epidemiologie plante

65
Tolérance Compatibilité Sensibilité Incompatibilitate Oprire precoce a cresterii patogenului si colonizarii tesutului gazdei Compatibilitate Multiplicarea patogenului si colonizarea totala sau partiala a gazdei Arrêt Non pénétration Résistance Incompatibilité Arrêt 2, Planta gazda rezistenta Beatrice IACOMI

description

Epidemiologie

Transcript of epidemiologie plante

Page 1: epidemiologie plante

Arrêt

Non

pénétration

Tolérance Résistance

IncompatibilitéCompatibilité

Arrêt

Sensibilité

IncompatibilitateOprire precoce acresterii patogenului sicolonizarii tesutuluigazdei

CompatibilitateMultiplicarea patogenului si colonizarea totala sau partiala a gazdei

Arrêt

Non

pénétration

Tolérance Résistance

IncompatibilitéCompatibilité

Arrêt

Sensibilité

2, Planta gazda rezistenta

Beatrice IACOMI

Page 2: epidemiologie plante

Phytophthorainfestans

+-

Rezistenta non - gazda

Puccinia graminis

-+

Beatrice IACOMI

Planta gazda rezistenta

Page 3: epidemiologie plante

Planta gazda

Rezistenta plantei

Rezistenta OLIGOGENICA (verticala)

Eficacitate maxima (100%) fata de anumite rase ale patogenului

Durata limitata - aparitia de noi rase Peronospora tabacina

1960 Europa

1966 rezistenta verticala Franta

1970 rase noi

Rezistenta poligenica (orizontala)

Nespecifica – eficace pentru toate rasele patogenului

Nu are efect total – confera un anumit grad de rezistenta – soiul este atacat la un nivel tolerabil,

acceptabil economic

Beatrice IACOMI

rezistenta

Page 4: epidemiologie plante

Rezistenta

Naturala (genetica)

Pasiva (preinfectionala)

Activa (postinfectionala)

Impiedica patrunderea patogenului

Opreste dezvoltarea patogenului

patruns in planta

Beatrice IACOMI

Planta gazda rezistenta

Page 5: epidemiologie plante

Integritatea tegumentului

Grosimea cuticulei

CT

Rezistenta mecanica pasiva (preinfectionala)

Beatrice IACOMI

Prin ce structuri morfologice rezista plantele inainte de infectie?

Page 6: epidemiologie plante

Prezenta perisorilor foliari

T

Prezenta stratului de ceara pe frunze, fructe

C

Beatrice IACOMI

Rezistenta mecanica pasiva (preinfectionala)

Page 7: epidemiologie plante

Numarul, marimea si gradul de deschidere al stomatelor

S

Beatrice IACOMI

Rezistenta mecanica pasiva (preinfectionala)

Page 8: epidemiologie plante

Rezistenta fiziologica pasiva (preinfectionala)

Substante preformate (fitoanticipine)

efect fungistatic/fungicid, bacteriostatic/bactericid

Beatrice IACOMI

Prin ce mecanisme fiziologice rezista plantele inainte de infectie?

flavonoizi

Page 9: epidemiologie plante

Diallyl disulfid

fitoncide

Beatrice IACOMI

Rezistenta fiziologica pasiva (preinfectionala)

Page 10: epidemiologie plante

R

S

NOSO3

Glu

R

SH

NOSO3

RNCS

RCN + SRSCN

NH

CH2CH

OC

S

R

(I)

(II)(III)

(V)

(IV)

'

S

CH2CH2 (CH2)n CN

• protectie fata de ciuperci patogene, insecte

• proprietati anticancerigene

Beatrice IACOMI

Rezistenta fiziologica pasiva (preinfectionala)

glucozinolati - izotiocianati

Page 11: epidemiologie plante

allyl ITC

benzyl ITC

2.6

1.7

2.9

2.4

5.5

2.7

0

1

2

3

4

5

6

Al ITC Bz ITC

CI5

0 (

mM

)

20

43

8.205

5

1.1

4.9

1

4.1

1.2

0

1

2

3

4

5

6

Al ITC Bz ITC

CI5

0 (

mM

)

20

43

8.205

Mt Bz ITC

Selam A., Iacomi-Vasilescu Beatrice, Hudhomme P., P. Simoneau. 2007.

Antifungal activity of brassinin, camalexin and two isothiocyanates against the crucifer pathogens

Alternaria brassicicola and Alternaria brassicae. Plant Pathology 56: 296-301.

Beatrice IACOMI

Rezistenta fiziologica pasiva (preinfectionala)

Page 12: epidemiologie plante

Camalexin-hidrolaza

detoxificare

Rhizoctonia

solani

Pedras si al., 2004

Beatrice IACOMI

Page 13: epidemiologie plante

fitoalexine

Beatrice IACOMI

Page 14: epidemiologie plante

fitoalexine

detoxificare

fitoalexine

Paldoxin – tratamente?

Pedras si al., 2007

Potential phytoalexin detoxification inhibitors

Beatrice IACOMI

Page 15: epidemiologie plante

Rezistenta mecanica activa (postinfectionala)

Mecanisme de aparare ale plantei

strat de suber, lignina, caloza strat de abscizie gome (carbohidrati si proteine)

in spatiile intercelulare

tiloze

in xilem

Beatrice IACOMI

Ce structuri se formeaza in timpul infectiei pentru a da rezistenta plantei?

Page 16: epidemiologie plante

Producere de enzime (catalaza, oxidaza, peroxidaza) – neutralizarea toxinelor

Fitoalexine

Compusi cu masa moleculara mica, sintetizati si acumulati in plante dupa atacul patogenilor

(la 6-9 ore)

Rishitina, fituberina – cartof

Pisatina – mazare

Faseolina – fasole

Capsidiol – ardei iute

Brasinina, camalexina - crucifere

Beatrice IACOMI

Rezistenta fiziologica activa (postinfectionala)

Ce mecanisme fiziologice se activeaza in planta in timpul infectiei pentru a da rezistenta?

Page 17: epidemiologie plante

brasinina

Selam A., Iacomi-Vasilescu Beatrice, Hudhomme P., P. Simoneau. 2007. Antifungal activity of brassinin,

camalexin and two isothiocyanates against the crucifer pathogens Alternaria brassicicola and Alternaria

brassicae. Plant Pathology 56: 296-301.

Beatrice IACOMI

Efect asupra pigmentarii

sporilor

Rezistenta fiziologica activa (postinfectionala)

Page 18: epidemiologie plante

Reactia de hipersensibilitate

Beatrice IACOMI

Reactii necrogene de aparare ale plantei

Rezistenta fiziologica activa (postinfectionala)

Page 19: epidemiologie plante

Rezistenta indusa (dobandita)

Mecanisme induse

dupa preinocularea plantelor cu agenti biotici sau dupa pretratarea plantelor cu agenti

chimici/fizici/molecule naturale

Beatrice IACOMI

Putem activa in planta mecanisme de rezistenta???

Page 20: epidemiologie plante

Rezistenta de lunga durata, nespecifica (la un cerc larg de patogeni)

Systemic Aquired Resistance (SAR)

Infectie locala

necroza

SARezistenta sistemica

Exprimarea genelor PR

SA

Gene PR proteine PR

antimicrobiene – ataca peretele celular al patogenului

raspandesc “stirea” despre infectie in celulele vecine

Beatrice IACOMI

Rezistenta indusa (dobandita)

Page 21: epidemiologie plante

Messenger - Proteina Harpin

Beatrice IACOMI

Rezistenta indusa (dobandita)

Page 22: epidemiologie plante

Beatrice IACOMI

Peronospora spinaciae

Phytophthora infestans

Rezistenta indusa (dobandita)

Page 23: epidemiologie plante

SDN

Stimulateurs Defense Naturelle

Extracte vegetale

chitosan

Extracte alge

Fosfiti PK2

Acibenzolar S metil

Aminoacizi

Beatrice IACOMI

Rezistenta indusa (dobandita)

Page 24: epidemiologie plante

Potentatori: planta in stare de alerta; declanseaza primele etape ale rezistentei

induse (priming) dar reactiile de aparare ale plantei sunt activate doar in

prezenta patogenului

Elicitori: declanseaza reactii de aparare imediat dupa aplicare

Beatrice IACOMI

Rezistenta indusa (dobandita)

Page 25: epidemiologie plante

preventiv (timp de latenta 3-7 zile pana la aparitia unei rezistente complete)

Acibenzolar S metil (ASM) = benzothiadiazole (BTH)

SDN de natura sintetica

Beatrice IACOMI

Rezistenta indusa (dobandita)

Page 27: epidemiologie plante

Stifenia

1.5 kg/ha

Milsana

Reynoutria sachalinensis

Trigonella foenum graecum

Fainari, putregai cenusiu

Castraveti, tomate

Beatrice IACOMI

Rezistenta indusa (dobandita)

Page 28: epidemiologie plante

Rezistenta vaccinala (premunizare, “cross protection”)

Injectarea plantelor

Stropirea soluluiFusarium oxysporum nepatogen

Fusaclean, Biofox

Beatrice IACOMI

Rezistenta indusa (dobandita)

Page 29: epidemiologie plante

Tipul de cultura

Cultura anualaBoli foliare/fruct pomi

Boli ramuri, trunchi/pomi

E

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 30: epidemiologie plante

Varsta plantei gazda

Stadii tinere

S

Recoltare

S

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 31: epidemiologie plante

Cuantificarea atacului

"Without quantification of disease, no studies in epidemiology, noassessment of crop losses, and no plant disease surveys and theirapplications would be possible." - Jurgen Kranz

"Our ability to understand a phenomenon is proportional to our ability tomeasure it.“ Lord Kelvin

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 32: epidemiologie plante

procentul de plante sau organe atacate (n) raportat la totalul cazurilorexaminate (N)

F(%)= (n x 100) : N

n = numărul total de plante sau organe atacateN = numărul total de plante sau organe realizate

Frecvenţa atacului (F%)

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 33: epidemiologie plante

gradul în care este atacată planta sau organul supus examinării

Intensitatea atacului (I%)

I(%)= Σ(i x f): n

i = procentul de atac sau nota acordatăf = numărul de organe (plante) notate cu nota respectivăn= numărul total de (plante) organe atacate analizate

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 34: epidemiologie plante

Estimare vizuala

Directa – estimarea severitatii bolii cu valori de la 0 - 100

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 35: epidemiologie plante

Nota 0 1 2 3 4 5 6

Suprafaţa atacată (%)

0 1-3 4-10 11-25 26-50 51-75 76-100

Nota 0 1 2 3 4

Suprafaţa atacata (%)

0 25(1/4 din plantă)

50(1/2 din organele

plantei)

75(1/3)

Peste 75 (1/4)

Nota 0 1-5 2 3 4 5 6

Suprafaţa atacată

(%)

0 1-5 6-10 11-25 26-40 41-65 66-100

Scara Cobb modificata – rugini cereale

Scari de notare

Estimare vizuala2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 36: epidemiologie plante

Nota 0 1-5 2 3 4 5 6

Suprafaţa atacată

(%)

0 1-5 6-10 11-25 26-40 41-65 66-100

Scara Cobb modificata – rugini cereale

Estimare vizuala2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 37: epidemiologie plante

nota %

1 0

2 0 - 3

3 3 - 6

4 6 - 12

5 12 - 25

6 25 - 50

7 50 - 75

8 75 - 87

9 87 - 94

10 94 - 97

11 97 - 100

12 100

Horsefall-Barrat

Estimare vizuala2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 38: epidemiologie plante

Septoria glycines

Cercospora kikuchii

Estimare vizuala2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 39: epidemiologie plante

Rhizoctonia

Streptomyces

Botrytis

Estimare vizuala2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 40: epidemiologie plante

Estimare vizuala2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 41: epidemiologie plante

1 3 5 90 7

Indice de necroză Simptome

0 Lipsa simptomelor necrotice

1 Colet necrozat pe 1-2mm

3 Extinderea necrozei de o parte şi de alta a coletului

5Sistem radicular necrozat pe cel puţin 1/3 din suprafată

sauHipocotil cu necroze pe 1/3 din suprafaţă

7 Sistem radicular total necrozat şi acoperit de sporisau

Parte aeriană total necrozată şi acoperită de spori

9 Plantulă distrusă în intregime şi acoperită de spori

Alternaria brassicicola

Beatrice IACOMI

Page 42: epidemiologie plante

satelitiavionsenzori (1-2 m de plante)

In ce mod o substanta sau obiect emite, absoarbe, transmite sau reflectaradiatii electromagnetice

Remote sensing

Senzor (aparat foto, instrumente electronice)

Semnatura spectrala a specimenului

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 43: epidemiologie plante

radiatia electromagnetica emergenta a plantei, unui organ al plantei(frunza), covorului vegetal este determinata de numeroase interactiuni(reflexii, transmisii, absorbtie) intre radiatia incidenta (solara) si tesutulplantei

Se masoara (radiometre) radiatia reflectata de plantaSemnatura spectrala = radiatia reflectata / radiatia incidenta

Cuantificarea a numeroase atribute ale plantei

Semnatura spectrala

Masurarea radiatiei reflectate pe o scara continua (0-100%) pentru unobiect (planta), corelat cu % suprafetei atacate de boala

Poate fi realizata pentru diferite lungimi de unda

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 44: epidemiologie plante

Beatrice IACOMI

Page 45: epidemiologie plante

Beatrice IACOMI

Page 46: epidemiologie plante

Beatrice IACOMI

Page 47: epidemiologie plante

Focare cu putregai al radacinii – rosu, portocaliu

Phellinus weirri

Remote sensing, the key to root rot detection; Information forestry, august, 2005.

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 48: epidemiologie plante

Radiatia reflectata este inregistrata

Spectru vizibil

Imaginea este digitalizata (transformata in pixeli)

Fiecare pixel este clasificat in categorii disticte1) Planta sanatoasa, 2) planta bolnava, 3) background--->pe baza % reflexie<---

Analiza de imagini (Image Analysis)

Severitatea –Numar de "diseased pixels" / numar "diseased pixels"+"healthy pixels“ x 100(%)

Aparatura specializata, software

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 49: epidemiologie plante

WinRHIZO morfologie

(lungime, suprafata, volum), arhitectura, analiza de culoare

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 50: epidemiologie plante

WinFOLIA

Morfologia foliara Suprafete bolnave

WinSEEDLE Morfologia semintelor

Analiza bolilor

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 51: epidemiologie plante

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 52: epidemiologie plante

Measurement of leaf temperature with digital thermography for theprognosis of infection risk of pathogens

Use of Information Technologies for Precision Crop ProtectionDFG Research Training Group (Graduiertenkolleg) 722

Prognoza si/sau cuantificarea bolilor - digital infrared thermography

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 53: epidemiologie plante

Infrared-thermography, a tool for the prediction of fungal infections in wheat

The pathogenisis of the fungal pathogens Puccinia recondita causing leaf rust and Septoria tritici

imaging thermography system (Varioscan 3021, Jenoptik, Jena) ca instrument demonitorizare a conditiilor microclimatice in cultura de grau (rezolutie spatiala (320 x 240pixeli).

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 54: epidemiologie plante

gravitatea atacului în cultura respectivă

Se calculează pe baza datelor asupra frecvenţei (%) şi a intensitaţii (%):

(%) = F(%) x I(%)/100

Gradul de atac (%)

Severitatea si incidenta bolii – fenomen la nivel de populatie nu individualMedia severitatii a mai multor indivizi poate fi o prognoza pentru % de planteinfectate (incidenta)

2. Planta gazda

Beatrice IACOMI

Page 55: epidemiologie plante

Intensitatea simptomelor si randament

Modele matematice

MODEL = Simplificarea realitatii

abstractizarea unui fenomen sau proces real – evidentiaza aspecte relevante obiectivului propus

DescrieIntelegePreziceComparaRealizeaza interferatii

Beatrice IACOMI

Page 56: epidemiologie plante

Model punct critic

Model puncte multiple

Estimarea pierderilor – evaluarea intensitatii unei boli, la un stadiu determinat al culturii

Y = b1X1 + b2X2 + bnXn

Y = % pierdere randament

X1 X2 Xn = nivelul bolii la diferite momente, in cultura

Modele matematice

Beatrice IACOMI

Page 57: epidemiologie plante

Piricularioza orezului Y = 0.57X

Y = % pierdere

X = % noduri atacate la 30 zile dupa inspicare

Beatrice IACOMI

Page 58: epidemiologie plante

Fainarea orzului Y = 2.5X1/2

Y = % pierdere

X = severitatea bolii la sfarsit de inspicare (scara Zadok)

Beatrice IACOMI

Page 59: epidemiologie plante

Rugina neagra Y=5.3788 +5.5260 X2 – 0.3308 X5 + 0.5019 X7

Y = % pierdere

X2 = severitatea atacului (deschiderea ultimei frunze)

X5 = severitatea atacului pe ultima frunza (maturitate in lapte)

X7 = severitatea atacului pe ultima frunza (stadiu tulpina secundara la baza

primei frunze)

Beatrice IACOMI

Page 60: epidemiologie plante

Dupa o perioada de timp, boala care a pornit de la o singura planta infectata se va extinde infocare, cu o densitate mai ridicata a leziunilor (plantelor infectate) in centru, diminuanadu-seradial

Distributia spatiala a bolilor plantelor

Beatrice IACOMI

Page 61: epidemiologie plante

pixel negru = o planta infectataPixel galben = planta sanatoasa(400 plante/ha)

model de simulare a dinamicii spatio-temporale a epidemiilor

Puccinia striiformis

Infectie initiala Focar infectie Focar dezvoltat

Beatrice IACOMI

Page 62: epidemiologie plante

umiditatea

3. Factorii de mediu

temperatura

Stress

Cresteri noi, suculente

sporulare, patrundere, crestere…

eliberare, diseminare..

cicluri scurte

Beatrice IACOMI

Page 63: epidemiologie plante

10-110C

Infectii primare

Infectii secundare

20-25 infectii/an

Beatrice IACOMI

Germinarea oosporilor: min. 100C, prezenta apei pe suprafata solului

Infectiii primare: prezenta apei pe frunze minim 1 ora, frunze de cel putin 5 cm diametru

Infectiii secundare: 22-240 , vreme ploioasa, cer acoperit

lastarii 10 cm (frunza 5-6 cm)

precipitatii 10 mm (24-48h)

Temperatura > 100 C (dimineata devreme)

Page 64: epidemiologie plante

Practici culturale4. Factori antropici

Alegerea si pregatirea terenului

Material de inmultire

MonoculturaFertilizareIrigare

Azot – in exces

Dezvoltarea luxurianta a plantelor, pereti celulari

subtiri

Reduce continutul in fenoli, fitoalexine

Beatrice IACOMI

Page 65: epidemiologie plante

Masuri de control4. Factori antropici

Beatrice IACOMI