Reglarea activitatii genice (in special la procariote)

8

Click here to load reader

description

curs

Transcript of Reglarea activitatii genice (in special la procariote)

  • Curs 9 Genetic

    REGLAREA ACTIVITII GENICE

    Necesitatea reglajului activitii genelor, att n celula procariot ct i n cea eucariot , este

    determinat de faptul c la un moment dat funcioneaz numai o mic parte din totalitatea genelor.

    Astfel, n celula bacterian se aproximeaz c, n condiii determinate de mediu, nu se sintetizeaz

    dect cca 1 % din totalitatea proteinelor structurale i enzimelor pentru care exist informaie genetic

    n genom. Ca urmare, cantitatea de proteine i n special de enzime sintetizate n celule nu este

    constant n timp, ci se afl sub controlul unui mecanism de reglare genetic. n cazul eucariotelor

    superioare, numai cca 7 10 % din secvenele de ADN din genom sunt transcrise n ARN.

    Mecanismele de reglare reprezint deci un sistem de coordonare prin care se face selecia

    adecvat, n raport cu mediul, a informaiei genetice care urmeaz a fi exprimat fenotipic.

    Mesajul selectat reprezint doar o parte din totalul informaiei pstrat i transmis ereditar de

    genom, ceea ce nseamn c exist molecule semnal care controleaz rata de transcriere a unor

    molecule specifice de ARNm (control transcripional). Dup selecia genelor, urmeaz transcrierea

    informaiei genetice purtat de acestea, n vederea sintezelor proteice dup un program codificat de

    gene, apoi realizarea echilibrat cantitativ a acestor sinteze i desfurarea reaciilor ce implic

    activitatea catalitic a proteinelor sintetizate (control translaional). Reglarea activitii genelor,

    intrarea lor n funciune dup un program riguros controlat este evident att la procariote ct i la

    eucariote.

    La eucariote, dezvoltarea i diferenierea celular este legat de transcrierea selectiv a

    informaiei genetice de la nivel celular. La aceste organisme apar diferenieri celulare specifice ce nu

    pot fi explicate dect admind faptul c unele gene funcioneaz permanent, n timp ce altele

    funcioneaz difereniat, n anumite momente specifice ale ontogenezei.

    n sinteza proteinelor exist, n general, dou tipuri de control:

    - Controlul adaptativ este dependent de condiiile de mediu care determin activarea unei

    anumite pri din mesajul genetic (nefolosit pn n acel moment), fcnd s fie sintetizate

    enzimele necesare celulei n acel moment i s fie blocat sinteza enzimelor ce nu sunt

    necesare n momentul respectiv;

    - Controlul programat este indirect influenat de mediu, conducnd la funcionarea constant

    a genelor i la sinteza de proteine n cantitate aproape constant n tot timpul vieii

    organismului respectiv.

    1

  • REGLAREA EXPRIMRII GENELOR LA PROCARIOTE

    Mecanismele de reglare a activitii genelor au fost cel mai bine studiate la bacterii.

    Teoria reglrii genetice la procariote a fost elaborat de geneticienii francezi F. Jacob i J.

    Monod, n 1961. Ei au demonstrat experimental i teoretic c sinteza proteinelor i respectiv a

    enzimelor celulare, nu este constant n timp ci variaz n funcie de necesitile celulei.

    n funcie de mecanismele moleculare i de efectele acestora, procesele de reglare a activitii

    genice pot fi grupate n dou mari categorii: reglare pozitiv i reglare negativ.

    Reglarea pozitiv - reglarea genetic se realizeaz prin activarea unor gene n prezena unei

    molecule efector care poate fi o protein, o molecul activator de mici dimensiuni sau un complex

    molecular. Acest sistem , n anumite situaii, necesit prezena AMPc i a proteinei CRP (proteina

    de legare, receptor, a AMPc), care iniiaz transcrierea genetic.

    n sistemul de reglare negativ n celul este prezent un inhibitor care mpiedic

    transcrierea. Acest inhibitor (represor) interacioneaz cu o anumit regiune plasat n faa

    genelor reglate. Pentru iniierea transcrierii este necesar prezena unui antagonist al inhibitorului,

    numit inductor.

    Reglarea operonului lactozei la Escherichia coli (operonul lac)

    Cercetrile privind reglarea genetic la procariote, au dus la concluzia c genele care acioneaz

    asupra unei ci metabolice nu au o activitate independent ci fac parte din uniti mai mari

    denumite operoni ce funcioneaz coordonat.

    Un operon este o unitate funcional alctuit dintr-o secven de nucleotide ce include: un promotor, un operator i una sau mai multe gene structurale care sunt transcrise ntr-un

    ARNm policistronic (o molecul de ARNm codific pentru mai mult dect o protein).

    Un promotor este o secven de ADN, reprezint situsul de recunoatere a enzimei ARN

    polimeraza care are rol n procesul de iniiere a transcrierii. n sinteza ARN, promotorul indic

    care gene ar trebui utilizate pentru sinteza ARNm, i prin alungire (elongare), controleaz ce

    proteine vor fi sintetizate.

    Un operator este un segment de ADN, care regleaz activitatea genelor structurale din

    cadrul operonului, prin interaciunea cu un represor sau un inductor specific.

    Primul operon, descris de ctre F. Jacob, D. Perrin, C. Sanchez and J. Monod n 1960, a fost

    operonul lac de la Escherichia coli.

    La E. Coli se consider a fi cca 200 de operoni, dintre care numai activitatea unora este mai

    bine cunoscut.

    2

  • Astfel, la E. Coli, posibilitatea utilizrii lactozei din mediu i a metabolizrii ei, se realizeaz

    cu ajutorul a 3 enzime:

    - galactozid permeaza (localizat n membrana celulei bacteriene asigur permeabilizarea

    acesteia, facilitnd trecerea lactozei n celula bacterian) si

    - galactozidaza (localizat n citoplasma bacterian, cliveaz lactoza la glucoz i galactoz

    fig. 1).

    n cadrul metabolismului celular mai intervine tiogalactozid transacetilaza (care n mod

    normal, are rol de acetilare a lactozei i a altor galactozide cu ajutorul acetil- CoA).

    Fig. 1. Lactoza si produsii de clivare

    Sinteza acestor 3 enzime este determinat de 3 gene structurale: lac Z codific -

    galactozidaza , lac Y codific - galactozid permeaza i lac A- codific tiogalactozid transacetilaza.

    n absena lactozei din mediu, genele structurale care determin sinteza celor 3 enzime

    sunt inactive.

    Dac ns se adaug lactoz n mediu, cele 3 gene sunt rapid activate i ncep sinteza celor

    3 enzime. Activitatea celor 3 gene structurale este controlat de o gen reglatoare lac I, care acioneaz

    asupra lor prin intermediul unui represor.

    n absena lactozei, gena reglatoare sintetizeaz o protein represoare care se cupleaz cu un

    segment de ADN denumit operator dispus naintea celor 3 gene structurale, blocnd astfel activitatea

    genelor respective.

    Operonul lac (fig. 2) este alctuit din cele 3 gene structurale (lac Z, lac Y, lac A) i o serie de elemente reglatoare reprezentate de:

    Represor o protein codificat de gena lac I gena reglatoare, situat de regul

    separat de operonul a crei activitate o regleaz; are 2 situsuri de recunoatere: unul

    pentru lactoz i compuii si i altul pentru operonul lactozei.

    3

  • Promotorul (p) reprezentat de o secven de nucleotide care are rol de loc de

    recunoatere pentru enzima ARN polimeraza, determinnd astfel iniierea transcrierii;

    Operatorul (o) o secven de nucleotide care servete ca un situs de recunoatere i

    de legare pentru represorul specific operonului.

    Fig. 2. Operonul lac

    Prin transcrierea operonului lac se formeaz o molecul de ARNm ce copiaz informaia de pe

    catena sens. Acest ARNm policistronic conine mai multe semnale start pentru iniierea traducerii.

    Transcrierea genetic a operonului lac este controlat att pozitiv ct i negativ.

    Inducia, represia i retroinhibiia enzimaticCercetrile privind sinteza celular a enzimelor au dus la descoperirea fenomenelor de inducie

    i represie enzimatic, fenomene opuse ca aciune (antagoniste) i care controleaz cantitatea de

    substane sintetizate.

    Inducia enzimatic este declanat de prezena n mediu a substanei ce trebuie metabolizat (Ex. lactoza) denumit n acest caz inductor.

    n mod obinuit, operonul lac este nefuncional. El este indus s funcioneze de ndat ce

    bacteria este pus pe un mediu cu lactoz. Represorul se combin cu inductorul (substana ce

    trebuie metabolizat), devine inactiv i pierde afinitatea pentru regiunea Operatorului. Starea

    deblocat a operatorului permite accesul ARN polimerazei la genele structurale care ncep s fie

    transcrise sintetizndu-se astfel enzimele corespunztoare (enzime catabolice- ce catalizeaz

    metabolizarea sau degradarea- substratului nutritiv) (Fig. 3a).

    Represia enzimatic este declanat de absena substratului din mediu ( intervine n momentul n care concentraia substratului din mediu scade). Represorul trece din stare inactiv n

    starea activ, se cupleaz cu regiunea operatorului blocnd-o, inhibnd astfel activitatea genelor

    structurale care asigur sinteza enzimelor corespunztoare.

    n mod normal, represorul este inactiv i genele care asigur sinteza enzimelor implicate n sinteza

    unor metabolii eseniali funcioneaz. Atunci cnd ns concentraia unui metabolit esenial depete

    4

  • necesitile celulei, metabolitul (substana sintetizat) formeaz cu represorul un complex activ numit

    corepresor, care blocheaz operatorul i genele corespunztoare (Fig. 3b).

    a) Sistem inductibil

    b) Sistem represibil

    Fig. 3. Reglarea operonului lactozei la Escherichia coli

    De exemplu, la Salmonella typhimurium, genele din operonul his care specific enzimele ce

    intervin n sinteza histidinei, sunt funcionale atunci cnd n celul se afl o concentraie mic de

    histidin. Cnd n celul s-a acumulat o cantitate mare de histidin, expresia acestor gene este represat

    i sinteza histidinei nceteaz. Corepresorul (histidina n cazul operonului his) se cupleaz cu

    represorul (o protein reglatoare) inactiv, care devine activ, blocnd transcrierea operonului his.

    5

  • Retroinhibiia enzimatic denumit i inhibiia prin feedback sau efectul Novick- Szilard, este un alt sistem de control al sintezei proteice prin cantitatea de produs final. Astfel, n cazul

    unui anumit lan metabolic n care intervin mai multe enzime, produsul final n cantitate mare inhib

    moleculele existente ale enzimei care controleaz prima etap a lanului metabolic. Aceasta spre

    deosebire de represia enzimatic care blocheaz sinteza tuturor enzimelor care intervin n lanul

    metabolic respectiv.

    De exemplu, n calea metabolic a histidinei, prima enzim este pirofosforilaza. Cnd concentraia

    histidinei n celul devine prea mare, molecula de histidin se leag la o regiune specific acestei

    enzime, schimbndu-i conformaia sa tridimensional, astfel c enzima devine nefuncional. Cnd

    concentraia de histidin scade, aceasta prsete enzima, care refcndu-i conformaia spaial

    original, redevine activ.

    La E coli s-a observat c prin cultivarea pe un mediu ce conine att glucoz ct i lactoz,

    bacteriile utilizeaz preferenial mai nti glucoza, lactoza rmne nemetabolizat pn cnd n mediu

    nu mai exist glucoza, fenomen numit diauxie. Aceasta nseamn c atta timp ct exist glucoz n

    mediu, genele lac sunt inactivate. Acest mecanism reglator a fost denumit represie prin catabolit.

    Prin urmare, pentru iniierea transcrierii ARNm policistronic, pe lng prezena inductorului mai

    este necesar nc un element. Activitatea acestui element este legat de concentraia glucozei, efectul

    inhibitor al glucozei asupra exprimrii genelor lac fiind indirect. Natura elementului suplimentar

    necesar iniierii transcrierii operonului lac, a fost stabilit recent, acesta fiind reprezentat de proteine

    implicate n reglarea pozitiv a genelor.

    De exemplu, n cazul operonului lac, cnd glucoza este absent, n celul exist o cantitate mare

    din molecula de reglare AMPc (adenozin-monofosfat ciclic). Acest element exist i n cazul celulelor

    eucariote, mai ales la animale, unde regleaz aciunea mai multor hormoni.

    Cnd glucoza este prezent n mediu, nivelul AMPc este sczut. Deasemenea, dac n mediu se

    afl glicerol sau un alt compus care nu poate intra n calea metabolic a glucozei, nivelul AMPc este

    ridicat.

    Tulpinile de E.coli (i multe alte specii de bacterii) sunt capabile s sintetizeze o protein

    specific ce are rolul de receptor pentru AMPc (proteina CRP) codificat de gena crp.

    Proteina CRP, mpreun cu AMPc, formeaz un complex AMPc-CRP care se leag la promotorul

    operonului lac, la nivelul unui situs specific i activeaz transcrierea (fig. 4).

    Sinteza ARNm are loc doar n absena represorului i n prezena complexului AMPc-CRP legat la

    o secven din regiunea promotor.

    In celulele ce conin mutaii n genele crp sau cya nu se poate iniia sinteza ARNm chiar dac

    respectivele celule conin i mutaii lac I- (deci nu se sintetizeaz represor) sau mutaii la nivelul

    regiunii operator care determin sinteza constitutiv a -galactozidazei.

    6

  • Cu toate acestea, s-a dovedit c transcrierea genelor operonului lac se realizeaz i n condiii

    bazale, cu o rat foarte sczut dar activitatea maxim a acestuia necesit ndeplinirea condiiilor

    menionate anterior

    Controlul procesului de traducere al mesajului genetic Cercetrile efectuate asupra operonului lac au evideniat faptul c exist unele diferene n ceea

    ce privete traducerea informaiei purtate de ARNm policistronic, ceea ce sugereaz existena

    i la procariote a unei reglri la nivelul procesului de tranducere.

    Astfel, s-a remarcat faptul c biosinteza celor trei enzime ( -galactozidaz, permeaz i acetilaz) se face n raport molar de 1:1/2:1/5, diferenele datorndu-se reglrii la nivelul

    traducerii. Fenomenul se poate realiza pe dou ci in care gena lac Z este tradus prima.

    Se pare c, n cazul moleculelor de ARNm policistronic, imediat dup sinteza polipeptidului

    codificat de prima gen are loc separarea de ribosomi,

    urmnd s se formeze un nou complex de iniiere la nivelul codonului AUG al celei de-a doua

    gene.

    7

  • Frecvena cu care se realizeaz acest proces este corelat cu probabilitatea reiniierii la fiecare

    codon AUG urmtor.

    Astfel, se formeaz un gradient n cantitatea de polipeptide sintetizate de la captul 5 spre cel 3 al

    ARNm.

    Aceste efect, numit polaritate, se realizeaz n cazul majoritii moleculelor de ARNm

    policistronic. Toate moleculele de ARNm sunt degradate la nucleotide dup cteva runde de

    traducere.

    Degradarea este nceat dar uneori ncepe imediat dup primul eveniment de traducere.

    Degradarea ARNm policistronic ncepe, cel mai frecvent, la nivelul genei lac A, apoi continu

    cu gena lac Y i, abia la sfrit, cu gena lac Z.

    Consecina acestui fenomen este c, la un moment dat, sunt mai multe copii ale genei lac Z

    dect lac Y i, evident, cu mult mai multe dect lac A.

    8