PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com -...

35

Transcript of PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com -...

Page 1: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

PARTEA IPARTEA I

BIOFIZICA MOLECULARĂBIOFIZICA MOLECULARĂ

2

CURSUL 1CURSUL 1

SistemeSisteme de de unităţiunităţi de de măsurămăsură AtomiAtomiţţşişi molecule molecule

UNITĂŢI DE MĂSURĂ

Măsurarea mărimilor fizice

Ţ

Măsurarea mărimilor fizice

Exprimare icircn unităţile de măsură potrivite

(mărimi adimensionale)

SistemSistem InternaţionalInternaţional de de UnităţiUnităţi (SI)(SI)

(mărimi adimensionale)

(1960 a 11-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi) mărimi fundamentalemărimi fundamentale

mărimi derivate (aria volumul densitatea viteza etc)

mărimi suplimentare (unghi plan şi unghi solid)

MĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SI

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime metru mung m m ru mmasă kilogram kgtimp secundă stimp secundă s

intensitatea curentului electric

amper Aelectric

temperatură absolută Kelvin Kcantitate de substanţă mol molcantitate de substanţă mol molintensitate luminoasă candelă Cd

Unitatea de lungime Unitatea de lungime (metrul)

a 107 parte din distanţa dintre Polul Nord şi Ecuator (1792)

distanţa dintre două repere gravate icircn vecinătatea capetelor unei bare confecţionate dintr-un aliaj de platină şi p ţ j piridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi Paris)

lungimea drumului parcurs de lumină icircn vid icircn timp de g p p

1 299792458 secunde (1983)

Unitatea de masă

masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

(kilogramul)masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

normală şi temperatura de 398oC

masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale cu 39 mm confecţionat dintr-un aliaj de platină şi iridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi)ţ ş ţ

U it t s d ă ( it t t i ă d să)Unitatea secundară (unitatea atomică de masă)

a 12-a parte din masa izotopului 12C1 uam = 16605402 10ndash27 kg

7

Unitatea de timp Unitatea de timp (secunda)

Secunda este durata a 9192631770 perioade ale radiaţiei ce corespunde tranziţiei icircntre două nivele energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 (1967 a 13-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi)

8

Ordinul de mărime

810283587460328 sdot= 810

ExempleExemple

10283587460328 = 10

ExempleExemple134527 = 134527 = 0000572 = 0000572 =

Multipli submultipli

31 mm 10 mminus= 31 kg 10 g=

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 2: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

CURSUL 1CURSUL 1

SistemeSisteme de de unităţiunităţi de de măsurămăsură AtomiAtomiţţşişi molecule molecule

UNITĂŢI DE MĂSURĂ

Măsurarea mărimilor fizice

Ţ

Măsurarea mărimilor fizice

Exprimare icircn unităţile de măsură potrivite

(mărimi adimensionale)

SistemSistem InternaţionalInternaţional de de UnităţiUnităţi (SI)(SI)

(mărimi adimensionale)

(1960 a 11-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi) mărimi fundamentalemărimi fundamentale

mărimi derivate (aria volumul densitatea viteza etc)

mărimi suplimentare (unghi plan şi unghi solid)

MĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SI

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime metru mung m m ru mmasă kilogram kgtimp secundă stimp secundă s

intensitatea curentului electric

amper Aelectric

temperatură absolută Kelvin Kcantitate de substanţă mol molcantitate de substanţă mol molintensitate luminoasă candelă Cd

Unitatea de lungime Unitatea de lungime (metrul)

a 107 parte din distanţa dintre Polul Nord şi Ecuator (1792)

distanţa dintre două repere gravate icircn vecinătatea capetelor unei bare confecţionate dintr-un aliaj de platină şi p ţ j piridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi Paris)

lungimea drumului parcurs de lumină icircn vid icircn timp de g p p

1 299792458 secunde (1983)

Unitatea de masă

masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

(kilogramul)masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

normală şi temperatura de 398oC

masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale cu 39 mm confecţionat dintr-un aliaj de platină şi iridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi)ţ ş ţ

U it t s d ă ( it t t i ă d să)Unitatea secundară (unitatea atomică de masă)

a 12-a parte din masa izotopului 12C1 uam = 16605402 10ndash27 kg

7

Unitatea de timp Unitatea de timp (secunda)

Secunda este durata a 9192631770 perioade ale radiaţiei ce corespunde tranziţiei icircntre două nivele energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 (1967 a 13-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi)

8

Ordinul de mărime

810283587460328 sdot= 810

ExempleExemple

10283587460328 = 10

ExempleExemple134527 = 134527 = 0000572 = 0000572 =

Multipli submultipli

31 mm 10 mminus= 31 kg 10 g=

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 3: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

UNITĂŢI DE MĂSURĂ

Măsurarea mărimilor fizice

Ţ

Măsurarea mărimilor fizice

Exprimare icircn unităţile de măsură potrivite

(mărimi adimensionale)

SistemSistem InternaţionalInternaţional de de UnităţiUnităţi (SI)(SI)

(mărimi adimensionale)

(1960 a 11-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi) mărimi fundamentalemărimi fundamentale

mărimi derivate (aria volumul densitatea viteza etc)

mărimi suplimentare (unghi plan şi unghi solid)

MĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SI

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime metru mung m m ru mmasă kilogram kgtimp secundă stimp secundă s

intensitatea curentului electric

amper Aelectric

temperatură absolută Kelvin Kcantitate de substanţă mol molcantitate de substanţă mol molintensitate luminoasă candelă Cd

Unitatea de lungime Unitatea de lungime (metrul)

a 107 parte din distanţa dintre Polul Nord şi Ecuator (1792)

distanţa dintre două repere gravate icircn vecinătatea capetelor unei bare confecţionate dintr-un aliaj de platină şi p ţ j piridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi Paris)

lungimea drumului parcurs de lumină icircn vid icircn timp de g p p

1 299792458 secunde (1983)

Unitatea de masă

masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

(kilogramul)masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

normală şi temperatura de 398oC

masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale cu 39 mm confecţionat dintr-un aliaj de platină şi iridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi)ţ ş ţ

U it t s d ă ( it t t i ă d să)Unitatea secundară (unitatea atomică de masă)

a 12-a parte din masa izotopului 12C1 uam = 16605402 10ndash27 kg

7

Unitatea de timp Unitatea de timp (secunda)

Secunda este durata a 9192631770 perioade ale radiaţiei ce corespunde tranziţiei icircntre două nivele energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 (1967 a 13-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi)

8

Ordinul de mărime

810283587460328 sdot= 810

ExempleExemple

10283587460328 = 10

ExempleExemple134527 = 134527 = 0000572 = 0000572 =

Multipli submultipli

31 mm 10 mminus= 31 kg 10 g=

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 4: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

MĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SIMĂRIMI FUNDAMENTALE ALE SI

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime metru mung m m ru mmasă kilogram kgtimp secundă stimp secundă s

intensitatea curentului electric

amper Aelectric

temperatură absolută Kelvin Kcantitate de substanţă mol molcantitate de substanţă mol molintensitate luminoasă candelă Cd

Unitatea de lungime Unitatea de lungime (metrul)

a 107 parte din distanţa dintre Polul Nord şi Ecuator (1792)

distanţa dintre două repere gravate icircn vecinătatea capetelor unei bare confecţionate dintr-un aliaj de platină şi p ţ j piridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi Paris)

lungimea drumului parcurs de lumină icircn vid icircn timp de g p p

1 299792458 secunde (1983)

Unitatea de masă

masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

(kilogramul)masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

normală şi temperatura de 398oC

masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale cu 39 mm confecţionat dintr-un aliaj de platină şi iridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi)ţ ş ţ

U it t s d ă ( it t t i ă d să)Unitatea secundară (unitatea atomică de masă)

a 12-a parte din masa izotopului 12C1 uam = 16605402 10ndash27 kg

7

Unitatea de timp Unitatea de timp (secunda)

Secunda este durata a 9192631770 perioade ale radiaţiei ce corespunde tranziţiei icircntre două nivele energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 (1967 a 13-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi)

8

Ordinul de mărime

810283587460328 sdot= 810

ExempleExemple

10283587460328 = 10

ExempleExemple134527 = 134527 = 0000572 = 0000572 =

Multipli submultipli

31 mm 10 mminus= 31 kg 10 g=

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 5: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

Unitatea de lungime Unitatea de lungime (metrul)

a 107 parte din distanţa dintre Polul Nord şi Ecuator (1792)

distanţa dintre două repere gravate icircn vecinătatea capetelor unei bare confecţionate dintr-un aliaj de platină şi p ţ j piridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi Paris)

lungimea drumului parcurs de lumină icircn vid icircn timp de g p p

1 299792458 secunde (1983)

Unitatea de masă

masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

(kilogramul)masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

normală şi temperatura de 398oC

masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale cu 39 mm confecţionat dintr-un aliaj de platină şi iridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi)ţ ş ţ

U it t s d ă ( it t t i ă d să)Unitatea secundară (unitatea atomică de masă)

a 12-a parte din masa izotopului 12C1 uam = 16605402 10ndash27 kg

7

Unitatea de timp Unitatea de timp (secunda)

Secunda este durata a 9192631770 perioade ale radiaţiei ce corespunde tranziţiei icircntre două nivele energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 (1967 a 13-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi)

8

Ordinul de mărime

810283587460328 sdot= 810

ExempleExemple

10283587460328 = 10

ExempleExemple134527 = 134527 = 0000572 = 0000572 =

Multipli submultipli

31 mm 10 mminus= 31 kg 10 g=

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 6: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

Unitatea de masă

masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

(kilogramul)masa unui litru de apă aflată la presiune atmosferică

normală şi temperatura de 398oC

masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale masa unui cilindru avacircnd icircnălţimea şi diametrul egale cu 39 mm confecţionat dintr-un aliaj de platină şi iridiu (Biroul Internaţional de Măsuri şi Greutăţi)ţ ş ţ

U it t s d ă ( it t t i ă d să)Unitatea secundară (unitatea atomică de masă)

a 12-a parte din masa izotopului 12C1 uam = 16605402 10ndash27 kg

7

Unitatea de timp Unitatea de timp (secunda)

Secunda este durata a 9192631770 perioade ale radiaţiei ce corespunde tranziţiei icircntre două nivele energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 (1967 a 13-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi)

8

Ordinul de mărime

810283587460328 sdot= 810

ExempleExemple

10283587460328 = 10

ExempleExemple134527 = 134527 = 0000572 = 0000572 =

Multipli submultipli

31 mm 10 mminus= 31 kg 10 g=

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 7: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

Unitatea de timp Unitatea de timp (secunda)

Secunda este durata a 9192631770 perioade ale radiaţiei ce corespunde tranziţiei icircntre două nivele energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 energetice ale stării fundamentale a atomului de Cesiu 133 (1967 a 13-a Conferinţă Generală de Măsuri şi Greutăţi)

8

Ordinul de mărime

810283587460328 sdot= 810

ExempleExemple

10283587460328 = 10

ExempleExemple134527 = 134527 = 0000572 = 0000572 =

Multipli submultipli

31 mm 10 mminus= 31 kg 10 g=

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 8: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

Ordinul de mărime

810283587460328 sdot= 810

ExempleExemple

10283587460328 = 10

ExempleExemple134527 = 134527 = 0000572 = 0000572 =

Multipli submultipli

31 mm 10 mminus= 31 kg 10 g=

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 9: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

Prefixe submultipliPrefixe submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

om10A1 10

ominus=

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 10: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

Prefixe multipliPrefixe multipli

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

11

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 11: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

Prefixe multipli submultipliPrefixe multipli submultipli

Prefix submultiplu pico nano micro mili centi deci

Simbol p n μ m c d

Factor conversie 10ndash12 10ndash9 10ndash6 10ndash3 10ndash2 10ndash1Factor conversie 10 12 10 9 10 6 10 3 10 2 10 1

Prefix multiplu deca hecto kilo mega giga tera

Simbol da h k M G TFactor conversie 101 102 103 106 109 1012Factor conversie 10 10 10 10 10 10

om10A1 10

ominus=

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 12: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

1 m = cm

1 dm = mm

1 m = 102 cm

1 dm = 102 mm

+

ndash1 μm = dm1 μm = 10ndash5 dmμ

1 mm = m

μ

1 mm = 10ndash3 mTemă prelungiti scara Temă prelungiti scara

pentru a afla o

1 A 10 cm =o

3 10 A 10 mμminus =

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 13: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

ExcepţiiExcepţii

1 min = 60 s

1 h = 60 min = 3600 s

1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s 1 zi = 24 h = 1440 min = 86400 s

Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)Sistem Tolerat de Unităţi (CGS)

Mărime fizică Unitate de măsură Simbollungime centimetru cmlungime centimetru cmmasă gram gtimp secundă s

14

timp secundă s

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 14: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

ATOMIDEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icirc e n)

STRUCTURSTRUCTURĂĂ

DEMOCRIT (Teoria atomistă a structurii materiei 460 icircen)ATOMOS = INDIVIZIBIL

STRUCTURSTRUCTURĂĂNUCLEU XAZ U238

92(999 )

PROTONI mp = 1 uam qp = + e

NOR ELECTRONIC

NEUTRONI mn = 1 uam qn = 0

NO C ON C

ELECTRONI me = 11835 uam qe = - e

15

1 uam = 166 10 -27 kg e = 16 10 -19 C

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 15: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

16

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 16: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

17

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 17: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

orbital de tip s

18

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 18: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

19

orbitali de tip p

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 19: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

orbitali d i dde tip d

20

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 20: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

21

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 21: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

MOLECULEFORŢE INTRAMOLECULAREŢ

LEGĂTURA IONICĂ

Ă Ă

LEGĂTURA COVALENTĂ

ENERGIA DE LEGĂTURĂ

|W| ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| = ENERGIA NECESARĂ RUPERII LEGĂTURII

W lt 0 ATRACŢIE

|W| uarr STABILITATEA uarr

22

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 22: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

LEGĂTURA IONICĂMECANISMMECANISM

ATRACŢIA ELECTROSTATICĂ IcircNTRE IONI

221

41

rqq

Fro

sdot=επε

EXEMPLUEXEMPLU

NaCl Na (Z = 11) 1s2 2s2 2p6 3s1

Cl (Z = 17) 1s2 2s2 2p6 3s2 3p5

ENERGIE DE LEGENERGIE DE LEGĂĂTURTURĂĂ

23

10 ndash 100 kcalmol

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 23: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

24

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 24: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

+minus⎯⎯rarr⎯ NaNa e1

minus+⎯⎯rarr⎯ ClCl e1

CARACTERISTICICARACTERISTICI

DURITATE

TEMPERATURĂ DE TOPIRE RIDICATĂ

25DISOCIERE IcircN APĂ (εr= 80)

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 25: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

LEGĂTURA COVALENTĂMECANISMMECANISM

PUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONIPUNERE IcircN COMUN DE ELECTRONITIPURITIPURI

DUPĂ DIRECŢIA DE IcircNTREPĂTRUNDEREbull LEGĂTURĂ σ 10 ndash 100 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 70 kcalmolbull LEGĂTURĂ π 30 ndash 70 kcalmol

DUPĂ SIMETRIE

o LEGĂTURĂ POLARĂ (atomi diferiţi)

Ă Ă Ă26

o LEGĂTURĂ NEPOLARĂ (atomi identici)

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 26: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

27

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 27: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

28

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 28: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

FORŢE INTERMOLECULAREŢasympd 3 ndash 4 Aring 05 ndash 10 kcalmol

DE TIP VAN DER WAALS

respingereatractie FFF +=

JONES)-(LENNARD126BAU +minus= )(126 rr

termen repulsiv

29

ptermen atractiv

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 29: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

POTENŢIALUL LENNARD-JONES

30

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 30: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

DE TIP ELECTROSTATIC

ION ION ndashndash ION ION

rqq

U 21

41

sdot=πε

ION ION ndashndash DIPOL DIPOL

Moment electric dipolarMoment electric dipolar

dq sdot=μ

31mC103336Debye1][ -30 sdotsdot==μ

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 31: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

Dipol electricDipol electric

InteracţiuneInteracţiune ion ion ndashndash dipoldipol

11 cosqU μ θ= 2 cos4

unghiul dintre si

Ur

μ r

θπε

θ

= minus sdot sdot

=

32= vectorul de poziţie al centrului dipolului faţă de ion r

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 32: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

ExempluExemplu hidratareahidratarea ionilorionilor

CifCif dd di ţidi ţi

NaNa++ ndashndash 88

CifreCifre de de coordinaţiecoordinaţie

NaNa 8 8

KK++ ndashndash 4 4

ClClndashndash ndashndash 2 2

CaCa2+2+ 101033

CaCa2+2+ ndashndash 1010

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 33: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

34

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35

Page 34: PARTEA I - MDTimisoara.weebly.com - HOMEmdtimisoara.weebly.com/uploads/4/0/2/0/4020278/bf01md_09.pdf · 2018. 10. 12. · BIOFIZICA MOLECULAR ... Microsoft PowerPoint - Bf01MD_09.ppt

DIPOL DIPOL ndashndash DIPOL DIPOL

1 )(4

13

21 θμμ

πεf

rU sdotsdot=

Exemplu legExemplu legăătura de hidrogentura de hidrogen

35