Curs Biochimie 1

101
BIOCHIMIA - studiază chimia vieţii 1833 Anselme Payen descoperă diastaza (amilaza) 1896 Eduard Buchner studiază fermentaţia alcoolică 1903 – Carl Neuberg – “părintele biochimiei”

description

s

Transcript of Curs Biochimie 1

Page 1: Curs Biochimie 1

BIOCHIMIA

- studiază chimia vieţii

1833 – Anselme Payen – descoperă diastaza (amilaza)

1896 – Eduard Buchner – studiază fermentaţia alcoolică

1903 – Carl Neuberg – “părintele biochimiei”

Page 2: Curs Biochimie 1

1950 – James D. Watson, Francis Crick, Maurice Wilkins – structura ADN-ului 1962 premiul Nobel pentru Medicină

1958 – George Beadle, Edward Tatum – rolul genelor premiul Nobel pentru Fiziologie şi Medicină

1988 – Colin Pitchfork – analiza ADN în criminalistică

Page 3: Curs Biochimie 1

BIOCHIMIA

1. Structuri celulare implicate în procesele biochimice

2. Apa – rolul ei în procesele biochimice

3. Macro- şi microelementele cu implicaţii biochimice

4. Enzimele

5. Vitaminele

6. Metabolismul oxidativ

7. Metabolismul glucidic

8. Metabolismul proteic

9. Metabolismul lipidic

10. Acizi nucleici

11. Metabolismul hormonal

Page 4: Curs Biochimie 1

Structuri celulare implicate în procesele biochimice

- celula – unitatea structurală şi de reproducere a organismelor vii

Page 5: Curs Biochimie 1

- membrană semipermeabilă

- asigură schimburile cu exteriorul celulei

- menţine pH-ul celular

- menţine compoziţia constantă a mediului intern şi potenţialul electric

Membrana celulară

Page 6: Curs Biochimie 1

Membrana celulară

Compoziţie

- lipide – fosfolipide, colesterol, glicolipide

- proteine – vehiculante – transportă aminoacizi, ioni, glucoză

- canaliculare – canale hidrofile pentru molecule mici

- receptoare – comunicarea între celule

- enzimatice – au proprietăţi catalitice

- semnalizatoare – markeri individuali

Page 7: Curs Biochimie 1

Reticulul endoplasmatic

- sistem canalicular, anastomozat

- membrană cu strat dublu lipidic

- RE neted – conţine enzime implicate în sinteza glucidelor, fosfolipidelor,

acizilor graşi

- RE rugos – conţine pe suprafaţă ribozomii

Page 8: Curs Biochimie 1

Lizozomii

- formaţiuni granulare sferice, 0,4-1 μm

- conţin enzime: proteaze, nucleaze, fosfataze, glicozidaze, lipaze

- enzime “latente”; pH 5

- “săculeţe de sinucidere”

- lipsa congenitală a unor enzime lizozomale – acumularea substratului

- boala von Gierke – deficit de glucozo-6-fosfatază acumulare de glicogen

- boala Gaucher – deficit de glucocerebrozidază

- boala Tay-Sachs – deficit de hexozaminidază A (β-N-acetil-hexozaminidază) - deficit de glucozo-6-fosfat-dehidrogenază susceptibilitate crescută a hematiilor faţă de oxidanţi

Page 9: Curs Biochimie 1

Peroxizomii

- în cantitate mare în ficat

- conţin enzime ce degradează aa şi AG

- are loc sinteza de H2O2 care este inactivat de catalază

Ribozomii

- liberi sau ataşaţi de RE

- corpusculii lui Palade

- sinteza polipeptidelor şi proteinelor

Page 10: Curs Biochimie 1

Mitocondriile

- 2 membrane lipidice

- membrana externă – enzime implicate în CATC, MAO

- membrana internă – sisteme de transport

- matricea – enzime pentru β-oxidarea AG, CATC

- criste – oxizomi – enzimele lanţului respirator compuşi macroergici

“termocentralele celulelor”

Page 11: Curs Biochimie 1

Aparatul Golgi

- transformă compuşii sintetizaţi în organism

- sortarea proteinelor

- “oficiu poştal celular”

Page 12: Curs Biochimie 1

Nucleul

- membrană lipoproteică dublă

- conţine ADN, ARN, nucleotide, proteine (histone)

- ADN ARNm proteine

Page 13: Curs Biochimie 1

Apa – rolul ei în procesele biochimice

- 45-75% din greutatea corporală

- depinde de: - vârstă

- sex

- adipozitate

- tipul ţesutului

- forme – apa liberă

- apa structurată

- apa legată

- distribuţie – intracelular 55% - K+, PO43-

- extracelular 45% - Na+, Cl-

Page 14: Curs Biochimie 1

Structură moleculară

- tetraedru neregulat

- între molecule există legături de hidrogen

- este un dipol electric

- disociază

H2O H+ + HO-

K =H+ HO-

H2O

Page 15: Curs Biochimie 1

Rol în organism

- structural – în structura celulei, ţesuturilor

- biochimic – reactant, produs de reacţie

- solvent

- mediu transportor

- lubrifiant

- termoreglator

Page 16: Curs Biochimie 1

Sisteme tampon

- menţin pH-ul constant

- compoziţie - acid slab + bază conjugată

- bază slabă + acid conjugat

- ecuaţia Henderson-Hasselbach

pH pKa logbaza conjugata

acid conjugat= +

Page 17: Curs Biochimie 1

Sisteme tampon

- H2CO3 / HCO3-

- Na2HPO4 / NaH2PO4

- preteină / proteinat

- hemoglobină / hemoglobinat

- pH normal = 7,4

- variaţii fiziologice – somn, vârstă

Modificări

pH < 7,3 – acidoză pH > 7,42 – alcaloză

pH = 7 – stare comatoasă pH = 7,6-7,8 – comă

pH = 6,8 – deces pH = 8 - deces

Page 18: Curs Biochimie 1

Macro- şi microelementele cu implicaţii biochimice şi fiziologice

- macroelemente

- microelemente

Sodiu

-142 mEq/L

- distribuţia apei în organism şi reglarea presiunii osmotice

- realizarea echilibrului ionic

- transmiterea inpulsului nervos

- contracţia muşchiului cardiac

Page 19: Curs Biochimie 1

Potasiu

- 3,1- 5,1 mEq/L

- funcţia neuronilor

- contractilitatea musculară

- respiraţia celulară

- activitatea cardiacă

Calciu

- 4,5- 5,3 mEq/L

- reduce excitabilitatea neuromusculară

- reglează secreţia glandelor endocrine

- coagularea sângelui

- activează enzime

- integritatea şi permeabilitatea membranei celulare

Page 20: Curs Biochimie 1

Fosfor

- 0,78-1,51 mmoli/L

- 75% - hidroxiapatita din oase

- 25% - combinaţii organice – fosfolipide, nucleotide, acizi nucleici, compuşi

macroergici

Magneziu

- 1,5- 2,5 mEq/L

- activator enzimatic

- menţine structura ADN, ARN, ribozomi

Page 21: Curs Biochimie 1

Fier

- femei – 0,8-1,3 mg/L

- bărbaţi – 0,9-1,5 mg/L

- structura hemoglobinei, metaloproteinelor (mioglobină, citocromi)

- grupări prostetice ale enzimelor

- induce sau stimulează procesele oxidative

Mangan

- cofactor enzomatic – oxidoreductaze, transferaze, hidrolaze, liaze

- structura SOD

Page 22: Curs Biochimie 1

Seleniu

- structura deiodinazei, glutation-peroxidazei

- protecţie faţă de speciile oxidante

Sulf

- structura tioaminoacizilor, proteinelor

- structura enzimelor – citocrom c oxidaza

- structura unor grupe funcţionale enzimatice – coenzima A

Page 23: Curs Biochimie 1

ENZIME

- enzime sau fermenţi

- proteine sintetizate în celule

- catalizează reacţiile biochimice biocatalizatori

- avantaje faţă de catalizatorii chimici

- viteză mare de reacţie

- condiţii blânde de reacţie – 37oC, p. atm., pH

- specificitate de reacţie

- reglarea directă sau indirectă a activităţii

- catalizează reacţii endoterme prin intermediul unor reacţii

exoterme

Page 24: Curs Biochimie 1

ENZIME

Structura enzimelor

- proteine simple

- heteroproteine – partea proteică – apoproteină (apoenzimă) –

specificitate de substrat

- partea neproteică – cofactor – acţiunea catalitică

- organică (coenzimă),- anorganică (ioni metalici)

- nucleoproteine

Page 25: Curs Biochimie 1

Structura enzimelor

- primară - succesiune de aa

- secundară – orientarea spaţială – leg. de H

- terţiară – leg. disulfidice, ionice, de H, hidrofobe

- cuaternară – complexe tridimensionale; leg. necov, hidrofobe

Situsuri catalitice

Reglarea activităţii enzimatice

Page 26: Curs Biochimie 1

ENZIME

Denumirea enzimelor

- I - substrat + -ază (urează, glucozidază)

- II – natura procesului catalizat + -ază (oxidază, hidrolază, transferază)

- III – Comisia de Enzimologie a Uniunii Internaţionale de Biochimie şi

Biologie Moleculară (IUBMB) – substrat + reacţia + -ază

(glucozo-6-fosfat-dehidrogenază)

- cod EC xxxx

Page 27: Curs Biochimie 1

Denumirea enzimelor

- EC 1.1.1.1. – alcool dehidrogenaza

EC 1. – oxido-reductază

EC 1.1. – acţionează asupra compuşilor cu gr. CH-OH

EC 1.1.1. – NAD+ sau NADP+ este acceptorul de H

EC 1.1.1.1. – NAD+ este acceptorul de H

Page 28: Curs Biochimie 1

Denumirea enzimelor

- EC 2.1.1.1. – nicotinamid-N-metil transferaza

EC 2. – transferază

EC 2.1. – transferă un grup de 1 at. de C

EC 2.1.1. – transferă un grup metil

EC 2.1.1.1. – donorul este metionina

S-adenozil-L-metionina + nicotinamida

S-adenozil-L-homocisteina + 1-metil-nicotinamida

Page 29: Curs Biochimie 1

Localizarea enzimelor

- nespecifică – în toate ţesuturile

- specifică – pepsina, tripsina, H. tiroidieni

- la nivel celular – membrană – GGT

- citoplasmă – glicoliză, sinteza de acizi graşi

- nucleu – ADN-giraza, ADN-polimeraza

- lizozomi – enzime degradative

- ribozomi – sinteza de proteine

- RE – sinteza de glicogen, glicoproteine, CYP 450

- mitocondrii – respiraţia celulară, fosforilarea oxidativă,

MAO, fosfolipaza A2

- aparatul Golgi – procesarea proteinelor

Page 30: Curs Biochimie 1

Proenzime

- zimogeni

- activare prin – hidroliză limitată a unui peptid terminal

- îndepărtarea unui oligopeptid din interiorul moleculei

- metode de activare

- chimică – mediul acid – pepsinogen pepsină

- autocatalitică – tripsinogen tripsină

- catalitică - tripsinogen tripsinaenterokinaza

+

proelastaza elastazatripsina

Page 31: Curs Biochimie 1

protrombina trombina

fibrinogen fibrina insolubila

plasminogen plasmina

fibrina solubila

VII, X

Activatorul tisularal plasminogenului

vitamina K

+

heparina

urokinazastreptokinaza

anticoagulantecumarinice

-

--

+

Page 32: Curs Biochimie 1

Izoenzime

- au aceleaşi proprietăţi enzimatice, dar structură primară uşor

diferenţiată, proprietăţi cinetice şi electroforetice diferite

- sunt specifice enzimelor cu structură cuaternară

- evidenţiate în acelaşi organism

- numerotate în funcţie de proprietăţile electroforetice – 1 .... N

- ex. – lactatdehidrogenaza – LDH1 .... LDH5

CH3-C-COOH NADH H+ CH3-CH-COOH NAD+lactat dehidrogenaza

O

+++

OH

Page 33: Curs Biochimie 1

- creatinkinaza (creatinfosfokinaza) – CPK, CK

- M2, MB, B2

creatina ATPADPcreatin kinaza

++creatin fosfat

Page 34: Curs Biochimie 1

Sisteme multiemzimatice

- asociaţii enzimatice în cadrul unei căi metabolice

Ex. complexul piruvat-dehidrogenaza - piruvat dehidrogenaza

- lipoilreductaz-transacetilaza

- lipoat dehidrogenaza

Page 35: Curs Biochimie 1

Clasificarea enzimelor

- după sistemul IUBMB

1. Oxidoreductaze

2. Transferaze

3. Hidrolaze

4. Liaze

5. Izomeraze

6. Ligaze

Page 36: Curs Biochimie 1

1. Oxido-reductaze

ox1 + red2 red1 + ox2

1. 1. Dehidrogenaze

- H de la grupe funcţionale ( -CH2-OH, -CHO, -CH2-NH2), nucleotide (NADH, NADPH) la substrat în absenţa oxigenului

- oxidare anaerobă

AH2 + B A + BH2

CH3-CH2-OH + NAD+ CH3-CHO + NADH + H+

ADH

Page 37: Curs Biochimie 1

1. 2. Oxidaze

- H de la substrat la oxigen H2O sau H2O2

- oxidare aerobă

AH2 + ½ O2 A + H2O

AH2 + O2 A + H2O2

Page 38: Curs Biochimie 1

1. 3. Oxigenaze

- introduc atomi de oxigen în moleculă

1.3.1. Monooxigenaze (hidroxilaze)

AH + O2 + BH2 A-OH + B + H2O

- CYP 450

- CYP450 (hemoproteină) – substratul şi O2

- NADPH-CYP450 reductaza

- fosfatidilcolinaRH + O2 + 2H+ + 2e– → ROH + H2O

Page 39: Curs Biochimie 1

1.3.2. Dioxigenaze

A + O2 AO2

N

CH2-CH-COOH

NH2

C-CH2-CH-COOH

O NH2NH-CHO

triptofandioxigenaza

+ O2

triptofanN-formil-kinureina

Page 40: Curs Biochimie 1

1. 4. Hidroperoxidaze

- catalaza

H2O2 + H2O2 2 H2O + O2

H2O2 + AH2 2 H2O + A

- superoxid dismutaza (SOD)

O2-.

O2-. ++ 2 H+ SOD + O2H2O2

Page 41: Curs Biochimie 1

2. Transferaze

A + BC AB + C

2. 1. Aminotransferaze

R1-CH-COOH R2-C-COOH R1-C-COOH R2-CH-COOH

NH2

+O O

+NH2

acid aspartic + acid α-cetoglutaric oxal-acetat + acid glutamic TGO

(AST, ASAT)

acid glutamic + acid piruvic acid α-cetoglutaric + α-alanina TGP

(ALT, ALAT)

Page 42: Curs Biochimie 1

2. 2. Kinaze

α-glucoza + ATP glucozo-6-fosfat + ADP

hexozil transferaza

2. 3. Glicoziltransferaze

glu-UDP + -(glu)n-1- glicogen + UDP

hexokinazeI, II, III, IV

Page 43: Curs Biochimie 1

2. 4. Metiltransferaze

S-adenozil-metionina + dopamina

3-metoxi-tiramina + S-adenozil-homocisteina

COMT

serina + acid tetrahidrofolic glicina + metilen tetrahidrofolatserin-hidroximetil

transferaza

Page 44: Curs Biochimie 1

3. Hidrolaze

AB + H2O A-OH + BH

- fosfataze, proteaze, fosfolipaze, tiolaze, lipaze

tripsina

-NH-CH-CO-NH-CH-CO-

R1 R2

H2O+ -NH-CH-COOH H2N-CH-CO-+

R1 R2

proteaza

trigliceride + H2O glicerol + acizi graşilipaza

Page 45: Curs Biochimie 1

4. Liaze

- catalizează eliminarea din molecule CO2, H2O, NH3

CH3-C-COOH +O

CH3-CHO CO2piruvat

decarboxilaza

acid glutamic GABA + CO2

glutamatdecarboxilaza

4. 1. Decarboxilaze

4. 2. Dehidraze

acid citric acid cis-aconitic + H2Ocitrat dehidraza

Page 46: Curs Biochimie 1

5. Izomeraze

- catalizează transformarea izomerilor optici sau structurali

5. 1. Epimeraze (racemaze)

L-serina D-serinaserin racemaza

5. 2. Mutaze

glu-6-fosfat glu-1-fosfatfosfogluco mutaza

Page 47: Curs Biochimie 1

6. Ligaze (sintetaze)

- C-C; C-N; C-S; C-O

acid piruvic + H2CO3 + ATP acid oxal-acetic + ADP + Pa + H2Opiruvat

carboxilaza

acid acetic + CoA-SH + ATP Acetil-CoA + AMP + PP + H2Oacil coenzima A

sintaza

Page 48: Curs Biochimie 1

Centrul activ al enzimei

E + S ES E + P

Etape - recunoaşterea substratului, fixarea substratului

- transformarea substratului

- eliberarea produsului de reacţie

- refacerea enzimei

Centru activ (situs activ) – preformat, după activarea enzimei

-COOH – acid glutamic, acid aspartic, lizină

-OH – serină, tirozină

-SH – cisteină

-heterociclu – histidină

- aminoacizi adiacenţi centrului catalitic

Page 49: Curs Biochimie 1
Page 50: Curs Biochimie 1

Centru activ (situs activ) – format din:

- centrul de recunoaştere

- centrul catalitic

Ex. acetilcolinesteraza

- centru de recunoaştere – centru anionic – COO- din acid aspartic

- centru catalitic (esterazic) - OH din serină, rest histidină

N+-CH2-CH2- O-C- CH3H3C

H3CH3C

Oacetilcolina

Page 51: Curs Biochimie 1

Modelul Fischer (clasic)

Modelul Koshland (centru activ indus)

Page 52: Curs Biochimie 1

Specificitatea enzimelor

- de reacţie – enzima catalizează un singur tip de reacţie

- lactat-dehidrogenaza, glucozo-6-fosfataza

- excepţie – enzime piridoxalfosfat dependente (transaminare,

decarboxilare, aldolizare)

Page 53: Curs Biochimie 1

- de substrat – enzima acţionează asupra unui substrat sau grupuri de

substrate înrudite chimic

- tipuri - absolută – anhidraza carbonică, ureaza, catalaza

- relativă – alcool dehidrogenaza

- largă – hidrolaze, proteaze (tripsina, pepsina)

alcool metilic

etilenglicol

aldehida formica

acetaldehidaADH

alcool etilic

ADH

aldehida glioxilicaADH

Page 54: Curs Biochimie 1

- stereochimică – enzima transformă un singur tip de izomer sau

determină formarea unui tip de izomer geometric sau optic

- proteaze – pentru L-aa

- maltaza – legături α-glicozidice

- lactat dehidrogenaza – acid L-lactic în acid piruvic

- enzime glucolitice – doar izomerii D ai glucozei

- succinat dehidrogenaza – acid succinic în acid fumaric (nu acid maleic)

Page 55: Curs Biochimie 1

Cinetica enzimatică

Energia de activare în reacţiile catalizate enzimatic

- reacţiile enzimatice - exergonice

- endergonice

- substrat activat

- energie liberă de activare – 1 mol substrat la temp. T, în stare de tranziţie

(kcal/mol)

- enzimele reduc energia de activareE

Page 56: Curs Biochimie 1

Creşterea vitezei reacţiei enzimatice

- fixarea substratului optimă pentru atacul enzimatic

- adaptarea indusă a structurii enzimatice

- interacţiunea gr. NH2 sau COOH din centrul catalitic cu substratul

- fixarea covalentă a unei porţiuni de substrat

Page 57: Curs Biochimie 1

Viteza reacţiei enzimatice

E + S E + PESk3

k2

k1

V = m substrat transformat în produs de reacţie / unitatea de timp

Exprimarea vitezei de reacţie

mol/s, mg/s, mol/min, mg/min

Nr de turnover = nr. molec substrat transf de 1 moleculă de enzimă în 1 s

UI = cantit de enzimă care transformă 1 μmol substrat, la 25oC, pH optim

Katal = cantit de enzimă care transformă 1 mol substrat în 1 s

Page 58: Curs Biochimie 1

Factori care influenţează activitatea enzimatică

- mediu – temperatură, pH- substrat - concentraţia- enzimă – concentraţia- produşi de reacţie

Influenţa temperaturii

- pozitiv – modifică energia liberă de activare reduce durata reacţiei

- temperatura optimă

- negativ – afectarea structurii proteice a enzimei

Page 59: Curs Biochimie 1

Influenţa pH-ului

- pH optim – acid (pepsina, enzime lizozomale), neutru, bazic (tripsina,

chimotripsina)

-modificarea pH-ului

- modificarea gradului de ionizare a grupelor funcţionale

- denaturarea structurii proteice

- ionizarea substratului

Page 60: Curs Biochimie 1

Influenţa concentraţiei enzimei

v = k · [E]

v = [P] / tk · [E] = [P] / t [E] = [P] / k · t [E] ~ [P]

Page 61: Curs Biochimie 1

Influenţa concentraţiei substratului

E + S E + PESk3

k2

k1

v1 = k1 · [E] · [S]

v2 = k2 · [ES]

v0 = k3 · [ES]

v1 = v2 + v0

k1 · [E] · [S] = k3 · [ES] + k2 · [ES]

k1 · [E] · [S] = [ES] (k2 + k3)

[E] [S]

[ES]k2 + k3

k1

.=

[E] [S]

[ES]=KM

KM

Page 62: Curs Biochimie 1

[E] = [ET] – [ES]

[E] [S]

[ES]=KM

( [ET] - [ES] ) . [S]

[ES]=KM KM · [ES] = [ET] [S] – [ES] [S]

KM · [ES] + [ES] [S] = [ET] [S]

[ET] [S][ES] =

KM + [S]

v0 = k3 · [ES]

[ET] [S]=

KM + [S]vo k3

vmax = k3 [ET]

vmax[S]

=KM + [S]

vo

ecuaţia Michaelis-Menten

Page 63: Curs Biochimie 1

[S] foarte mică faţă de KM vmax[S]

=KM

vo

[S] foarte mare faţă de KM

vo ~ [S]

vo ~ vmax

[S] = KM vo =vmax

2

Page 64: Curs Biochimie 1

Ecuaţia Lineweaver-Burk

vmax . [S]=

1

v1

+KM

vmax

Page 65: Curs Biochimie 1

Reacţii enzimatice cu mai multe substraturi

- participă mai multe substraturi

E + A + B E + C + D

Mecanisme

1. tip ping-pong

E + A EA E + C

+ B EB E + D

Page 66: Curs Biochimie 1

- ex. reacţiile de transaminare

E-CHO AA1-NH2+

E-CH2-NH2

CHOE

AA1-NH2

CH2-NH2ECA1

CA1

+ CA2 CH2-NH2ECA2

CHOE

AA2-NH2

E-CHO + AA2-NH2

Page 67: Curs Biochimie 1

2. tip secvenţial

2.a. ordonat

E + A EA

2.b. aleatoriu

+ B EAB ECD - C EED - D

E + A EA

E + B EBEAB ECD

ED- C

- D EC E

E- D

- C

Page 68: Curs Biochimie 1

Modificarea activităţii enzimatice

- inducţie enzimatică

- inhibiţie enzimatică

Inhibiţia enzimatică

- reversibilă – competitivă, necompetitivă, uncompetitivă

- ireversibilă

Page 69: Curs Biochimie 1

1. Inhibiţia competitivă

- substratul şi inhibitorul se fixează pe centrul activ

E + S ES E + P

E + I EI

Page 70: Curs Biochimie 1

- condiţii

S şi I au afinitate pentru centrul activ

ex. - competiţie PABA, sulfamide

reacţii enzimatice cu 2 substraturi

acid malonicacid malicacid oxalic

acid succinic acid fumaricsuccinat dehidrogenaza

-

acid aspartic + acid α-cetoglutaric oxalacetat + acid glutamic TGO

(AST, ASAT)

Page 71: Curs Biochimie 1

reacţii reversibile

cofactorii metalici – Ca2+, Mg2+

R-O-PO3H2 R-OH + H3PO4 fosfatazaalcalină

Page 72: Curs Biochimie 1

2. Inhibiţia necompetitivă

- S şi I se fixează pe centri diferiţi

E ESI

+S ES

E + P+I EI +S

+I

- ex. - ioni ai metalelor grele – gr. SH

- chelatarea cationilor din centrul activ

Page 73: Curs Biochimie 1

3. Inhibiţia uncompetitivă

E + S ES ESI +I

Page 74: Curs Biochimie 1

4. Inhibiţia ireversibilă

E + I EI

- ex. - agenţi alchilanţi

- compuşi organofosforici

- agenţi anticoagulanţi

- α1-antitripsina

Page 75: Curs Biochimie 1

Utilizarea inhibitorilor în medicină şi farmacie

- medicamente

- antivirale - aciclovir

- antibiotice β-lactamice – peniciline, cefalosporine

- anticanceroase - metotrexat

- diuretice – inhibitoare ale anhidrazei carbonice

- antiinflamatoare – COX1 (AAS), COX2

- antihipertensive – IEC (captopril)

- antidepresive – IMAO (fenelzina)

- antiglaucomatoase, miastenia gravă – anticolinesterazice

- hipocolesterolemiante – I-HMG-CoA-reductaza (simvastatin)

- antidot - alcool

Page 76: Curs Biochimie 1

Reglarea activităţii enzimatice

Reglarea activităţii prin:

- sinteza de proenzime

- legare covalentă

- enzime alosterice

- enzime constitutive

- enzime inductibile

Page 77: Curs Biochimie 1

Legare covalentă

- activitatea enzimei este controlată prin fixarea sau îndepărtarea unor

grupe de atomi

- ex. - fosforilare – defosforilare

- metilare – demetilare

- acetilare – deacetilare

- adenilare – deadenilare

- proteoliză parţială – tripsinogen tripsină

fosfataza

+ ATP- ADP

+ H2O-H3PO4

kinaza

E-OH E-O-PO3H2

Page 78: Curs Biochimie 1

Enzime alosterice

- interacţiune necovalentă cu liganzi în centri diferiţi de centrul activ

- catalizează reacţii dintr-o cale metabolică

- conţin 2 centri – activator, inhibitor

- nu respectă ecuaţia Michaelis-Menten

- interacţiunile cu liganzii

- homotrope

- heterotrope 2 tipuri – K – KM se modifică, vmax constant

- V - KM constant, vmax se modifică

Page 79: Curs Biochimie 1

Modele structurale pentru interacţiunea enzimă-ligand

a. simetric (concertat) (MWC)

Page 80: Curs Biochimie 1

b. secvenţial

Page 81: Curs Biochimie 1

Aplicaţiile enzimelor în medicină şi farmacie

1. Reactivi analitici - dozarea medicamentelor - dozarea compuşilor endogeni: glucoza, uree, acid uric - dozarea unor compuşi exogeni – alcool - tehnica ELISA

2. Agenţi terapeutici

- streptokinaza, urokinaza

- reptilase (Bothrops atrox, Bothrops jararaca)

- hialuronidaza

- asparaginaza

- enzime proteolitice – tripsina, chimotripsina

Page 82: Curs Biochimie 1

3. Indicatori paraclinici

- AST, ALT - cresc în infecţii virale hepatice, ALT persistă mai mult

- infarct miocardic – creşte AST

- distrofie musculară – creşte AST

- CPK (CK) - creşte – copii, afecţiuni musculare, hipertermia malignă

- CK2 şi CK3 crescute - afecţiuni miocardice, transplant

- CK1 crescut - leziuni cerebrale, neurochirurgie

- fosfataza alcalină - creşte - obstrucţia căilor biliare, afecţiuni ale oaselor

Page 83: Curs Biochimie 1

- amilaza – creşte în pancreatita acută, traumatisme abdominale, radiografie

abdominală

- lipaza - creşte în pancreatita acută

- scade - steatoree

- colinesteraza - scade în hepatită, ciroză, infecţii acute, infarct miocardic,

intoxicaţii cu insecticide organofosforice

- creşte în tumori cerebrale

- deficit – apnee după suxametoniu

- fosfataza acidă – creşte în cancerul de prostată

Page 84: Curs Biochimie 1

Coenzime

- anorganice - ioni metalici - organice - nevitaminice - vitaminice

1. Coenzime anorganice

- ioni metalici - stabilizează structura, în centrul catalitic

- tipuri de enzime - metaloenzime - metalul este fixat pe proteină – SOD,

anhidraza carbonică

- metaloporfirine – citocromi

- metaloflavine – xantinoxidaza

(2Mo, 8Fe, 2FAD)

- enzime activate de metale (amilaza salivară – Ca2+;

carboxilaze – Mn2+, ureaza – Ni2+)

Page 85: Curs Biochimie 1

hem B hem A

2. Coenzime organice nevitaminice

Hemul – A, C, M, L

hem C

- grupare prostetică – citocromi a, c; catalază, peroxidază

- donori sau acceptori de e-

Fe2+ Fe3+ -e-

+e-

Page 86: Curs Biochimie 1

- hem L - lactoperoxidază

- hem M - mieloperoxidază

Page 87: Curs Biochimie 1

Coenzima Q (ubiquinona)

- descoperită în 1957

- surse - endogenă - sintetizată în organism din tirozină şi acetil-CoA

- exogenă – alimente (macrou, hering, inimă de porc) ( 14-32%)

- localizare - membrana mitocondrială, RE, peroxizomi, lizozomi

O

O

H3CO

H3CO

CH3

(CH2-CH=C-CH2)10-H

CH3

Page 88: Curs Biochimie 1

- absorbţie – ca şi vitaminele liposolubile

- transportor de hidrogeni

- acţiune antioxidantă – cancer, boli neurodegenerative, migrenă

FADH2O

O

H3CO

H3CO

CH3

ROH

OH

H3CO

H3CO CH3

R

FMNH2 FMNFAD

citocromi

2Fe2+ 2Fe3+2H+

Page 89: Curs Biochimie 1

Acidul lipoic

(CH2)4-COOH

S S+ R-CHO

(CH2)4-COOH

SH S-CO-R

+ CoA-SHFADH2

CoA-S~CO-R(CH2)4-COOH

SH SH

FAD

- aciltransferaza, piruvat-dehidrogenaza

Page 90: Curs Biochimie 1

Tetrahidrobiopterina

CH-CH-CH3OH OH

CH3H2N

O H

H

HCH-CH-CH3OH OH

CH3H2N

O

H

H2O

fenilalanina tirozina

NADP+ NADPH + H+

TH-biopterinaDH-biopterina

N

N

N

N

N

N

N

N

O2

- fenilalanin-4-hidroxilaza

- tratamentul fenilcetonuriei (Sapropterin)

Page 91: Curs Biochimie 1

S-adenozil-metionina

OH OH

HOOC-CH-CH2-CH2-S-CH2

ONH2

CH3 N

N N

N

NH2

- metiltransferaze

- sinteza poliaminelor: spermina şi spermidina

noradrenalină adrenalină

Page 92: Curs Biochimie 1

OH OH

CH2-O-P-O-P-O-P-O-

NH2

O

O- O- O-

OOO

N

N

N

N

ATP

- transfer de fosfat, pirofosfat, adenil

Page 93: Curs Biochimie 1

Vitamine

- liposolubile – A, D, E, K

- hidrosolubile – B1, B2, B3 (niacina), B5 (acid pantotenic), B6, B7

(biotina), B9 (acid folic), B12, C

Page 94: Curs Biochimie 1

Vitamina A

retinal (all-trans retinal)

CHO

CH3

H3C CH3

retinol

CH2-OH

CH3

H3C CH3

11-cis-retinal

CH3

H3C CH3

H3C

CHO

acid retinoic

COOH

CH3

H3C CH3

- derivat poliizoprenic

- lichid uleios, insolubilă în apă, solubilă în solvenţi organici

- UV – fluorescenţă verzuie

- 1917 - descoperită, 1947 - sintetizată

Page 95: Curs Biochimie 1

- surse – retinilesteri, caroteni

- ficat 6500 μg, morcov 835 μg, brocoli frunze 800 μg, unt 684 μg

- ouă 140 μg, piersici 96 μg

- Momordica cochinchinensis, uleiul de palmier

Page 96: Curs Biochimie 1

beta-caroten oxidare retinol

retinilesteri

acizi grasi

+ H2O

mucoasaintestinala

+ acid palmitic acid stearic

retinilesteri

chilomicroni

efectebiologice

ficat

depozitare

+ H2O

retinol

retinol-RBP

+ RBP

celule

fixarepe receptori(CRBP, CRABP)

contraceptive+

Page 97: Curs Biochimie 1

beta-carotenCH3

H3C CH3

CH3H3C

H3C

caroten-dioxigenaza

retinal (all-trans retinal)

CHO

CH3

H3C CH3

retinol

CH2-OH

CH3

H3C CH3

acid retinoic

COOH

CH3

H3C CH3

- abs. 30-35%

Page 98: Curs Biochimie 1

Efecte biologice

- necesar zilnic – 1 mg retinol, 6 mg β-caroten (sex, vârstă, starea fiziol.)

- retinol, acid retinoic – creşterea şi diferenţierea celulelor (RAR, RXR)

- menţinerea integrităţii epiteliului

- vedere

- acid retinoic – acnee, psoriazis

- retinilfosfat – tranferul resturilor glicozil

opsina

rodopsina lumina

retinal izomeraza

+ 11-cis retinalall-trans retinal

11-cis-retinol

întuneric

impulsnervos

opsina

Page 99: Curs Biochimie 1

- anticanceros – reduc rata diviziunii celulare

- antioxidant – prin beta-caroteni

Deficit de vitamina A - cauze

- aport insuficient

- tulburări de absorbţie

- tulburări de depozitare în ficat

- creşterea eliminării renale

- carenţa de proteine

- expunerea la oxidanţi

Page 100: Curs Biochimie 1

Deficit de vitamina A – simptomatologie

250.000-500.000 cazuri de orbire la copii

- xerodermie

- nictalopie

- xeroftalmie

- ulceraţii ale corneei

- retinita pigmentară

- spoturi Bitot

- anemie

- reducerea rezistenţei la infecţii, HIV

Page 101: Curs Biochimie 1

Hipervitaminoza A

- niveluri plasmatice = 10 x necesarul zilnic

- intoxicaţia acută – dureri abdominale, greţuri, vomă, cefalee, ameţeli,

descuamarea pielii

- intoxicaţia cronică – dureri osoase, articulare, căderea părului, uscăciune şi

fisuri ale buzelor, anorexie, hipertensiune

intracraniană benignă, hepatomegalie

- exces de caroten – colorarea tegumentelor în galben

- risc de malformaţii la derivaţii de sinteză