Seminar IDimensiuni şi numere în biologia

structurală

BIOINFORMATICĂ APLICATĂ ÎN BIOLOGIA STRUCTURALĂ

Niveluri de observare şi unităţi de măsură

Observaţiile în biologie pot fi la nivel:

Obiecte, fenomene observabile cu ochiul

liber

Metrul – m dm (10-1), cm (10-2), mm (10-3)

Microscopic Molecular AtomicMacroscopicObiecte, fenomene

observabile cu ajutorul microscopului (optic

sau electronic)

Micronul – µm 10-6 m

Microscop electronicCristalografie raze X

Rezonanta magnetica nucleară

Nanometrul – nm 10-9 mAngstrom-ul – Å - 10-10 m

Biologia celulară Biologia moleculară Chimia, Biochimia

Angstrom-ul – Å - 10-10 m Picometrul – pm 10-12 m

Microscop quanticModelare

Dimensiunea celulelorl Observabile în domeniul microscopic (microni)l Dimensiuni variate, functie de tip (procariot, eucariot) şi rol (neuroni – peste 1 m lungime)

Tip celula Bacterie Celula vegetală Celulă animală

Diametru (µm) 1 10-100 20

Lungime (µm) 2 - -

Volum (µm-3) 0.5-5 - 2000

Greutate (fg) 0.95 - -

http://learn.genetics.utah.edu/content/cells/scale/

Drojdie

Hematie

Rapoarte dimensionale între organitele celulare

Dimensiuni (µm) Scala Umana (m)

Celula 30 1800

Nucleul 2.5 150

Mitocondria 6 x 1 360 x 60

Cloroplast 5 x 2 300 x 120

Vacuola Variaza (15 x 20) 900 x 1200

Ribozom / om 0.025 1.5

Membrana celulară

0.01 0.6

Peretele celular 0.07 4.2

Dimensiuni medii(nm)

Scala Umana (m)

H2O 0.28 0.21

Glucoza (liniară) 1.5 1.125

DNA (diametru/grosime) 2.04 1.53

Proteina (medie) / om 2 1,5

Ribozom 21 15.75

Membrana celulară (grosime)

10 7.5

Peretele celular (grosime) 70 52.5

Mitocondria 500 375

Celula 30000 22500

Rapoarte dimensionale între molecule