02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
-
Upload
razvan-zuzu -
Category
Documents
-
view
8 -
download
0
Transcript of 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 1/56
Astăzi și nu doar astăzi ...
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 2/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 3/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 4/56
”Această hartă este, fără îndoială, cea mai importantă și maiimpresionantă hartă întocmită vreodată de omenire.”
”Astăzi, învățăm limba în care Dumnezeu a creat viața. Suntem cu atât mai copleșiți de uimire și venerație în fațacomplexității, a frumuseții și a minunii darului celui mai sfântși dumnezeiesc al Lui Dumnezeu.”
”Este o zi fericită pentru întreaga lume. Încerc un sentimentde umilință și uimire la gândul că am fost primii care auaruncat o privire asupra propriului nostru manual de
instrucțiuni, știut până acum numai de Dumnezeu.”
Proiectul Genomului Uman
Limbajul Lui DumnezeuFrancis S. Collins
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 5/56
Fiziologia bacteriană
• Constituţia chimică a bacteriilor
• Metabolismul bacterian
• Căi metabolice
• Căi biosintetice particulare
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 6/56
Fiziologia bacteriană
1. Constituţia chimică a bacteriilor • Apa
• Substanţele minerale
• Glucidele
• Proteinele
• Lipidele
• Pigmenţii
• Enzimele
• Substanţe cu acţiune antibiotică
• Vitaminele bacteriene
• Factorii de creştere
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 7/56
Fiziologia bacteriană
f. Pigmenţii – pigmentogeneza
• Poate reprezenta un criteriu de identificare
ex. pentru Pseudomonas aerugino sa sau
pentru Staphy loco ccus aureus
• După localizarea pigmentului, bacteriile pot fi:
- cromofore (pigmentul este legat încitoplasmă)
- paracromofore (pigmentul este prezent înperete sau în stratul mucos, ex. la S. aureu s )
- cromopare (pigmentul este difuzibil înmediu, ex. la P. aerug inos a )
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 8/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 9/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 10/56
Fiziologia bacteriană
h. Substanţele cu acţiune antibiotică
• plasmida “col” codifică proprietatea unorbacterii de a elabora bacteriocine (de ex.
colicinele elaborate de E. co li )
• unele bacterii din genul Baci l lus produc
antibiotice polipeptidice
- B. lichenifo rm is produce bacitracina
- B. brevis gramicina
- B. polym yxa polimixina
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 11/56
Fiziologia bacteriană
j. Factorii de creştere
• metaboliţi esenţiali pe care bacteria nu-i poate
sintetiza
• substanţe care trebuie incluse în mediul deculturăex. factorii X şi V pentru Haemophi lus in f luenzae
• situaţie particulară - Mycobacter ium leprae
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 12/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 13/56
Fiziologia bacteriană
2. Metabolismul bacterian
• Nutriţia bacteriană
• Respiraţia bacteriană
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 14/56
Fiziologia bacteriană
a1. Nutriţia bacteriană
Nutriţia bacteriană = suma proceselor metabolice careconcură la producerea de materiale convertibile înenergie şi în diferite componente celulare.
Nutrienţii sunt substanţe ale căror soluţii pot traversamembrana citoplasmatică pentru a fi antrenaţi înreacţiile metabolice care asigură creşterea şimultiplicarea celulară.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 15/56
Fiziologia bacteriană
a2. Nutriţia bacteriană
În raport cu sursa de energie, bacteriile se împart în:
- bacterii care folosesc energie luminoasă şi trăiesc la
lumină (fotobacterii) şi
- bacterii care îşi procură energia prin procese deoxidoreducere catalizate enzimatic şi trăiesc la întuneric (scotobacterii, chimiosintetizante).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 16/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 17/56
Fiziologia bacteriană
a3. Nutriţia bacteriană
În raport cu sursele folosite ca material de sinteză înambele diviziuni se diferenţiază:
- bacterii autotrofe, capabile să-şi sintetizeze toţicompuşii organici din materie anorganică;
- bacterii heterotrofe, dependente de prezenţa unorcompuşi organici.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 18/56
Fiziologia bacteriană
a4. Nutriţia bacteriană
Nutriţia principalelor bacterii studiate
Majoritatea bacteriilor comensale, condiţionatpatogene sau patogene importante pentru om,
sunt - chimiosintetizante, heterotrofe
Există şi bacteriile paratrofe, a căror energietrebuie oferită de gazdă. Sunt bacterii parazite
localizate strict intracelular (ex. genurileRickettsi ia şi Chlamydia ).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 19/56
Fiziologia bacteriană
b1. Respiraţia bacteriană
Respiraţia reprezintă suma reacţiilor biochimice aerobe
sau anaerobe producătoare de energie.
În funcţie de natura acceptorului final, respiraţia poate fi:aerobă sau anaerobă.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 20/56
Fiziologia bacteriană
b4. Respiraţia bacteriană
Tipul respirator
În raport cu utilizarea proceselor pentru obţinerea
energiei şi de relaţia cu oxigenul din mediu, bacteriilese pot grupa în 4 “tipuri respiratorii” principale:
• strict aerob
• strict anaerob
• aerob facultativ anaerob
• anaerob microaerofil
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 21/56
Fiziologia bacteriană
b5. Respiraţia bacteriană
Tipul respirator
• Strict aerob, atunci când bacteriile (ex. Bordetel laper tuss is ) se dezvoltă numai în prezenţa unei presiunicrescute a O2, care este folosit ca acceptor final
unic.
• Aceste bacterii posedă catalază, peroxidază,
citocromi (de exemplu catalaza desface H2O2 toxicpentru celula bacteriană) şi utilizează numai procesede respiraţie.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 22/56
Fiziologia bacteriană
b6. Respiraţia bacteriană
Tipul respirator
• Strict anaerob, atunci când bacteriile (ex.Clostr id ium spp. , Fusob acter ium etc) cresc numai înabsenţa O2.
• Nu pot supravieţui în prezenţa O2, care nefiind redus
are o acţiune bactericidă. Nu au catalază, peroxidază.
• Aceste bacterii folosesc pentru obţinerea energieinumai procese de fermentaţie.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 23/56
Fiziologia bacteriană
b7. Respiraţia bacteriană
Tipul respirator
• Aerob facultativ anaerob, atunci când bacteriile (E.col i , S. aureu s , S. pyo genes etc) se dezvoltă mai bine în mediile cu oxigen, prin procese de respiraţie, darpot prezenta ambele tipuri respiratorii.
• În acest tip se încadrează majoritatea bacteriilorstudiate.
• Anaerob microaerofil, atunci când bacteriile (ex.
Campylobacter ) tolerează mici cantităţi de O2.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 24/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 25/56
Fiziologia bacteriană
3. Căi metabolice
• Metabolismul glucidic
• Metabolismul lipidic
• Metabolismul proteic
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 26/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 27/56
Fiziologia bacteriană
4. Căi biosintetice particulare
• Formarea structurilor precursorilor biosintetici
• Sinteza peptidoglicanului
• Sinteza LPZ • Sinteza capsulei extracelulare
• Sinteza substanţelor de rezervă
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 28/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 29/56
U idil f f t UMP
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 30/56
Uridil mono-fosfat UMP
UTP
UDP N-AGln
N-A-Gln-1P
UDP NAGln - piruvat enol eter
UDP NAGln lactic acid eter
(UDP Acid NAM)
UDP - ANAM - L-Ala
UDP - ANAM - L-Ala D-Gln L-Lis
UDP - ANAM - pentapeptid
FEP
+ 2H
L-Ala
D-Gln
L-Lis
D-Ala - D-Ala D-Ala L-Ala
FOSFONOMICINA
CICLOSERINA
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 31/56
UDP - ANAM - pentapeptid
BP-P-P - ANAM - pentapeptid
BP-P-P - ANAM - NAGln - pentapeptid
BP-P-P – ANAM - NAGln - pentapeptid - pentaglicină
Peptidoglican - ANAM - NAGln - pentapeptid - pentaglicină
Peptidoglican - ANAM - NAGln
– pentapeptid
– pentaglicină
BP-P
UDP-NAGln
Glicil-ARNt
PeptidoglicanBP-P-P
Pi
BACITRACINA
VANCOMICINA
PENICILINA
PENICILINA
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 32/56
Cultivarea bacteriană
Definiţii
• Populaţia = o multitudine de indivizi ai unei specii
care habitează într -un anumit biotop.
• Clona = populaţia care rezultă dintr -o singură celulăprin înmulţire vegetativă.
• Tulpina = populaţia microbiană alcătuită dindescendenţii unei singure izolări în cultură pură.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 33/56
Cultivarea bacteriană
• Creşterea oricărui organism are loc prin sinteza denoi molecule.
• Deoarece creşterea volumului celular raportată lacreşterea suprafeţei este mai mare, în cursul creşterii
se ajunge la un punct critic.
• Multiplicarea celulară este o consecinţă a creşterii.Se restabileşte raportul optim dintre volumul şisuprafaţa celulei.
• Multiplicarea majorităţii bacteriilor se face prindiviziune simplă (binară). Sporii nu reprezintăforme de multiplicare (aşa cum se întâmplă în cazulfungilor).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 34/56
Cultivarea bacteriană
Metodele de cultivare a bacteriilor urmăresc 3 obiective:
• obţinerea unei populaţii microbiene suficiente cantitativpentru investigaţiile propuse,
• prevenirea contaminării produsului cercetat cu unmicroorganism străin şi
• izolarea fiecărei tulpini microbiene urmărite în cazul unuiprodus pluri-microbian în culturi mono-microbiene
denumite “culturi pure”.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 35/56
Cultivarea bacteriană
Cultivarea se realizează prin însămânţarea bacteriilor pemedii de cultură.
Mediile solide sau lichide care asigură nutrienţii şi condiţiilefizico-chimice necesare creşterii şi multiplicării
bacteriene se numesc medii de cultură.
Totalitatea bacteriilor acumulate prin multiplicarea într -un
mediu de cultură poartă numele de cultură bacteriană.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 36/56
Cultivarea bacteriană
Mediile de cultură
Microorganismele pot fi cultivate pe gazde vii şi pe mediiartificiale.
• Există anumite microorganisme (ex. virusuri, Ricketts i i ,Chlamydi i ) care nu pot fi cultivate decât pe gazde vii: - animale de laborator
- ouă de găină embrionate
- culturi de celule
• Majoritatea bacteriilor, fungii şi unele protozoare se potcultiva şi pe medii artificiale.
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 37/56
Cultivarea bacteriană
Clasificarea mediilor de cultură artificiale - după starea de agregare,- după natura ingredientelor,- după complexitatea ingredientelor (ex. medii speciale),
- după scopul urmărit (transport, izolare, identificare etc),
Există medii de cultură- simple (agar, apă peptonată, bulion simplu etc) şi- medii de cultură mai complexe (agar -sânge, bulion
glucozat, agar Muller-Hinton etc).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 38/56
Cultivarea bacteriană
Medii speciale- electiv
- selectiv
- de îmbogăţire
- diferenţial
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 39/56
Cultivarea bacteriană
Mediul electiv conţine ingredientele care convin cel mai
bine dezvoltării unei anumite bacterii (de exemplu mediul
Lőffler, cu ser coagulat de bou, pentru bacilul difteric).
Mediul selectiv conţine substanţe antimicrobiene,
inhibând dezvoltarea altor bacterii decât cea a cărei izolare se urmăreşte. De ex. medii în care includem
antibiotice (faţă de care bacteria care se doreşte a fi
izolată este rezistentă).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 40/56
Cultivarea bacteriană
Mediul de îmbogăţire favorizează înmulţirea anumitor
bacterii patogene, inhibând dezvoltarea florei de
asociaţie dintr-un produs patologic. Funcţionează
concomitent ca mediu selectiv şi ca mediu electiv (ex.
mediile de îmbogăţire utilizate pentru izolarea Salmonel la
typh i ).
Mediul diferenţial conţine un anumit substrat (de exemplu
unele zaharuri) care poate fi sau nu metabolizat,
determinând modificarea culorii sau aspectului culturii.
• Ex. agarul cu albastru de brom-timol lactozat (AABTL)
care diferenţiază bacteriile lactozo-pozitive (cum este E.col i ) de bacteriile lactozo negative (Shigel la , Salmonel la ).
• Alte ex. ADCL (agar dezoxicolat citrat lactoză), TSI (3
zaharuri şi fier), MIU (mobilitate indol uree).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 41/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 42/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 43/56
Cultivarea bacteriană
Colonia izolată
Pe medii solide, germenii însămânţaţi în suprafaţă produccolonii.
Colonia este totalitatea bacteriilor rezultate din multiplicareaunei singure celule bacteriene. O colonie este o clonăbacteriană.
Coloniile izolate se pot obţine de exemplu prin tehnica însămânţării prin dispersie (cu ansa bacteriologică sau
cu tamponul).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 44/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 45/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 46/56
Cultivarea bacteriană
Aspectul culturilor pe medii solide
Colonia S (smooth) are suprafaţă bombată şi netedă,margini circulare şi adesea aspect strălucitor.germenii păstrează structura antigenică
nu aglutinează spontan cu soluţie salină fiziologicăgermenii capsulaţi îşi păstrează capsula
virulenţa este conservată.
Majoritatea bacteriilor studiate formează colonii de tip S (S.aureus , S. pyo genes , E. co li etc).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 47/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 48/56
Cultivarea bacteriană
Aspectul culturilor pe medii solide
Colonia R (rough) este plată, suprafaţa ei prezintărugozităţi, marginile sunt crenelate.- structura antigenică nu este caracteristică
- nu păstrează capsula - virulenţa nu este conservată (excepţii B. anthracis ,
M. tuberculosis , C. dip hteriae ).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 49/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 50/56
Cultivarea bacteriană
Aspectul culturilor pe medii solide
Colonia R (rough) este plată, suprafaţa ei prezintărugozităţi, marginile sunt crenelate.- structura antigenică nu este caracteristică
- nu păstrează capsula - virulenţa nu este conservată (excepţii B. anthracis ,
M. tuberculosis , C. dip hteriae ).
Colonia M (mucoid) este mare, strălucitoare, mucoasă.- este dată de exemplu de bacteriile care prezintă
capsule mari (exemplu Klebsiel la pneumoniae ).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 51/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 52/56
Cultivarea bacteriană
Aspectul culturilor pe medii lichide
Bacteriile şi fungii facultativ anaerobi se dezvoltă în toatămasa de lichid, tulburându-l.
Bacteriile strict aerobe se dezvoltă preponderent lasuprafaţa mediului.
Variantele S tulbură omogen mediul (majoritatea bacteriilor).
Variantele R realizează o tulburare mai puţin omogenă.
Pot lăsa mediul limpede, formând flocoane care se depunsau un strat (văl) la suprafaţa mediului (de exemplubacilul difteric sau bacilul tuberculos).
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 53/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 54/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 55/56
7/21/2019 02_cursul 2_Fiziologie_Cultivare.pdf
http://slidepdf.com/reader/full/02cursul-2fiziologiecultivarepdf 56/56
http://www.eurosurveillance.org/
http://www.cdc.gov