Metoda aleasa depinde de :
– Biologia virusului : virusul este eliberat din celula gazda, determina liza celulei sau nu, determina sau nu un efect citopatic etc
Recunoasterea dezvoltarii virusurilor in culturile celulare
• Recunoasterea unei infectii virale: efectul citopatic si hemadsorbtia
• Efectul citopatic este compus din doua fenomene diferite:
– Modificari morfologice induse in celulele sau grupurile de celule de catre infectia virala (usor recunoscute la microscopul optic)
– Incluziile virale : alterari ale arhitecturii intracelulare
Recunoasterea dezvoltarii virusurilor in culturile celulare
• Modificarile morfologie induse de infectia virala: – rotunjire, – agregarea, – pierderea aderentei sau liza
• Modificari morfologice cauzate de un virus sunt extrem de reproductibile si pot fi asociate unei anumite infectii virale.
• Incluzii virale: anomalii intracelulare specifice la o celula
infectata si detectabile la microscopul optic. • Incluziile virale sunt specifice unei infectii virale date:
(corpusculii Bases Negri la nivelul nucleocapsidei virusului rabic)
Recunoasterea dezvoltarii virusurilor in culturile celulare
• Hemadsorbtia se refera la masurarea indirecta a sintezei proteinei virale in celulele infectate detectate prin adsorbtia eritrocitelor la suprafata celulelor infectate.
Recunoasterea dezvoltarii virusurilor in culturile celulare
• Hemadsorbtia : abilitatea virusurilor de a atasa specific globulele rosii
• Multe virusuri sintetizeaza proteine de atasare : se ataseaza la o mare varietate de celule (eritrocitele)
• Adesea, aceste proteine virale sunt exprimate la suprafata celulelor infectate (in timpul maturarii virusurilor cu anvelopa)
• Astfel, un grup de celule infectate poate fi usor detectat cu ochiul liber dupa expunerea preparatului in contact cu globule rosii
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile fizice – hemaglutinarea (numai pentru virusurile
hemaglutinante)
• O mare parte dintre virusuri sintetizeaza proteine de atasare celulara: atasarea la celule (eritrocitele)
• Aceste proteine responsabile de atasarea celulara sunt
prezente la suprafata virionilor: virionii pot atasa direct eritrocitele
• Amestecul de particule virale (intr-o concentratie suficienta)
cu eritrocite determina aglutinarea acestora
• Ertrocitele aglutinate se disting usor de cele neaglutinate
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile fizice – hemaglutinarea
• Dilutii seriate ale virusului sunt amestecate cu o concentratie fixa de eritrocite (placa speciala)
• Eritrocitele ce nu sunt aglutinate formeaza o grupare de
celule usor de recunoscut • Eritrocitele aglutinate nu sunt libere in godeurile placii si
formeaz un strat uniform la suprafata godeului • O unitate hemaglutinanata (HA unit/ml): cantitatea minima
de solutie virala capabila sa determine aglutinarea • Titrul viral exprimat in HA unit/ml poate fi calculat tinand
seama de dilutia solutiei virale
hemaglutinare
Titrul viral al probei de testat este calculat ca fiind inversul dilutiei ultimului punct ce determina hemaglutinarea : A8 si B1
Metodele cantitative de detectie a virusurilor
• Exista doua metode majore: fizice si biologice • Metodele fizice (masoara prezenta particulelor virale si
daca acestea sunt sau nu infectioase): Ex : Numararea particulelor (microscopie electronica) etc.
• Metodele biologice: masoara prezenta infectiei virale dar nu si numarul particulelor prezente Ex: cultivarea in placa etc.
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice- cultivarea in placa
• Tehnica de cultivare in placa : este cea mai utila tehnica biologica
• Descoperita de Herelle (1900) la bacteriofagi ea a fost
adaptata la virusurile animale de Dulbecco in 1953 • Metoda simpla si cantitativa
Metodele cantitative de detectie a virusurilor – « plaque assay »
• Principiul tehnicii : abilitatea unei singure particule virale de a da nastere la o suprafata citopatologica macroscopica (« placa infectioasa»)
• Tehnica poate fi utilizata pentru cuantificarea virusului
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice- cultivarea in placa
• Efectuarea de dilutii seriate a virusului de testat • Infectarea placilor Petri cu culturi celulare • Peste fiecare placa Petri se adauga un mediu semi-solid • Mediul solid previne formarea placilor de infectie
secundare • Astfel, fiecare placa insemana rezultatul infectiei unei singure
particule virale • Dupa incubare, mediul este colorat si placile pot fi astfel
vizualizate
Etapele :
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice- cultivarea in placa
• Placile de cultura inoculate cu dilutii mari contin cateva placi de infectie
• Placile ce contin un numar rezonabil de placi de infectie vor
fi numarate si concentratia virusului infectios de origine poate fi calculat in functie de dilutia inoculata
• Rezultatul sau titrul viral este exprimat in placi formatoare
de unitati pe mililitru (pfu/ml) – Numai particulele virale capabile sa formeze placi infectioase vor fi
numarate
Virus de o concentratie necunoscuta
Dilutii seriate
Etapa 1
Etapa 2
Fiecare dilutie este depusa intr- o placa Petri ce contine un monostrat de celule
Etapa 3
Fiecare placa de cultura este acoperita cu un mediu semi-solid (previne formarea de « placi secundare »)
Etapa 4
• Incubarea placilor Petri
si colorarea acestora pentru vizualizarea placilor infectioase
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice- cultivarea in placa
• Pipette off and discard ONE ML of media from each well. One ml of media should now remain on each monolayer.
• Add 100 µL or 10 µl of each dilution in duplicate to each well, letting the virus flow gently into the media.
• [Consider this: If 100µl of a 106 dilution yields 25 plaques, the titer of virus is 2.5x108 PFU/ml. If 10µl of a 106 dilution yields 30 plaques, the titer of virus is 3.0 x109 PFU/ml.]
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice- metoda punctului final
• Virusurile la care nu pot fi adaptate tehniciile de mai sus (dar care determina patologii detectabile in culturile celulare, ouale embrionate etc) pot fi cuatificate prin tehnica punctului final
• Virusul este diluat (dilutii seriate) si cultivat pe mediu si prin
metoda adecvata • Dupa perioada de incubatie adecvata trebuie evaluat
momentul in care s-a produs infectia
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice - metoda punctului final
• Diferite metode statistice s-au dezvoltat pentru a calcula dilutia de virus ce determina infectia a 50% din mediile de cultura inoculate : titrul viral este exprimat ca ID50 (« infectious dose 50 »)
• Tehnica poate cuprinde de asemenea : – observarea efectului citopatic in culturile celulare sau TCID50 (« tissue
culture infective dose 50 ») – Moartea oulelor embrionate inoculate: EID50 « egg infectious dose
50 » – Moartea animalelor infectate: LD50 « lethal dose 50 »
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice - metoda punctului final
• Datele din tabelul de mai sus au fost recoltate prin infectia cu dilutii seriate a mai multor placi de culturi celulare
• Dupa incubare s-au observat prezenta efectelor citopatice
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice - metoda punctului final
• Dilutia -6 : 66,7 % dintre placi sunt infectate • Dilutia -7: 14,3% dintre placi sunt infectate • Dilutia ce determina infectia a 50% dintre placi se afla intre dilutiile -6 si -7
Metodele cantitative de detectie a virusurilor tehnicile biologice - metoda punctului final
• Dilutia exacta poate fi calculata utilizand metoda lui Reed-Muench
• Distanta proportionala 50% = (% peste 50%) - 50%)/(% peste 50%) - (% sub 50%)
• Sau (66,7% - 50%) / (66,7% - 14,3%) = 0,3 • Punctul final sau
log TCID50 = (log din dilutia peste 50%) + distanta proportionala x log factorul de dilutie sau
Log TCID50 = (-6) + ( 0,3 x - 1) = - 6,3 Deci TCDI50 = 10-6,3
• Distanta proportionala 50% = (% peste 50%) - 50%)/(% peste 50%) - (% sub 50%)
• Sau (66,7% - 50%) / (66,7% - 14,3%) = 0,3 • Punctul final sau
log TCID50 = (log din dilutia peste 50%) + distanta proportionala x log factorul de dilutie) sau
Log TCID50 = (-6) + ( 0,3 x - 1) = - 6,3 Deci TCDI50 = 10-6,3
Metode de detectie serologice
• Utilizeaza specifictatea reactiei antigen-anticorp • Permit detectia antigenelor virale sau a anticorpilor specifici • Imunofluorescenta • Imunoprecipitarea • Immunobloting • Elisa
Metode de detectie serologice – neutralizarea
• Inocularea unui virus la un animal determina producerea de anticorpi specifici
• O parte dintre acesti anticorpi pot neutraliza specific virusul
Metode de detectie serologice – neutralizarea
• Dilutii de serum sau de anticorpi monoclonali + virus • Incubare • Testarea prin diferite metode : culturi celulare, sau animale • End point = cea mai mare dilutie a anti-serului ce inhiba
dezvoltarea de efecte citopatice (in culturile celulare) sau relicarea virusului (in ouale embrionate sau animale de experienta)
Metode de detectie serologice – inhibarea hemaglutinarii
• Anticorpii specifici proteinelor virale (cu o activitatea hemaglutinanata) pot bloca abilitatea virusului de a aglutina globulele rosii
• Dupa incubare, inhibarea hemaglutinarii este citita ca fiind
cea mai mare dilutie a serului ce inhiba hemablutinarea • Este o metoda rapida, sensibila utilizata pentru detectia
anticopilor oricarui virus ce cauzeaza hemaglutinare
Metode de detectie serologice – inhibarea hemaglutinarii
Metode de detectie serologice – fixarea complementului
• Determina prezenta anticoprilor antivirali dintr-un ser de cercetat
• Interactiunea antigeni virali-anticorpi poate cauza fixarea
complementului • Fixarea complementului va determina liza membranelor
celulare
Metode de detectie serologice – fixarea complementului
Etapele : 1. Inactivarea complementului endogen din serul de cercetat
(prin incalzire) 2. Incubarea serului de cercetat cu un complement standard 3. Daca are loc reactia Ag-AC atunci complementul se
fixeaza 4. Detectarea complementului fixat: prin adaugarea de
globule rosii de oaie + AC anti globule rosii 5. Citirea reactiei
Metode de detectie serologice – imunofluorescenta, ELISA
• Imunofluorescenta directa • Imunofluorescenta indirecta • ELISA
Detectia acizilor nucleici - Southern blot, Northern blot
• Southern blot • Northern blot • PCR
Studiul acidului nucleic viral
• Analiza de restrictie si hibridare moleculara • Amplificare genica (PCR)
– Conventinala – PCR in timp real
• Secventializare • Microarrays • Metode bazate pe mutatii induse in seceventele
ADN-ului de studiat (mutageneza dirijata)