1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA...

30
1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babe FARMACIE “Victor Babe ş” ş” TIMISOARA TIMISOARA DISCIPLINA DE DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA INFORMATICA MEDICALA http://moodle http://moodle .umft.ro .umft.ro

Transcript of 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA...

Page 1: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

1

UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor BabeFARMACIE “Victor Babeş”ş” TIMISOARA TIMISOARA

DISCIPLINA DEDISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALAINFORMATICA MEDICALA

http://moodlehttp://moodle.umft.ro.umft.ro

Page 2: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

2

CURSUL 3CURSUL 3

Page 3: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

3

BIOSTATISTICABIOSTATISTICA(I)(I)

Page 4: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

4

Capitolele biostatisticii• Statistica elementară

– Inferenta statistica– Statistica descriptiva - Parametrii statistici– Estimarea statistica– Teste statistice– Corelatia si regresia

• Aplicaţii speciale:– Epidemiologie (Analiza riscului)– Aplicaţii în demografie (Analiza supravietuirii)– Sănătate publică (Statistica sanitară)

• Prelucrări avansate (Analiza clasificării etc)

Page 5: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

5

1. INFERENTA STATISTICA1. INFERENTA STATISTICA

• 1.1. CONCEPTE GENERALE1.1. CONCEPTE GENERALE– a) populatie, individa) populatie, individ– b) definitie:b) definitie: – Biostatistica = stiinta estimarii caracteristicilor Biostatistica = stiinta estimarii caracteristicilor

unei populatii si/sau compararea populatiilorunei populatii si/sau compararea populatiilor

– c) metode:c) metode:• recensamânt - toti indivizii; acelasi momentrecensamânt - toti indivizii; acelasi moment• screening - numar mare; criterii de selectiescreening - numar mare; criterii de selectie• esantionare - submultime a populatieiesantionare - submultime a populatiei

Page 6: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

6

– d) INFERENTA STATISTICAd) INFERENTA STATISTICA• Definiţie: Definiţie: EXTINDEREA EXTINDEREA PPROPRIETATILOR ROPRIETATILOR

DETERMINATE DETERMINATE PE UN ESANTION PE UN ESANTION L LA A INTREAGA POPULATIEINTREAGA POPULATIE

– e) ESANTION REPREZENTATIVe) ESANTION REPREZENTATIV

• CRITERII:CRITERII:– ECHIPROPBABILITATEECHIPROPBABILITATE– INDEPENDENTAINDEPENDENTA

Page 7: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

7

f) METODE DE SELECTIEf) METODE DE SELECTIE ÎN EŞANTION: ÎN EŞANTION:

• SELECTIA SIMPLA SELECTIA SIMPLA – NUMERE ALEATOARE ASOCIATENUMERE ALEATOARE ASOCIATE

• SELECTIA MULTISTRATIFICATA SELECTIA MULTISTRATIFICATA • SELECTIA MIXTASELECTIA MIXTA

– CLUSTERECLUSTERE

Page 8: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

8

• 1.2. VARIABILE1.2. VARIABILE

– a) DEFINITIE:a) DEFINITIE:• o caracteristica a populatiei care este studiata o caracteristica a populatiei care este studiata

si masurata la toti indivizii din esantionsi masurata la toti indivizii din esantion

– b) TIPURI DE VARIABLE:b) TIPURI DE VARIABLE:• NUMERICENUMERICE

– măsurate cu un instrumentmăsurate cu un instrument– se precizează unitatea de măsurăse precizează unitatea de măsură– tipuri: tipuri: intervalinterval sau sau true zerotrue zero

• ORDINALEORDINALE– scară convenţională, fără unităţiscară convenţională, fără unităţi– exprimă ordineaexprimă ordinea (rang (ranguriuri))

• NOMINALE (calitativeNOMINALE (calitative, “count data”, “count data”))

Page 9: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

9

• 1.3. 1.3. ETAPELE STUDIULUIETAPELE STUDIULUI– PROIECTAREPROIECTARE

– COLECTAREA DATELORCOLECTAREA DATELOR

– PRELUCRAREPRELUCRARE

– PREZENTARE REZULTATE:PREZENTARE REZULTATE:

– tabele, grafice:tabele, grafice:• Histograme (coloane, bare, 3D etc)Histograme (coloane, bare, 3D etc)• Sectoare Sectoare [“pie”] (in special pentru %)[“pie”] (in special pentru %)• LiniiLinii [polygon] [polygon] • Puncte [“scatter]Puncte [“scatter]• HărţiHărţi

Page 10: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

10

Page 11: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

11

1.1.44. . PROIECTAREA UNUI PROIECTAREA UNUI STUDIUSTUDIU

• definirea populatieidefinirea populatiei• selectia variabilelorselectia variabilelor• acuratetea acuratetea si precizia si precizia masurarilormasurarilor• dimensiunea esantionuluidimensiunea esantionului

Page 12: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

12

2. PARAMETRII 2. PARAMETRII STATISTICISTATISTICI

Page 13: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

13

• 2.1. EXEMPLU:2.1. EXEMPLU: – studiul dezvoltarii copiilorstudiul dezvoltarii copiilor

• populatia: copii de 10 ani, din populatia: copii de 10 ani, din Timisoara, in Timisoara, in 20042004

• dimensiunea: 400 copiidimensiunea: 400 copii

• date colectate : inaltimea, in cmdate colectate : inaltimea, in cm

• acuratetea : 1 cmacuratetea : 1 cm

– tabel de date si histogramatabel de date si histograma

Page 14: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

14

TABEL TABEL şi şi HISTOGRAMAHISTOGRAMA

Page 15: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

15

Concluzii: Concluzii:

– valori extreme - rarevalori extreme - rare– valori centrale - mai desvalori centrale - mai des

• INDICATORI AI TENDINTEI INDICATORI AI TENDINTEI CENTRALECENTRALE

– variabilitateavariabilitatea• INDICATORI DE DISPERSIEINDICATORI DE DISPERSIE

Page 16: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

16

2.22.2. INDICATORII TENDINTEI . INDICATORII TENDINTEI CENTRALECENTRALE

A)A) Media aritmeticMedia aritmeticăă

B)B) MMeedianadiana

C)C) ModaModa

Page 17: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

17

– a) MEDIA ARITMETICA (MEAN):a) MEDIA ARITMETICA (MEAN):

NXXN

ii /

1

Page 18: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

18

• b) MEDIANA (MEDIAN) b) MEDIANA (MEDIAN) – VALOAREA CARE IMPARTE ESANTIONUL IN VALOAREA CARE IMPARTE ESANTIONUL IN

DOUA PARTI EGALE DOUA PARTI EGALE • Ex: pentru un numar par sau impar de elementeEx: pentru un numar par sau impar de elemente• Recomandata pentru variable ordinale Recomandata pentru variable ordinale

• c) MODA (MODE)c) MODA (MODE)– VALOAREA CEA MAI FRECVENTA VALOAREA CEA MAI FRECVENTA – CLASE MODALECLASE MODALE– DISTRIBUTII UNI~, BI~, MULTIMODALEDISTRIBUTII UNI~, BI~, MULTIMODALE

• recomandate pentru variable nominale recomandate pentru variable nominale

Page 19: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

19

• d) POZITIA RELATIVAd) POZITIA RELATIVA

– DISTRIBUTII SIMETRICE :DISTRIBUTII SIMETRICE :– X = Me = MoX = Me = Mo– DISTRIBUTII ASIMETRICE (skew):DISTRIBUTII ASIMETRICE (skew):– X = cea mai sensibila valoareX = cea mai sensibila valoare– Mo = cea mai robusta (putin sensibila)Mo = cea mai robusta (putin sensibila)

Page 20: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

20

2.2.3. INDICATORI3. INDICATORI DE DE

DISPERSIEDISPERSIE

A) Pentru variabile numericeA) Pentru variabile numericeB) Pentru variabile ordinaleB) Pentru variabile ordinaleC) Pentru proporţiiC) Pentru proporţii

Page 21: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

21

A) Variabile numericeA) Variabile numerice

a)a) DDEEVIAŢIA STANDARDVIAŢIA STANDARD (s) (s)b)b) VVARIANŢA (sARIANŢA (s22))cc) COEFICIENTUL DE VARIA) COEFICIENTUL DE VARIAŢŢIEIE (cv) (cv)

xscv

n

xxs i

1

2

Page 22: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

22

d) d) DISTRIBUTIA NORMALA (GAUSS)DISTRIBUTIA NORMALA (GAUSS)REPREZENTARE GRAFICAREPREZENTARE GRAFICA

Page 23: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

23

e) e) Intervale definite cu “s”Intervale definite cu “s”

• p = proportia indivizilor care au marimea in p = proportia indivizilor care au marimea in intervalul respectivintervalul respectiv

• p = probabilitatea ca un individ sa aiba marimea in p = probabilitatea ca un individ sa aiba marimea in intervalul respectivintervalul respectiv

EX: studiu inaltimea copiilor: EX: studiu inaltimea copiilor: nn == 25 copii25 copii m m == 137 cm (ac=1)137 cm (ac=1) s s == 5 cm5 cm

%7.99);3,3(

%95);2,2(

%68);,(

psxsxx

psxsxx

psxsxx

i

i

i

Page 24: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

24

ff) ) Curba Gauss - ProprietăţiCurba Gauss - Proprietăţi

• Depinde de doi parametri:Depinde de doi parametri:– μμ = = media (media (poppopulaţiei)ulaţiei)– σσ = deviaţia standard (a = deviaţia standard (a poppopulaţiei)ulaţiei)

• Curba normalizată (funcţie de z)Curba normalizată (funcţie de z)– are media are media μμ=0 si deviaţia standard =0 si deviaţia standard σσ=1=1

EX: studiu inaltimea copiilor: EX: studiu inaltimea copiilor: nn == 25 copii25 copii m m == 137 cm (ac=1)137 cm (ac=1) s s == 5 cm5 cm

f x y e

x

( )

( )

1

2

2

22

x

z

Page 25: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

25

gg) ) DISTRIBUTIA GAUSS DISTRIBUTIA GAUSS NORMALNORMALIZATAIZATA

Page 26: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

26

B) Variabile ordinale (rang)B) Variabile ordinale (rang)

• QUANTILE – impartirea in “n” intervaleQUANTILE – impartirea in “n” intervale• CAZURI PARTICULARECAZURI PARTICULARE

– MEDIANA n = 2MEDIANA n = 2

– QUARTILE n = 4QUARTILE n = 4

– DECILE n = 10DECILE n = 10

– CENTILE n = 100CENTILE n = 100

– PROMILE n = 1000PROMILE n = 1000

• Calcul: dupa ordonare!Calcul: dupa ordonare!

Page 27: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

27

C) Variabile calitative (nominale)C) Variabile calitative (nominale)

• ProporProporţţia Clasei:ia Clasei:

pi = Ni / N (procentul … 100)• Deviatia standard a proporDeviatia standard a proporţţiei:iei:

• ppii – probabilitatea de a aparţine clasei – probabilitatea de a aparţine clasei• qqii – probabilitatea de a nu aparţine clasei – probabilitatea de a nu aparţine clasei

ii

iip

pq

Nqps

1

/

Page 28: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

28

2.4. ASIMETRIE 2.4. ASIMETRIE (SKEWNESS)(SKEWNESS)

– Coeficientul lui Pearson: Coeficientul lui Pearson: = (X-Mo)/s = (X-Mo)/s

– ““coada” (tail) la dreapta sau la stangacoada” (tail) la dreapta sau la stanga

Page 29: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

29

2.5. EXCES2.5. EXCES(KURTOSIS)(KURTOSIS)

• Exces: (Exces: () – aplatizare, boltire) – aplatizare, boltire– (distributie leptokurtica, platikurtica)(distributie leptokurtica, platikurtica)

Page 30: 1 UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE “Victor Babeş” TIMISOARA DISCIPLINA DE INFORMATICA MEDICALA .

30

- pauza -- pauza -