Curs 1 Enzime

7
06/04/2013 1 ENZIME Definiție dpdv funcțional si structural Proprietățile generale ale catalizatorilor Proprietățile specifice enzimelor Caracterizare structurală Centrul activ Specificitatea pentru substrat Specificitatea de reacție Clasificare Nomenclatură Factorii care influențează viteza reacțiilor enzimatice –Concentrația enzimei –Concentrația substratului pH-ul Temperatura –Prezența activatorilor & inhibitorilor Enzime - Definiţie Dpdv funcţional = catalizatori ai reacţiilor care au loc în organismele vii = biocatalizatori. Dpdv structural = apoenzimă + cofactor enzimatic = holoenzimă proteină ion anorganic sau micromoleculă organică

Transcript of Curs 1 Enzime

  • 06/04/2013

    1

    ENZIME

    Definiie dpdv funcional si structural

    Proprietile generale ale catalizatorilor

    Proprietile specifice enzimelor

    Caracterizare structural

    Centrul activ

    Specificitatea pentru substrat

    Specificitatea de reacie

    Clasificare

    Nomenclatur

    Factorii care influeneaz viteza reaciilor enzimaticeConcentraia enzimei

    Concentraia substratului

    pH-ul

    Temperatura

    Prezena activatorilor & inhibitorilor

    Enzime - Definiie

    Dpdv funcional

    = catalizatori ai reaciilor care au loc n organismele vii = biocatalizatori.

    Dpdv structural

    = apoenzim + cofactor enzimatic = holoenzim

    protein ion anorganic saumicromolecul organic

  • 06/04/2013

    2

    Catalizatori Proprieti generale

    Reduc energia de activare (Ea) i consecutiv

    mresc numrul ciocnirilor eficace dintre reactani

    => mresc viteza de reacie

    Ea = 18 Kcal/mol n absena catalizatorului

    Ea = 11,7 Kcal/mol n prezena platinei

    Ea = 5,5Kcal/mol n prezena catalazei

    H2O2 + H2O2 H2O + O2

    Efectul catalizatorului asupra reactiei exoterme X + Y Z n prezena catalizatorului se parcurge o cale diferit, care corespunde la o energie de activare (Ea) mai mic

    Rezultatul final si variatia energiei libere (G) sunt aceleasi.

    Ex.

    Catalizatori Proprieti generale

    n cazul reaciilor reversibile mresc, n aceai msur, viteza

    reaciilor de sens contrar, deci crete viteza de atingere a

    echilibrului fra a se modifica poziia lui.

    A B

    10010

    10==

    8

    6

    2

    1

    k

    kK 100

    10

    10==

    4

    2

    2

    1

    k

    kK

    n absena catalizatorului n prezena catalizatorului

    n prezena catalizatorului echilibrul se atinge de 104 ori mai repede.

    k1

    k2

  • 06/04/2013

    3

    Particip direct la reacie

    La sfritul reaciei se regsesc n forma icantitatea iniial

    Sunt necesari n cantitate mic

    Catalizatori Proprieti generale

    Enzime Proprieti specifice

    Capacitate catalitic superioar catalizatorilor clasici

    H2O2 + H2O2 H2O + O2

    Ea = 5,5Kcal/mol n prezena catalazeiEa = 11,7 Kcal/mol n prezena PtEa = 18 Kcal/mol n absena catalizatorului.

    Mresc viteza reaciilor > 106 ori.

    CO2 + H2O H2CO3

    Viteza reactiei catalizate de anhidraza carbonica creste de 107 ori,

    Fiecare molecul de enzim sintetizeaz 105 molecule de H2CO3 per secund

  • 06/04/2013

    4

    Catalizeaz un anume tip de reacie

    => prezint specificitate de reacie

    Acioneaz asupra unui anume compus chimic (substrat), => prezintspecificitate pentru substrat

    Sunt specifice att n raport cu reactantul ct i cu produsul de reacie =>nu se formeaz produi secundari

    Acioneaz n condiii blnde (t

  • 06/04/2013

    5

    Activitatea lor este reglabil, poate fi mrit sau micoratprin aciunea unor substane diferite de substratele lor, numite activatori, respectiv inhibitori

    Pot cataliza transformarea unui tip de energie n alt tip

    de energie

    Ex.

    Transformarea energiei chimice (nmagazinat sub form de ATP) n

    energie mecanic (contracia muscular)

    Enzime Proprieti specifice

    Enzime Caracterizare structural

    Caracterizarea apoenzimei

    Are o structur tridimensional (conformaie nativa) globular la nivelul creia se disting

    aminoacizii de contact, care alctuiesc centrul activ

    Regiunea din apoenzim responsabil de legarea i transformarea substratului se numete centru activ

    Unele enzime au pe lng centrul activ i unul sau mai muli centrii allosterici care dei nu intervin direct n cataliz pot influena activitatea catalitic a enzimei (vezi enzimeallosterice)

    Caracterizarea cofactorului enzimatic

    Din punct de vedere structural poate fi anorganic (ion metalic) sau organic

    Cofactorul organic este denumit coenzim sau grupare prostetic, n funcie de tipullegturii cu apoenzima

    Coenzim legtura cu apoenzima = slab i tranzitorie

    Grupare prostetic legtura apoenzima = puternic i permanent

  • 06/04/2013

    6

    Enzime - Centrul activ

    DefinitieCentrul activ = o zon din structura spaial a apoenzimei care este responsabil de legarea itransformarea substratului.

    Caracterizare

    - reprezint o parte relativ mic din volumul total al apoenzimei (< 10 Aa)

    - este o entitate tridimensional (format din Aa situai n diferite zone ale secvenei apoenzimei)Ex. Lizozim = 129 Aa

    centrul activ = Aa din poziiile 35,52,62,63 i 101

    => c prin distrugerea structurii spaiale a apoenzimei (denaturare) enzima se inactiveaz.- uneori poate fi alcatuit din radicali ai Aa care aparin mai multor lanuri polipeptidice adiacente.

    - majoritatea radicalilor aminoacizilor sunt nepolari. Ei formeaz un buzunar hidrofob, cu o constant dielectric mic, care faciliteaz interaciunile de tip electrostatic ntre puinele grupriionice ale centrului activ i substrat.

    - este alctuit din centrul de legare (Aa implicai n legarea substratului) i centrul catalitic (Aapolari implicai n transformarea substratului)

    - poate avea o conformaie rigid, complementar conformaiei S (modelul Fischer lock & key), sau flexibil, care se adapteaz conformaiei S (modelul Koshland induced-fit)

    Formarea complexului ES

    Modelul Fischer cheie-broasc

    Centrul activ are o conformaie rigid, complementar conformaiei S

  • 06/04/2013

    7

    Formarea complexului ES

    Modelul Koshland potrivire indus

    Centru activ are o conformatie flexibil, care se adapteaz conformaiei S