94215661-ChDen3
-
Upload
anegroaei-roxana -
Category
Documents
-
view
41 -
download
0
Transcript of 94215661-ChDen3
AMINOACIZII
În natură există mai mult de o sută de aminoacizi, dar acest
capitol se va limita la caracterizarea a unui sfert din aceştia care sunt cei
mai importanţi în biologia mamiferelor şi bacteriilor. Dintre aceştia toţi
sunt constituenţi ai proteinelor, cu excepţia a patru sau cinci. Toţi
aminoacizii care formează proteinele au gruparea –NH2 legată de
atomul de carbon alăturat grupării –COOH. Din acest motiv aceşti
aminoacizi se numesc aminoacizi (atomii de carbon sunt denumiţi
, etc. începând cu carbonul de care se leagă gruparea –COOH
1.Clasificarea aminoacizilor
O clasificare făcută în funcţie de structura chimică împarte aminoacizii în 6 clase:
monoamino-monocarboxilici, diamino-monocarboxilici, monoamino-dicarboxilici,
hidroxiamino-acizi, tioamino-acizi şi ciclici. Cea mai utilizată clasificare a celor 20 de
aminoacizi proteinogeni ţine cont de polaritatea radicalilor R ai acestora. Utilitatea acestei
clasificări rezidă din tendinţa proteinelor aflate în soluţie apoasă să adopte acele conformaţii
(aranjamente spaţiale ale atomilor constituenţi) în care radicalii hidrofili (polari) se orientează
în aşa fel încât să fie hidrataţi, iar radicalii hidrofobi ( nepolari) se orientează astfel încât să
excludă contactul lor cu moleculele de apă.
A)Aminoacizii proteinogeni.
Analiza unui mare număr de proteine a arătat că ele sunt compuse din resturile a 20 de
aminoacizi care participă la biosinteza lor. Aceşti aminoacizi se numesc proteinogeni sau
"standard". Cu excepţia prolinei toţi ceilalţi sunt -aminoacizi având structura generală R-
CH(NH2)–COOH. Cu excepţia glicinei, după cum rezultă din structura generată, la toţi ceilalţi
aminoacizi atomul de C este asimetric.
1. Aminoacizii cu radicali nepolari.
1. Glicina; Gly; G; Acid aminoacetic. Numit şi glicocol acest aminoacid
are cel mai mic radical, un atom de hidrogen. Glicina constituie o treime din
radicalii aminoacizilor din structura colagenului şi a gelatinei care este produs
al hidrolizei parţiale a colagenului. Organismul sintetizează glicina şi, în afara
biosintezei proteinelor, ea serveşte la sinteza sărurilor biliare primare, a bazelor purinice ş.a.
Glicina este un neurotransmiţător inhibitor. Ea participă la detoxifierile hepatice. Datorită
volumului său mic, radicalul opune cea mai mică piedică sterică pentru radicalii vecini,
particularitate importantă pentru stabilitatea moleculei de colagen.
1
COOH
H
C
C
C
C
H2N
H C
NH3+
COO-
H
2. Alanina; Ala; A; Acid -aminopropionic. Cu excepţia prolinei toţi
aminoacizii proteinogeni pot fi consideraţi ca derivaţi ai alaninei. Organismul
sintetizează alanina iar prin transformările pe care le suferă în celulă, ea face
legătura dintre metabolismul proteic şi glucidic.
3. Valina; Val; V; Acid -aminoizovalerianic. Ovalbumina,
cazeina şi globulinele sanguine sunt proteine bogate în valină. În cursul
evoluţiei lor anumite forme de viaţă au pierdut capacitatea de sinteză a
unor aminoacizi. Omul nu poate sintetiza valina şi prin urmare ea este
indispensabilă în alimentaţia lui. Din acest motiv valina se numeşte aminoacid esenţial.
Aminoacizii pe care organismul uman îi poate sintetiza în suficientă cantitate pentru a acoperi
necesităţile organismului se numesc neesenţiali. Aminoacizii a căror biosinteză nu acoperă
necesităţile se numesc semiesenţiali.
4. Leucina; Leu; L; Acid -aminoizocaproic. Este prezentă
în cantităţi însemnate în structura globulinelor. Leucina este un
aminoacid esenţial organismul fiind capabil să o transforme în
compuşi numiţi corpi cetonici. Are o mică solubilitate în apă. În
smalţul incisivilor centrali, de la fătul uman s-a reuşit izolarea leucinei în cantităţi apreciabile.
Leucină s-a identificat şi într-un peptid izolat din smalţul imatur de bovine.
5. Izoleucina; Ile; I; Acid -metil-,-aminovalerianic. Este un izomer de catenă al
leucinei, aminoacid esenţial care ca şi leucina are o mică
solubilitate în apă datorită caracterului hidrofob al
radicalului. În cazul aminoacizilor prezentaţi până acum,
acest caracter se intensifică începând cu glicina şi terminând
cu leucina şi izoleucina care au cei mai voluminoşi radicali. Izoleucina conţine doi atomi de
carbon asimetrici.
6. Metionina; Met; M; Acid -amino-S-
metiltiobutiric. Se găseşte în cantităţi însemnate în
cazeină. În organism joacă un rol important ca
donator de grupări metil, în reacţia de transmetilare.
Favorizează transformarea grăsimilor insolubile în lecitine mai solubile împiedicând
degenerescenţa grasă a ficatului. Participă la hematopoeză şi la detoxifierile hepatice.
Metionina este un aminoacid esenţial, principală sursă de sulf organic pentru organism.
7. Prolina; Pro; P; Acid pirolidin--carboxilic. Este un -aminoacid cu grupare amino
secundară care face parte din categoria aminoacizilor la care un atom
2
H C
NH3+
COO-
CH3
H C
NH3+
COO-
CHCH3
CH3
H C
NH3+
COO-
CH2 CHCH3
CH3
H2
H2
H2
H
C
CCC
N
-OOC
H
din grupările funcţionale participă la închiderea unui ciclu. Structura rigidă, fără libertate de
rotaţie a ciclului prolinei în jurul legăturilor peptidice prin care el este inserat în catena
polipeptidică, influenţează puternic panta de încolăcirea, specifică, a colagenului. Prolina este
un aminoacid neesenţial. Ea a fost identificată în proteinele izolate din smalţul matur cât şi în
smalţul imatur al fătului, unde reprezintă un sfert din totalul de resturi de aminoacizi ai
proteinei izolate.
8. Fenilalanina; Phe; F. Este prezentă în aproape toate proteinele cunoscute. Cele mai
bogate în fenilalanină sunt ovalbumina, cazeina, colagenul.
Radicalul ei are o pronunţată hidrofobicitate. Este un aminoacid
esenţial, principală sursă de nuclee benzenice pentru organism.
9. Triptofanul; Trp; W; Acid -amino--
indolilpropionic. Acest aminoacid are un nucleu
heterociclic numit indol. Se găseşte în aproape toate
proteinele iar în organism serveşte la sinteza serotoninei,
vitaminei PP ş.a. Triptofanul este un aminoacid esenţial,
lipsa lui din alimentaţie determinând grave tulburări. Ca şi în cazul fenilalaninei, radicalul său
este foarte hidrofob.
B) Aminoacizii cu radicali polari.
1. Serina; Ser; S; Acid -amino--hidroxipropionic. Este prezentă în proporţie mare în
sericină (proteina mătăsii naturale). Joacă un rol important în centrul
activ al enzimelor numite serin-enzime. O concentraţie mare de serină
s-a găsit în proteinele din smalţul dinţilor şi pare să fie o caracteristică
a proteinelor din smalţul matur. Rolul posibil al serinei este că de ea
legă o grupare fosfat care este iniţiatoarea formării cristalelor anorganice din smalţ. De
asemene în fosfoproteinele din dentină, serina şi fosfoserina au o pondere importantă. Tot de
această grupare (OH) se leagă covalent oligozaharidele (catene de monozaharide sau derivaţi
ai lor, cu număr mic de subunităţi) la catena polipeptidică din structura glicoproteinelor.
Organismul sintetizează serina din glicină şi o foloseşte chiar şi pentru sinteza unor lipide
(fosfatidilserine).
2. Treonina; Thr; T; Acid -amino--hidroxibutiric. Omolog
superior al serinei, treonina joacă un rol similar cu al acesteia în
centrul activ al. enzimelor. Este, de asemenea, centru de legare a
oligozaharidelor în glicoproteine. Treonina este un aminoacid esenţial
şi conţine doi atomi de carbon asimetrici.
3
H C
NH3+
COO-
CH2
H C
NH3+
COO-
CH2
N
H C
NH3+
COO-
CH2 OH
3. Asparagina; Asn; N; Acid -amino--amidosuccinic.
Este amida acidului aspartic. Gruparea amidică poate fi locul de
legare covalentă a oligozaharidelor în glicoproteine. Asparagina
este mai răspândită în proteinele vegetale decât în cele animale.
Gruparea amidică, deşi nu are caracter acid, poate participa la formarea legăturilor de
hidrogen. Este un aminoacid neesenţial. Grupare amidică hidrolizează transformându-se în
grupare carboxil şi rezultând acid aspartic, din acest motiv când nu se poate preciza care
dintre radicalii celor doi aminoacizi se află într-o poziţie pe catena polipeptidică, se indică
prescurtarea Asx sau B.
4. Glutamina; Gln; Q; Acid -amino--
amidoglutaric. Este omologul superior al asparaginei.
Participă la fel ca şi asparagina la legături de hidrogen.
Este un aminoacid neesenţial. În caz de incertitudine se
simbolizează cu Glx sau Z. Glutamina este forma detoxifiată de transport a amoniacului
metabolic.
5. Tirozina; Tyr; Y; p-Hidroxifenilalanină. Este un
aminoacid cu o largă răspândire în structura proteinelor.
Tirozina joacă un rol important în centrul activ al
enzimelor unde funcţionează ca donor de protoni.
Organismul o sintetizează prin hidroxilarea fenilalaninei şi prin urmare este un aminoacid
neesenţial. Tirozina serveşte la sinteza unor compuşi cum sunt catecolaminele, hormonii
tiroidieni, melaninele. Alături de leucină se întâlneşte în polipeptidele din smalţul matur uman
şi în smalţul bovinelor. De asemenea, tirozina intră în compoziţia colagenului.
6. Cisteina; Cys; C; Acid -amino--tiopropionic. Se găseşte
în mari cantităţi în keratine. Gruparea tiol a cisteinei este uşor
oxidabilă, chiar şi cu oxigen molecular transformându-se prin
formarea unei punţi disulfurice în cistină. Puntea disulfurică poate
lega catene polipeptidice diferite ca de pildă în keratine, sau poate produce plierea unei
singure catene ca în cazul ribonucleazei (enzimă care catalizează hidroliza ARN). Capacitatea
de a se oxida a cisteinei, face ca ea sau unii compuşi care o conţin, ca de exemplu glutationul ,
să participe la procesele oxido-reducătoare din celule. Cisteina joacă un rol important în
centrul activ al tiol-enzimelor. Atomii de sulf tiolic reacţionează cu metalele grele (mercur,
plumb ş.a.) ceea ce explică otrăvirea tiol-enzimelor cu aceste metale. Datorită solubilităţii
4
H C
NH3+
COO-
CH2 CO
NH2
H C
NH3+
COO-
CH2 CH2 CO
NH2
H C
NH3+
COO-
CH2 OH
H C
NH3+
COO-
CH2 SH
reduse, în situaţii patologice, cisteina se poate acumula în calculi vezicali sau renali. Cisteina
este un aminoacid neesenţial.
7. Lizina; Lys; K; Acid -
diaminocaproic. Este prezentă în aproape
toate proteinele cunoscute de origine
animală. Lizina joacă un rol important în
procesele de creştere, lipsa ei în dietă provoacă tulburări ale acestora. Este un aminoacid
esenţial: Bazicitatea grupării -amino, face ca, în condiţii fiziologice (t = 37°C; pH = 7,4),
această grupare să fie protonată, ceea ce conferă radicalului lizinei sarcina electrică pozitivă
(q = +1 u.e.s.). Datorită sarcinii şi reactivităţii ei, această grupare asociază sau leagă
coenzimele la catena polipeptidică a enzimelor.
8. Arginina; Arg ;R; Acid -
amino--guanidinovalerianic. Prin
hidroliză aginina produce un acid -
diamino-monocarboxilic, ornitina,
implicată în ciclul ureogenetic. Arginina alături de ornitină participă la transformarea
amoniacului metabolic în uree (ureogeneza). Arginina este principalul component al unor
proteine bazice protaminele şi histonele. Întrucât în timpul creşterii organismului, biosinteza
argininei nu acoperă necesarul, el este un aminoacid semiesenţial. Datorită bazicităţii sale
mari gruparea guanidil este în stare protonată.
9. Histidina; His; H; Acid -amino--imidazolilpropionic.
Se găseşte în cantitate mare în proteina hemoglobinei, globina
(cca. 10 % procente masice). Histidina joacă un rol important în
centrul activ al multor enzime din clasa hidrolazelor (enzime care
catalizează reacţii de hidroliză). Este un aminoacid semiesenţial.
10. Acidul aspartic; Asp; D; Acidul aminosuccinic. Acidul
aspartic sau aspartatul se găseşte în cantităţi apreciabile în
structura albuminei şi globulinelor sanguine, dar şi în proteinele
vegetale. Este un aminoacid neesenţial pe care organismul îl
foloseşte în ureogeneză şi în sinteza bazelor pirimidinice. Aspartatul este un neurotransmiţător
excitator. Datorită acidităţii grupării carboxil a radicalului, la pH fiziologic această grupare
este ionizată, ceea ce conferă radicalului sarcina q = -1. Din acest motiv cel mai frecvent se
5
H C
NH3+
COO-
CH2 CH 2 CH2 NH CNH2
+
NH2
H C
NH3+
COO-
CH2
N
N
H
H C
NH3+
COO-
CH2 CO
O-
foloseşte denumirea de aspartat şi nu de acid aspartic indiferent dacă aminoacidul este liber
sau legat într-o catenă polipeptidică.
11. Acidul glutamic; Glu; E; Acid -amino-glutaric.
Acidul glutamic sau glutamatul se găseşte în numeroase
proteine vegetale şi animale cum ar fi gliadina din grâu şi
cazeina. El este un aminoacid neesenţial care ocupă o poziţie
centrală în metabolismul aminoacizilor. Este un neurotransmiţător excitator. Ca şi la aspartat
datorită acidităţii grupării carboxil a radicalului, la pH fiziologic radicalul are sarcina q = -l.
De aceea denumirea mai frecvent folosită este aceea de glutamat.
Aminoacizi necodificaţi genetic, care intră în structura unor proteine.
Codul genetic este identic pentru aproape toate formele de viaţă cunoscute, el conţine numai
cei 20 de aminoacizi "standard" . Cu toate acestea există în plus mai mulţi aminoacizi care se
întâlnesc în componenţa unor proteine ai căror radicali apar ca urmare a unor modificări
chimice pe care le suferă radicalii aminoacizilor standard după ce catena polipeptidică a fost
sintetizată. Aceste modificări fac parte dintr-un proces mai amplu numit procesare post-
translaţională a catenelor polipeptidice native.
Hidroxiprolina şi hidroxilizina sunt constituenţi importanţi ai
colagenului. Hidroxiprolina împreună cu prolina, reprezintă 20-25%
din totalul resturilor de aminoacizi din colagen. Hidroxiprolina se
întâlneşte şi în proteinele din smalţului, care
sunt diferite de colagen, având o structură
pliată (colagenul are o structură triplu helicală).
Hidroxilizina contribuie la maturizarea
colagenului prin formarea unor legături încrucişate între lanţurile polipeptidice ale
colagenului. De asemenea, hidroxilizina formează legături O-glicozidice cu glucidele ce fac
parte din structura colagenului de la vertebrate.
Apariţia grupărilor hidroxil legate la radicali Pro şi
Lys se datorează acţiunii catalitice a unor enzime din clasa
hidroxilazelor, care acţionează numai după constituirea
lanţului polipeptidic. Hidroxilazele, respectiv peptidil
prolin hidroxilază şi peptidil lisil hidroxilază, necesită
drept cofactori, oxigen molecular, ioni de fer 2+, -
cetoglutarat şi nu în ultimul rând acid ascorbic.
6
H C
NH3+
COO-
CH2 CO
O-CH2
H2
H2
H
C
CCC
N
-OOC
H
1
23 4
5
H
OH
H C
NH3+
COO-1
2 3 4 5 6CH2 CH2CH2 CH NH3+
OH
NH2
CH2
CH
H2NCH
COOH
O
CH2
CH2
o
CH2OH
o
CH2OHHO
HH
HH
OHH
OH
H
HHH
HOOH
OH
N-formilmetionina este capătul N-terminal al tuturor proteinelor organismelor
procariote care, este îndepărtat în cursul maturizării lor.
Acidul -carboxiglutamic se asociază cu ionul de Ca2+ ceea ce conferă proteinelor din
care acest aminoacid face parte, o afinitate crescută pentru acest ion. Mai multe proteine
implicate în coagularea sângelui prezintă această proprietate,
ionul Ca2+ fiind un important factor al coagulării.
Aminoacizi necodificaţi genetic, care nu intră
în structura proteinelor.
Aceşti aminoacizi, ca şi cei menţionaţi anterior nu sunt codificaţi din punct de vedere genetic
dar, spre deosebire de aceia, nu apar în structura proteinelor.
-Alanina intră în compoziţia acidului pantotenic, compus
din grupa vitaminelor B.
Acidul aminobutiric (GABA), este un
neurotransmiţător inhibitor.
Homoserina, omolog superior al serinei, este intermediar
în biosinteza unor aminoacizi.
Homocisteina, omolog superior al cisteinei, este intermediar al
metabolismului aminoacizilor cu sulf.
Ornitina este intermediar al ureogenezei.
Acidul p-aminobenzoic (PABA) intră în compoziţia acidu1ui folic, esterii săi fiind
folosiţi ca anestezici locali (procaina, novocaina).
3, 5, 3', 5' - Tetraiodotironina (tiroxina) este hormon tiroidian.
7
H C
NH3+
COO-
CH2 CHCOO-
COO-
H C
COO-
CH2 NH3+
O CH2 CH
COO-
NH3+
HOI I
I I
COO-
CH2 CH2CH2NH3
+
H C
NH3+
COO-
CH2 CH2 SH
H C
NH3+
COO-
CH2 CH2
OH
H C
NH3+
COO-
CH2 CH2CH2 NH3+
Proprietăţile aminoacizilor
Stereoizomeria şi proprietăţile optice.
Datorită faptului că, cu excepţia glicinei, la toţi
aminoacizii atomul C este asimetric, ei sunt optic
activi. Un atom de carbon asimetric se mai numeşte
centru chiral.
Când un fascicul de lumină monocromatic plan-
polarizată străbate un strat, cu grosimea de 1 dm de soluţie a unui compus optic activ, de
concentraţie c (g/ml), planul de polarizare al luminii se roteşte cu unghiul (rad). Acest unghi
mai depinde de lungimea de undă a radiaţiei luminoase, temperatură şi solventul soluţiei. O
măsură cantitativă a activităţii optice este rotaţia specifică. Măsurarea unghiurilor de rotaţie
optic se face cu polarimetrul, scopul fiind de obicei determinarea concentraţiei, compusului
optic activ din soluţie.
Unul din neajunsurile sistemului de clasificare în
izomeri optici este acela că el nu furnizează nici o indicaţie
privind configuraţia absolută, adică poziţia substituenţilor
în jurul centrului chiral. Convenţia Fischer este un criteriu
sistematic de clasificare care foloseşte ca structură de bază
glicerinaldehida, cea mai simplă monozaharidă cu un atom
de carbon asimetric. Conform acestei convenţiei, enantiomerii levogir (-) şi dextrogir (+) ai
glicerinaldehidei sunt notaţi cu simbolurile L şi respectiv D. După regulile Fischer legăturile
chimice trasate vertical sunt dirijate în spatele planului paginii iar cele orizontale sunt dirijate
deasupra acestui plan. Probabilitatea ca formulele lui Fischer să fie corecte a fost de 50 %. În
1949, cu ajutorul tehnicilor cristalografice de raze X, s-a văzut că, alegerea lui Fischer a fost
corectă, adică stereoizomerul L al glicerinaldehidei coincide cu enantiomerul levogir al ei şi,
în consecinţă, D coincide cu cel dextrogir.
La aminoacizi, pentru stabilirea configuraţiilor acestora, se ţine cont de următoarea
secvenţă de citire a substituenţilor legaţi la C şi anume: NH2, COOH, R. Dacă molecula de
aminoacid este aşezată în aşa fel încât atomul de hidrogen să fie diametral opus ochiului, iar
secvenţa sus menţionată de derulează în sens antiorar, aminoacidul face parte din seria L şi
invers.
Toţi aminoacizii rezultaţi prin hidroliza blândă a proteinelor au configuraţia
stereochimică L. Există organisme, în special bacteriile, care au în conţinutul proteinelor
proprii, D-aminoacizi. Acestea sunt constituente ale biomoleculelor din pereţilor celulelor
8
HO
CHO
HC
CH2OH
CHO
H C
CH2OH
OH
L D
bacteriene. Probabil că prezenţa lor acolo conferă anumită rezistenţă acestor pereţi faţă de
atacul peptidazelor, enzime care catalizează hidroliza legăturilor peptidice, pe care mai multe
organisme le utilizează pentru a digera aceşti pereţi. D-aminoacizi se găsesc şi în structura
antibioticelor valinomicina, actinomicina D şi gramicidina S.
Spre deosebire de enantiomeri care diferă doar prin sensul de rotaţie a planului luminii
polarizate, diastereoizomerii sunt diferiţi între ei prin numeroase proprietăţi fizice şi chimice:
punct de topire, spectru, reactivitate chimică. Prin urmare ei sunt compuşi diferiţi în sens
uzual. Acest lucru este explicabil deoarece la enantiomeri grupările care compun molecula au
aceleaşi poziţii relative, aşa că un reactant vine în contact cu aceleaşi grupări. Dimpotrivă, la
diastereoizomeri poziţiile reciproce ale grupărilor sunt diferite.
În pofida utilităţii sale practice, convenţia Fischer este uneori ambiguă, în special când
se aplică moleculelor cu mai mulţi atomi de carbon asimetrici. Din acest motiv Robert Cahn,
Christopher Ingold şi Vladimir Prelog au formulat în 1956, sistemul RS care permite
descrierea precisă a acestor molecule. În acest sistem cei patru substituenţi legaţi la centrul de
asimetrie sunt ierarhizaţi într-o ordine de prioritate. La baza ei stă regula după care atomul cu
număr atomic mai mare are prioritate faţă de cel cu număr atomic mai mic. Dacă substituenţii
se leagă, la centrul chiral prin atomii aceluiaşi element, prioritatea lor este stabilită de
numerele atomice ale celorlalţi atomi din componenţă.
Pentru a stabili configuraţia în sistem (RS) a unui centru chiral, se priveşte molecula
dinspre centru spre substituentul cu prioritatea cea mai mică. Presupunem că ceilalţi 3
substituenţi au ordinea de prioritate W>X>Y. Dacă citirea în această ordine a lor se face în
sensul orar, configuraţia centrului chiral se notează cu (R). Litera provine din cuvântul latin
rectus. Dacă citirea se face in sens antiorar, notarea se face cu (S) de la sinistrus. Prin urmare
L-glicerinaldehida este (S) –glicerinaldehida. Cu excepţia L-Cys, care este (R)-Cys, toţi
aminoacizii proteinogeni monochirali sunt (S)-aminoacizi. L-Thr este (2S, 3R) - Thr iar L-Ile
este (2S, 3S)-Ile.
Reacţiile chimice de sinteză ale moleculelor chirale produc de obicei amestecuri
racemice. Una din trăsăturile lumii vii este capacitatea ei de a produce activitate optică.
Biosinteza unei substanţe chirale produce totdeauna numai unul din stereoizomeri. Faptul că
toţi aminoacizii proteinogeni au configuraţie L este o ilustrare a acestei reguli.
Proprietăţile acido-bazice.
În soluţii neutre, ca şi în stare cristalină, gruparea -aminocarboxilică din aminoacizi are
structură dipolară sau amfiionică.
9
În soluţie un acid monoamino-monocarboxilic, în funcţie de pH poate exista sub
forma a 3 specii ionice, nici una neionică:
H3N+–CH(R)–COOH - cation
H3N+–CH(R)–COO- - amfiion
H2N–CH(R)–COO- - anion
Echilibrele care se stabilesc între aceste specii ionice pot fi studiate prin următorul
experiment aplicat la glicină. Unui litru de soluţie de glicină 1M i se adaugă NaOH şi se
urmăreşte variaţia pH-ului. Se procedează la fel adăugându-se HCl, obţinându-se o curbă de
titrare. Aceiaşi curbă se obţine dacă se, titrează cu NaOH o soluţie de glicină 1M al cărui pH a
fost ajustat cu HCl în prealabil la aproximativ 1. La pH acid există un echilibru chimic între
cationii şi amfiionii moleculelor de glicină: H3N+–CH2–COOH ↔ H3N+–CH2–COO- + H+
La pH alcalin există un echilibru
chimic între amfiionii şi anionii
moleculelor de glicină:
H3N+–CH2–COO- ↔ H2N–CH2–COO- +
H+
Curba de titrare a 1 litru de
soluţie de aminoacid (glicină) 1 M cu
NaOH. Valorile înscrise pe abscisă
indică numărul de echivalenţi de bază.
În chenare apar formulele speciilor
ionice de aminoacizi. Platourile din
jurul valorilor pH = pK1' şi pH = pK2'
sunt intervale de pH în care soluţia de
glicină are capacitate de tamponare.
Constanta de aciditate clasică a cationului este dată de relaţia:
Constanta de aciditate clasică a amfiionului este dată de relaţia:
Logaritmând această expresie obţinem, în cazul echilibrului cation-amfiion:
10
În cazul echilibrului amfiion-anion obţinem:
În curba de titrare prezentă mai sus se vede că atunci când pH ≈ pK', adaosurile, de
acid sau bază modifică puţin pH-ul soluţiei de glicină. Deci soluţia de glicină are capacităţi
maxime de tamponare la pH = 2,3 şi la pH = 9,6.
pH-ul izoelectric pI este pH-ul la care numărul sarcinilor pozitivecareciate la
moleculele de aminoacizi este egal cu numărul sarcinilor negative. La pH izoelectric acizii
monoamino-monocarboxilici se găsesc numai sub formă de amfiioni. În consecinţă ei nu
migrează în câmp electric, proprietate folosită pentru separarea lor. La pI solubilitatea acestor
aminoacizi este minimă, deoarece amfiionii se atrag puternic între ei. pI-ul se poate calcula
pentru aminoacizii monoaminomonocarboxilici, ca fiind egală cu semisuma valorilor pK’.
Deci sarcina electrică pe care o poartă fiecare dintre aminoacizi depinde de pH-ul
soluţiei în care se găsesc. Ţinând seama că în organismele vii aminoacizii sunt cuprinşi în
lanţurile polipeptidice ale proteinelor este important de ştiut comportarea ca acizi sau baze a
resturilor de aminoacid, cât şi sarcina electrică pe care o poartă aceste resturi la pH-ul
fiziologic. Resturile aspartil şi glutamil au în aceste condiţii o sarcină netă (–) pe când
resturile lizil, arginil şi histidil au sarcină (+).
Proprietăţi chimice ale aminoacizilor
Reacţiile grupării carboxil
Gruparea carboxil se poate transforma în derivaţii ei obişnuiţi: esteri, amide, nitrili,
halogenuri acide, anhidride. O reacţie importantă este decarboxilarea cu producerea de
compuşi numiţi amine biogene:
H2N–CH(R)–COOH → R–CH2–NH2 + CO2
Majoritatea aminelor biogene rezultate au importanţă biologică deosebită. Acidul
glutamic se transformă în GABA (neurotransmiţător), histidina în histamină (hormon tisular
cu puternice efecte asupra aparatelor circulator şi digestiv), serina în etanol amină (component
important al lipidelor), lizina în cadaverină (precursor al poliaminelor, care se asociază cu
AND şi ARN), cisteina în cisteamină (componentă a coenzimei A). Alte exemple vor fi date
la capitolul "Metabolismul aminoacizilor".
11
COOH
C
S
NH2
H CH2 SH
COOH
C
NH2
+ HCH2HS
1/2O2H2O
CH2 H
NH2
CCH2H C
COOH
S
COOHNH2 cistinã
Reacţiile specifice radicalilor
- oxidarea blândă a cisteinei conduce la cistină
- oxidarea energică a cisteinei produce acid cisteic
iar decarboxilarea acestuia din urmă produce taurină,
compus ce intră în structura sărurilor biliare primare.
HOOC–CH(NH2)–CH2–SH→
→HOOC–CH(NH2)–CH2–SO3H
HOOC–CH(NH2)–CH2–SO3H→
→NH2–CH2–CH2–SO3H+CO2
- prin fosforilarea serinei se obţine acid serin-fosforic.
Reacţiile grupării amino
- condensarea cu formaldehida produce baze Schiff:
H2N-CH(R)-COOH + CH2O →
→CH2 = N-CH(R)-COOH + H2O
Pe această reacţie se bazează metoda Sörensen de
determinare cantitativă a grupărilor carboxil din
aminoacizi: baza Schiff rezultată poate fi titrată ca un
acid carboxilic cu NaOH.
- alchilarea cu agenţi de metilare. Monometilarea
glicinei produce sarcozina, CH3–NH–CH2–COOH.
Metilarea până la săruri cuaternare de amoniu produce
betaine, HOOC–CH(R)–N+(CH3)3. Betaina glicinei
este foarte răspândită în plante, în special în sfeclă
(Beta vulgaris). Betaina prolinei (stahidrina) a fost
izolată din planta numită popular vindecea sau iarbă de
răni (Betonica oficinalis).
-acilarea cu cloruri acide, anhidride sau clorocarbonaţi de alchil serveşte la protejarea grupării
amino de acţiunea altor reactanţi. Protejarea cu clorocarbonat de terţ-butil numit şi t-butil
oxicarbonil (t-BOC) se practică în cursul sintezei în fază solidă a polipeptidelor.
(CH3)3C-OCO–Cl + H2N-CH(R)-COOH → (CH3)3C-OCONH-CH(R)-COOH + HCl
Un grup special de reacţii ale grupării -amino îl constituie derivatizările
aminoacizilor în scopul determinării calitative şi cantitative.
a) Reacţia cu ninhidrină.
12
O
OHOH
O
H3N+ C
R
H
COO-
O CH
R
O
N
O-
O
O
NH3
O
OH
O
H
Ninhidrinã
Purpura de Ruhemann
+
+ CO2
Hidrindantinã
+
H2O
+Ninhidrinã
aminoacid t-BOC-protejat
În urma reacţiei ninhidrinei cu un aminoacid rezultă, un compus colorat, de culoare
albastru-violet, purpura de Ruhemann. Reacţia ninhidrinei cu prolina produce un compus de
culoare galbenă.
b) Reacţia cu 2,4-dinitrofluorbenzen.
Numit şi reactiv Sanger, acesta a servit pentru prima determinare a ordinii de legare a
aminoacizilor într-o polipeptidă, insulina (Frederick Sanger, 1953). Reacţia are loc în mediu
slab alcalin conform ecuaţiei:
C6H3(NO2)2F + H2N-CH(R)-COOH → C6H3 (NO2)2NH-CH(R)COOH + HF
c) Reacţia cu clorura de dansyl.
Clorura de dimetilaminonaftil sulfonil
(dansyl) a înlocuit reactivul Sanger în analiza
polipeptidelor şi aminoacizilor întrucât derivaţii
rezultaţi prezintă o fluorescenţă intensă. Un reactiv
cu structură asemănătoare dansylului este clorura
de dabsyl (dimetilaminoazobenzen sulfonil).
Acesta produce cu aminoacizii derivaţi care absorb
şi lumina vizibilă.
d) Reacţia cu fenilizotiocianat (PITC).
Numit şi reactivul Edman, PITC este cel
mai folosit reactant pentru analiza proteinelor (Pehr
Edman, 1975). Prin derivatizarea aminoacizilor cu
PITC rezultă derivaţi de feniltiohidantoină care
absorb lumină ultravioletă.
3 PEPTIDELE
O peptidă este formată din 2-10 resturi de aminoacid. Polipeptidele conţin 11-100
resturi iar peste acest număr vorbim de proteine. Caracteristica pentru peptide este gruparea
peptidică – CO – NH – . Există peptide care au în schelet nu numai C ci şi C, ele nu rezultă
prin hidroliza parţială a unei proteine
3.1 Exemple de peptide
Glutationul Glu−Cys−Gly are proprietăţi
redox datorită grupării tiolice. Glutationul oxidat este
13
S
CC
NC
H
N C S + H2N CH C OH
R1O
OH-
CH C OH
R1O
NH C NH
S
N
CC
NC
H
R1 O
NH
R1 OH+
H
S
Fenilizotiocianat
Derivat de feniltiohidantoinã
O
C
CH2
H
NH3+
COO-
N
CH2
CH
CH2
SH
C
O
N
H
CH2CH2CH2
COO-
CH
format din două molecule de glutation unite printr-o punte disulfurică. Reacţia este catalizată
de enzima glutation reductază.
Carnozina este un alt exemplu de peptid format din −Ala şi His. Carnozina a fost
izolată din ţesutul muscular al mamiferelor. Ea este hidrolizată, de către carnozinază, enzimă
izolată din ficatul şi rinichiul mamiferelor.
Hormonul de eliberare a tireotropinei (THR) − Acid piroglutamic–His–
prolinamidă. Este un hormon eliberat de hipotalamus şi stimulează secreţia tireotropinei
(TSH), care la rândul lui acţionează asupra tiroidei care va secreta hormonii tiroidieni. THR
este folosit în clinica medicală cu rezultate bune pentru diagnosticarea timpurie a stărilor de
premixoedem, în tiroiditele cronice.
Peptide antibiotice secretate de
fungi conţin frecvent aminoacizi din
seria D (gramicidinele, bacitracinele,
valinomicina, alameticina, etc.).
Valinomicina este un decapeptid ciclic
care complexează specific ionul K+
învelindu-l ca pe o anvelopă hidrofobă
solubilizându-l în mediu lipidic al
membranelor transportându-l prin
membrană.
Ocitocina este un nanopeptid care conţine o legătură
disulfurică intracatenară, între doi radicali Cys pe care îi conţine.
Stimulează contracţia musculaturii netede uterine şi nu numai.
Vasopresina are efect hipertensiv este tot un nanopeptid
diferă de ocitocină prin două resturi de aminoacid.
Insulina este formată din două catene: A 21 de resturi şi B
30 de resturi legate prin intermediul a două punţi disulfurice.
Glucagon, care este un polipeptid format din 29 de resturi,
alături de insulină participă la homeostazia glicemiei.
14
Cys
Tyr
Phe
Gln
Pro
Arg
Gly
NH2
Asn
Cys
S
SS
S
Cys
Asn
NH2
Gly
Pro
Gln
Tyr
Cys
Ile
Leu
Ocitocina Vasopresina
Fig.2.1. Valinomicina
Hormonul adrenocorticotrop (ACTH) este un lanţ de 39 resturi de aminoacizi, este
secretat de hipofiza anterioară şi intensifică sinteza hormo-nilor steroizi în corticosuprarenale.
Angiotensina II
Asp−Arg−Val−Tyr−Ile−His−Pro−Phe,
are un puternic efect hipertensiv. Ea se
sintetizează prin clivajul
angiotensinogenului, care este o
globulină produsă de ficat.
Encefalinele sunt peptide
sintetizate de sistemul nervos central.
Induc analgezia când se cuplează cu
receptorii specifici de pe membrana
celulelor nervoase (Tyr−Gly−Gly−
Phe−Met).
Somatostatina, polipeptid format
din 14 resturi de aminoacid, este sintetizat de hipotalamus şi pancreas, inhibă hormonul de
creştere, somatotropina.
3.2 Proprietăţile peptidelor
Peptidele scurte au activitate optică aditivă. În ceea ce priveşte valoarea constantelor
de aciditate diferă de constatele grupărilor funcţionale ale aminoacizilor liberi având în vedere
distanţa dintre grupările NH2 şi COOH, deci nu vor interacţiona. Curba de titrare a peptidelor
fără radicali acido-bazici arată ca şi curba de titrare a unui aminoacid.
Proprietăţile chimice sunt aceleaşi cu ale aminoacizilor. Reacţia cu ninhidrină duce la
formarea de compuşi fotometrabili. O reacţie specifică peptidelor şi proteinelor este reacţia
biuretului. Biuretul (H2N−CO−NH−CO−NH2) formează cu ionii de Cu2+ un complex de
culoare violetă. Ionii de Cu2+ formează cu peptidele dar şi cu proteinele complecşi de acelaşi
tip, fotometrabili. Gruparea peptidică are capacitatea de a absorbi radiaţia UV < 210 nm,
proprietate ce stă la baza dozării spectrofotometrice a peptidelor şi proteinelor.
15
Fig.2.2. Transformarea preproinsulinei în insulină